171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2989 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1230  putative serine protein kinase, PrkA  67.1 
 
 
690 aa  958    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2729  putative serine protein kinase, PrkA  67.1 
 
 
690 aa  958    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4656  putative serine protein kinase, PrkA  66.07 
 
 
681 aa  904    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.234719  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1821  putative serine protein kinase, PrkA  61.1 
 
 
709 aa  865    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0916843  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2210  putative serine protein kinase, PrkA  67.39 
 
 
694 aa  946    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2635  putative serine protein kinase, PrkA  67.1 
 
 
690 aa  958    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0964648  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3529  putative serine protein kinase, PrkA  68.2 
 
 
692 aa  952    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.585407  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2989  PrkA AAA domain protein  100 
 
 
681 aa  1409    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2537  putative serine protein kinase, PrkA  66.76 
 
 
690 aa  956    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.387634 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1379  putative serine protein kinase, PrkA  68.21 
 
 
692 aa  949    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4175  putative serine protein kinase, PrkA  67.1 
 
 
692 aa  930    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.170003  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0586  hypothetical protein  42.71 
 
 
631 aa  512  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0605  hypothetical protein  42.71 
 
 
631 aa  511  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0518  hypothetical protein  42.71 
 
 
631 aa  511  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0461  serine protein kinase  42.71 
 
 
631 aa  511  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0457  serine protein kinase  42.71 
 
 
631 aa  511  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0550  hypothetical protein  42.71 
 
 
631 aa  511  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0625  hypothetical protein  42.71 
 
 
631 aa  510  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4752  hypothetical protein  42.71 
 
 
631 aa  512  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000158136 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0550  hypothetical protein  42.71 
 
 
631 aa  511  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.95802e-18 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0472  putative serine protein kinase, PrkA  42.86 
 
 
631 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1372  putative serine protein kinase, PrkA  43.95 
 
 
631 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0465  putative serine protein kinase, PrkA  42.41 
 
 
631 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0507  putative serine protein kinase, PrkA  43.64 
 
 
631 aa  504  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0168662  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0510  putative serine protein kinase, PrkA  43.09 
 
 
630 aa  498  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0460  putative serine protein kinase, PrkA  42.11 
 
 
632 aa  494  9.999999999999999e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1156  putative serine protein kinase, PrkA  40.6 
 
 
631 aa  478  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2006  putative serine protein kinase, PrkA  41.04 
 
 
631 aa  473  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3006  putative serine protein kinase, PrkA  40.92 
 
 
633 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223622  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0591  putative serine protein kinase, PrkA  39.82 
 
 
631 aa  463  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377685  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3367  putative serine protein kinase, PrkA  40.49 
 
 
690 aa  464  1e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337989  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1750  putative serine protein kinase, PrkA  41.28 
 
 
690 aa  461  9.999999999999999e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2231  putative serine protein kinase, PrkA  39.97 
 
 
690 aa  456  1e-127  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.795267  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1073  putative serine protein kinase, PrkA  39.82 
 
 
626 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0412  putative serine protein kinase, PrkA  40.24 
 
 
690 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34499  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0032  putative serine protein kinase, PrkA  41.37 
 
 
691 aa  455  1.0000000000000001e-126  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0177084 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0489  putative serine protein kinase, PrkA  34.59 
 
 
644 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1205  putative serine protein kinase, PrkA  33.58 
 
 
642 aa  356  7.999999999999999e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2509  PrkA serine kinase  34.83 
 
 
643 aa  352  2e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00245056  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1541  serine protein kinase  34.68 
 
 
640 aa  348  1e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1334  serine protein kinase  34.38 
 
 
640 aa  345  1e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.175734  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3334  putative serine protein kinase, PrkA  27.82 
 
 
765 aa  220  6e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.973297  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2387  putative serine protein kinase, PrkA  28.57 
 
 
640 aa  217  5.9999999999999996e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.203213  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1693  putative serine protein kinase, PrkA  26.69 
 
 
648 aa  208  3e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2257  putative serine protein kinase, PrkA  27.66 
 
 
640 aa  208  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0112487  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2157  putative serine protein kinase, PrkA  28.86 
 
 
640 aa  207  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2005  putative Serine protein kinase, PrkA  27.5 
 
 
640 aa  207  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329127  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1232  putative Serine protein kinase, PrkA  28.48 
 
 
639 aa  206  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2704  putative serine protein kinase, PrkA  27.35 
 
 
640 aa  203  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02751  putative serine protein kinase, PrkA  27.24 
 
 
640 aa  203  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.405068  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0881  putative serine protein kinase, PrkA  25.49 
 
 
640 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1229  putative serine protein kinase, PrkA  27.54 
 
 
640 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.237097 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3056  putative serine protein kinase, PrkA  27.33 
 
 
640 aa  201  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.651845  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1625  putative serine protein kinase, PrkA  26.89 
 
 
640 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2025  protein kinase  27.05 
 
 
640 aa  201  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1691  PrkA serine kinase  27.05 
 
 
640 aa  201  5e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.01689  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0347  serine protein kinase  27.05 
 
 
640 aa  201  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117822  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1861  serine protein kinase  27.05 
 
 
640 aa  201  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1873  serine protein kinase  27.05 
 
 
640 aa  201  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0814  protein kinase  27.05 
 
 
640 aa  201  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125388  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1133  putative serine protein kinase, PrkA  28.11 
 
 
640 aa  200  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.448635  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1613  putative serine protein kinase, PrkA  28.11 
 
 
640 aa  200  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160164  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1589  putative serine protein kinase, PrkA  27.93 
 
 
640 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.563903 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2059  serine protein kinase domain-containing protein  27.33 
 
 
650 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.292149  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1221  putative serine protein kinase, PrkA  27.41 
 
 
648 aa  198  3e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.229605 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1528  putative serine protein kinase, PrkA  27.75 
 
 
640 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629451  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1510  putative serine protein kinase, PrkA  27.75 
 
 
640 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.292575  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4751  putative serine protein kinase, PrkA  28.47 
 
 
640 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.734625  normal  0.263656 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1710  putative serine protein kinase, PrkA  26.95 
 
 
640 aa  196  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376302  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2334  putative serine protein kinase, PrkA  27.18 
 
 
650 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.562553 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3779  hypothetical protein  27.08 
 
 
640 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3553  putative serine protein kinase, PrkA  26.89 
 
 
640 aa  196  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1550  putative serine protein kinase, PrkA  25.51 
 
 
753 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.15082  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1394  putative serine protein kinase, PrkA  27.22 
 
 
640 aa  195  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2910  hypothetical protein  27.67 
 
 
644 aa  196  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.82263  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2525  putative serine protein kinase, PrkA  27.67 
 
 
644 aa  196  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3904  putative serine protein kinase  27.2 
 
 
640 aa  194  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.370325 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0532  putative serine protein kinase, PrkA  25.41 
 
 
644 aa  194  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.374476 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2469  protein kinase  26.89 
 
 
640 aa  194  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2050  putative serine protein kinase, PrkA  27.35 
 
 
640 aa  194  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0157941  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1742  putative serine protein kinase, PrkA  27.35 
 
 
640 aa  194  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375663  normal  0.534175 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2020  putative serine protein kinase, PrkA  26.88 
 
 
650 aa  194  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2217  putative serine protein kinase, PrkA  26.6 
 
 
640 aa  194  5e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2316  putative serine protein kinase, PrkA  25.61 
 
 
753 aa  193  8e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2567  putative serine protein kinase, PrkA  26.2 
 
 
640 aa  192  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171643  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46870  serine protein kinase; PrkA  25.95 
 
 
640 aa  192  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0199  putative serine protein kinase, PrkA  27.65 
 
 
640 aa  192  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.392588 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0733  putative serine protein kinase, PrkA  27.69 
 
 
640 aa  191  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1027  putative serine protein kinase, PrkA  26.73 
 
 
649 aa  190  8e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00228838  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2404  putative serine protein kinase, PrkA  25.07 
 
 
753 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193917  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0176  putative serine protein kinase, PrkA  25.98 
 
 
648 aa  188  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2327  putative serine protein kinase, PrkA  25.47 
 
 
640 aa  188  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0509152  normal  0.762867 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2561  putative serine protein kinase, PrkA  27.09 
 
 
647 aa  187  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105653  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6236  putative serine protein kinase, PrkA  26.18 
 
 
648 aa  187  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.283326  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2856  hypothetical protein  26.69 
 
 
643 aa  186  8e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2725  hypothetical protein  26.69 
 
 
643 aa  186  8e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3485  hypothetical protein  25.22 
 
 
644 aa  186  9e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.780319  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3963  putative serine protein kinase, PrkA  26.91 
 
 
650 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003981  hypothetical protein  26.55 
 
 
644 aa  185  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1961  putative serine protein kinase, PrkA  26.12 
 
 
644 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.956203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>