165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3334 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2404  putative serine protein kinase, PrkA  47.35 
 
 
753 aa  641    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193917  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3334  putative serine protein kinase, PrkA  100 
 
 
765 aa  1562    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.973297  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1550  putative serine protein kinase, PrkA  47.62 
 
 
753 aa  647    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.15082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2316  putative serine protein kinase, PrkA  47.35 
 
 
753 aa  640    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2210  putative serine protein kinase, PrkA  28.92 
 
 
694 aa  236  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4175  putative serine protein kinase, PrkA  27.9 
 
 
692 aa  228  4e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.170003  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1379  putative serine protein kinase, PrkA  27.84 
 
 
692 aa  226  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3529  putative serine protein kinase, PrkA  27.74 
 
 
692 aa  225  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.585407  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2989  PrkA AAA domain protein  27.85 
 
 
681 aa  221  3.9999999999999997e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4656  putative serine protein kinase, PrkA  26.39 
 
 
681 aa  208  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.234719  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1821  putative serine protein kinase, PrkA  26.66 
 
 
709 aa  203  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0916843  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1230  putative serine protein kinase, PrkA  25.66 
 
 
690 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2729  putative serine protein kinase, PrkA  25.66 
 
 
690 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2635  putative serine protein kinase, PrkA  25.66 
 
 
690 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0964648  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2537  putative serine protein kinase, PrkA  26.91 
 
 
690 aa  195  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.387634 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1750  putative serine protein kinase, PrkA  25.11 
 
 
690 aa  159  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3367  putative serine protein kinase, PrkA  25.57 
 
 
690 aa  159  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337989  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0032  putative serine protein kinase, PrkA  26.33 
 
 
691 aa  154  5e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0177084 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2231  putative serine protein kinase, PrkA  25.41 
 
 
690 aa  151  4e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.795267  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0412  putative serine protein kinase, PrkA  25.15 
 
 
690 aa  151  4e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34499  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1541  serine protein kinase  23.1 
 
 
640 aa  111  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1334  serine protein kinase  23.1 
 
 
640 aa  111  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.175734  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0489  putative serine protein kinase, PrkA  23.86 
 
 
644 aa  109  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0507  putative serine protein kinase, PrkA  23.28 
 
 
631 aa  106  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0168662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0605  hypothetical protein  24.01 
 
 
631 aa  105  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0472  putative serine protein kinase, PrkA  25 
 
 
631 aa  105  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2006  putative serine protein kinase, PrkA  23.93 
 
 
631 aa  104  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1205  putative serine protein kinase, PrkA  22.6 
 
 
642 aa  104  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1372  putative serine protein kinase, PrkA  23.48 
 
 
631 aa  103  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0586  hypothetical protein  23.81 
 
 
631 aa  103  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0465  putative serine protein kinase, PrkA  23.81 
 
 
631 aa  103  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4752  hypothetical protein  23.81 
 
 
631 aa  103  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000158136 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0518  hypothetical protein  23.81 
 
 
631 aa  103  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0461  serine protein kinase  23.81 
 
 
631 aa  103  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0457  serine protein kinase  23.81 
 
 
631 aa  103  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0550  hypothetical protein  23.81 
 
 
631 aa  103  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0550  hypothetical protein  23.81 
 
 
631 aa  103  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.95802e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0625  hypothetical protein  23.94 
 
 
631 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0460  putative serine protein kinase, PrkA  22.89 
 
 
632 aa  98.6  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2509  PrkA serine kinase  24.28 
 
 
643 aa  97.4  9e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00245056  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0510  putative serine protein kinase, PrkA  23.8 
 
 
630 aa  95.9  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1156  putative serine protein kinase, PrkA  22.58 
 
 
631 aa  92.4  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3056  putative serine protein kinase, PrkA  21.71 
 
 
640 aa  89.4  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.651845  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4017  putative serine protein kinase, PrkA  23.81 
 
 
640 aa  88.2  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46870  serine protein kinase; PrkA  23.37 
 
 
640 aa  87.8  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1073  putative serine protein kinase, PrkA  24.13 
 
 
626 aa  87  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0547  hypothetical protein  23.31 
 
 
640 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4631  PrkA serine kinase  23.06 
 
 
640 aa  84.7  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0591  putative serine protein kinase, PrkA  24.7 
 
 
631 aa  84.7  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377685  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2704  putative serine protein kinase, PrkA  22.59 
 
 
640 aa  84.3  0.000000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0881  putative serine protein kinase, PrkA  24.28 
 
 
640 aa  83.6  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2208  putative PrkA serine protein kinase  24.32 
 
 
644 aa  83.6  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0189439  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0428  putative serine protein kinase, PrkA  24.21 
 
 
640 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0371656  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1710  putative serine protein kinase, PrkA  23.41 
 
 
640 aa  83.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376302  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4805  putative serine protein kinase, PrkA  24.21 
 
 
640 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.900431  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0397  putative serine protein kinase, PrkA  24.21 
 
 
640 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2856  hypothetical protein  22.81 
 
 
643 aa  82.8  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2725  hypothetical protein  22.81 
 
 
643 aa  82.8  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2157  putative serine protein kinase, PrkA  23.43 
 
 
640 aa  82.8  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0431  putative serine protein kinase, PrkA  24.21 
 
 
640 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.219182  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3006  putative serine protein kinase, PrkA  22.52 
 
 
633 aa  83.2  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223622  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01541  hypothetical protein  22.1 
 
 
644 aa  82.8  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3904  putative serine protein kinase  24.59 
 
 
640 aa  82  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.370325 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07680  hypothetical protein  23.87 
 
 
640 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.115546 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3553  putative serine protein kinase, PrkA  24.93 
 
 
640 aa  81.6  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0731  hypothetical protein  23.87 
 
 
640 aa  81.6  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2327  putative serine protein kinase, PrkA  24.32 
 
 
640 aa  81.6  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0509152  normal  0.762867 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1232  putative Serine protein kinase, PrkA  24.57 
 
 
639 aa  80.9  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2232  putative serine protein kinase, PrkA  22.65 
 
 
760 aa  80.9  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.798823 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1229  putative serine protein kinase, PrkA  24.03 
 
 
640 aa  80.9  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.237097 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1394  putative serine protein kinase, PrkA  22.68 
 
 
640 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003981  hypothetical protein  21.56 
 
 
644 aa  80.5  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1463  hypothetical protein  22.91 
 
 
644 aa  80.1  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1742  putative serine protein kinase, PrkA  24.65 
 
 
640 aa  79.7  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375663  normal  0.534175 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2050  putative serine protein kinase, PrkA  24.65 
 
 
640 aa  79.7  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0157941  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02751  putative serine protein kinase, PrkA  24.34 
 
 
640 aa  79.7  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.405068  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2567  putative serine protein kinase, PrkA  23.16 
 
 
640 aa  79.3  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171643  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1818  putative serine protein kinase, PrkA  24.59 
 
 
644 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0125883  normal  0.345668 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5139  putative Serine protein kinase, PrkA  23.12 
 
 
640 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0733  putative serine protein kinase, PrkA  24.36 
 
 
640 aa  79  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0199  putative serine protein kinase, PrkA  24.46 
 
 
640 aa  79  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.392588 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2387  putative serine protein kinase, PrkA  23.16 
 
 
640 aa  79  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.203213  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2257  putative serine protein kinase, PrkA  25.07 
 
 
640 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0112487  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2005  putative Serine protein kinase, PrkA  25.07 
 
 
640 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329127  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1638  putative serine protein kinase, PrkA  23.51 
 
 
644 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00112496  normal  0.606435 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1781  putative serine protein kinase, PrkA  24.59 
 
 
644 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000025136  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2504  putative serine protein kinase, PrkA  24.59 
 
 
644 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000566164  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1774  putative serine protein kinase, PrkA  24.59 
 
 
644 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000263384  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2882  serine protein kinase  24.05 
 
 
644 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1646  putative serine protein kinase, PrkA  23.78 
 
 
644 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00357576  hitchhiker  0.00212574 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0532  putative serine protein kinase, PrkA  23.78 
 
 
644 aa  77.4  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.374476 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0411  putative serine protein kinase, PrkA  29.65 
 
 
774 aa  77  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.955964  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1833  putative serine protein kinase, PrkA  23.81 
 
 
644 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.593259  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1686  putative serine protein kinase, PrkA  23.18 
 
 
644 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000136909  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1921  putative serine protein kinase, PrkA  23.87 
 
 
644 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0693234  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1589  putative serine protein kinase, PrkA  23.56 
 
 
640 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.563903 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4751  putative serine protein kinase, PrkA  22.82 
 
 
640 aa  74.7  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.734625  normal  0.263656 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1133  putative serine protein kinase, PrkA  24.22 
 
 
640 aa  74.7  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.448635  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1613  putative serine protein kinase, PrkA  24.22 
 
 
640 aa  74.7  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160164  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1625  putative serine protein kinase, PrkA  23.32 
 
 
640 aa  74.7  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>