212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4248 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4248  lipid A phosphoethanolamine transferase  100 
 
 
508 aa  1038    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.973235  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3047  lipid A phosphoethanolamine transferase  58.49 
 
 
506 aa  618  1e-176  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4448  lipid A phosphoethanolamine transferase  44.2 
 
 
545 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.62439  hitchhiker  0.00124758 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0677  sulfatase  34.47 
 
 
568 aa  291  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2985  sulfatase  35.06 
 
 
544 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00955472  normal  0.0251459 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3923  hypothetical protein  35.24 
 
 
547 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107021  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4592  hypothetical protein  35.25 
 
 
545 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3156  hypothetical protein  35.61 
 
 
552 aa  280  5e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84731  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4122  sulfatase  35.39 
 
 
545 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1296  hypothetical protein  35.05 
 
 
545 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1387  phosphatidylethanolamine:Kdo2-lipid A phosphoethanolamine transferase  34.69 
 
 
549 aa  276  6e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1562  sulfatase  35.98 
 
 
558 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0048353  hitchhiker  0.00604368 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5584  hypothetical protein  37.55 
 
 
549 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1725  sulfatase, putative  34.1 
 
 
512 aa  264  3e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3323  hypothetical protein  32.9 
 
 
572 aa  263  8e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364714  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0044  conserved hypothetical protein, putative sulfatase  33.59 
 
 
510 aa  261  2e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1723  type III effector HopAH2-2  33.21 
 
 
509 aa  258  2e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1724  hypothetical protein  33.69 
 
 
552 aa  256  5e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0657943  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0024  hypothetical protein  34.36 
 
 
565 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.454428  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39020  hypothetical protein  33.39 
 
 
567 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0446171  normal  0.409491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0039  hypothetical protein  34.36 
 
 
565 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.328486  hitchhiker  0.000197782 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0039  hypothetical protein  34.36 
 
 
565 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0042  hypothetical protein  34.36 
 
 
565 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.281715 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1916  sulfatase  29.41 
 
 
545 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.725859  normal  0.322218 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2204  putative cell division protein  31.14 
 
 
545 aa  253  7e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00407882  hitchhiker  0.00021657 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0283  sulfatase, putative  33.33 
 
 
512 aa  252  1e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000583  hypothetical protein  30.8 
 
 
551 aa  251  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1318  integral membrane protein  32.2 
 
 
539 aa  250  6e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0306  sulfatase, putative  33.2 
 
 
512 aa  249  1e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0802  sulfatase  30.34 
 
 
531 aa  249  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1018  sulfatase  31.12 
 
 
544 aa  248  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.663871  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0088  type III effector HopAH2-2  32.44 
 
 
520 aa  248  2e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000528702  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2128  sulfatase  33.12 
 
 
549 aa  247  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2037  sulfatase  33.61 
 
 
518 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1810  hypothetical protein  34.65 
 
 
551 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1161  phosphatidylethanolamine:Kdo2-lipid A phosphoethanolamine transferase  31.07 
 
 
576 aa  242  9e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4555  putative cell division protein  30.09 
 
 
547 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4548  putative cell division protein  30.09 
 
 
547 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4639  putative cell division protein  30.09 
 
 
547 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.500642  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05289  lipid A phosphoethanolamine transferase  29.92 
 
 
550 aa  241  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2705  sulfatase  30.27 
 
 
557 aa  241  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2563  putative cell division protein  31.63 
 
 
545 aa  240  2.9999999999999997e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000004423  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1873  putative cell division protein  31.63 
 
 
545 aa  240  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000430233  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4639  putative cell division protein  30.09 
 
 
547 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.739605  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1764  putative cell division protein  31.63 
 
 
545 aa  240  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.95541e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1865  sulfatase  31.8 
 
 
575 aa  239  6.999999999999999e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65649 
 
 
-
 
NC_004310  BR1948  hypothetical protein  32.35 
 
 
544 aa  239  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2097  sulfatase  30.11 
 
 
541 aa  239  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1874  hypothetical protein  32.35 
 
 
544 aa  239  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2048  hypothetical protein  31.47 
 
 
541 aa  238  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0311  putative cell division protein  31.56 
 
 
547 aa  236  6e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00469316  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1048  sulfatase  30.98 
 
 
580 aa  236  6e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21210  hypothetical protein  34.66 
 
 
551 aa  236  7e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4668  putative cell division protein  30.39 
 
 
557 aa  236  8e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04472  inner membrane protein  32.16 
 
 
532 aa  236  8e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.898006  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4354  putative cell division protein  30.39 
 
 
557 aa  236  8e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03946  hypothetical protein  30.39 
 
 
547 aa  236  9e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03985  predicted metal dependent hydrolase  30.39 
 
 
547 aa  236  9e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2091  protein of unknown function DUF1705  30.24 
 
 
541 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0178711  normal  0.189898 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3878  sulfatase  30.21 
 
 
557 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3913  putative cell division protein  30.21 
 
 
547 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.482913  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5627  putative cell division protein  30.21 
 
 
547 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.53448  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2371  hypothetical protein  30.24 
 
 
541 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00897064  normal  0.689534 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1758  hypothetical protein  31.51 
 
 
538 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.534399  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2103  hypothetical protein  30.24 
 
 
541 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2254  hypothetical protein  30.24 
 
 
541 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000771345  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6033  sulfatase  30.5 
 
 
580 aa  234  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.218752 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4579  putative cell division protein  30.02 
 
 
547 aa  234  3e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.507155  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0352  membrane associated sultatease  30.41 
 
 
551 aa  233  4.0000000000000004e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.310824  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1798  putative cell division protein  30.53 
 
 
543 aa  234  4.0000000000000004e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000435221  normal  0.0343315 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2103  sulfatase  31.3 
 
 
541 aa  233  6e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.381763  normal  0.850087 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2041  hypothetical protein  29.21 
 
 
542 aa  232  9e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.017573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1871  sulfatase  31.48 
 
 
541 aa  232  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.754116  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1783  sulfatase  28.38 
 
 
552 aa  231  2e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.349972  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1454  sulfatase  30.37 
 
 
542 aa  231  3e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2228  sulfatase  30.43 
 
 
541 aa  230  5e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4015  putative cell division protein  30.2 
 
 
548 aa  229  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0471  phosphatidylethanolamine:Kdo2-lipid A phosphoethanolamine transferase  31.63 
 
 
555 aa  228  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.882488 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1228  sulfatase  31.68 
 
 
569 aa  228  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.199097  normal  0.54589 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1245  sulfatase  30.8 
 
 
572 aa  228  3e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.761831 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3478  sulfatase  29.61 
 
 
541 aa  227  4e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2532  sulfatase  29.74 
 
 
544 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.301618  normal  0.874005 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3642  sulfatase  32.16 
 
 
560 aa  227  5.0000000000000005e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.418054  normal  0.084742 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1854  inner membrane protein  29.57 
 
 
552 aa  227  5.0000000000000005e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.458981  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2717  putative sulfatase  31.67 
 
 
555 aa  226  6e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.914458  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2326  sulfatase  29.01 
 
 
547 aa  225  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.995391  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0236  sulfatase  31.36 
 
 
535 aa  225  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3835  putative cell division protein  28.17 
 
 
548 aa  226  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.830183  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1718  sulfatase  31.65 
 
 
588 aa  223  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.292423 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0341  phosphatidylethanolamine:Kdo2-lipid A phosphoethanolamine transferase  32.08 
 
 
532 aa  223  8e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3130  sulfatase  31.09 
 
 
564 aa  222  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.013055 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3435  sulfatase  31.92 
 
 
560 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1978  sulfatase  30.79 
 
 
545 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0141  hypothetical protein  28.99 
 
 
502 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3264  putative sulfatase  29.89 
 
 
556 aa  219  6e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.225612  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1167  hypothetical protein  30.27 
 
 
557 aa  217  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105391  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2213  sulfatase  30.6 
 
 
557 aa  212  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2500  hypothetical protein  29.55 
 
 
573 aa  211  3e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.549124 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2995  sulfatase  28.51 
 
 
549 aa  202  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00588254  normal  0.0336769 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2193  sulfatase  28.76 
 
 
542 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444618  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>