222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6033 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_6033  sulfatase  100 
 
 		 580 aa  1197    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.218752 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1167  hypothetical protein  53.28 
 
 		 557 aa  583  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105391  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1874  hypothetical protein  51.49 
 
 		 544 aa  565  1e-160  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1948  hypothetical protein  51.31 
 
 		 544 aa  562  1.0000000000000001e-159  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1018  sulfatase  50.66 
 
 		 544 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.663871  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3085  phosphatidylethanolamine:Kdo2-lipid A phosphoethanolamine transferase  44.89 
 
 		 549 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3812  sulfatase  44.89 
 
 		 549 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0194754  normal  0.186688 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0677  sulfatase  42.12 
 
 		 568 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3323  hypothetical protein  43.82 
 
 		 572 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364714  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4122  sulfatase  41.84 
 
 		 545 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3923  hypothetical protein  40.71 
 
 		 547 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107021  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39020  hypothetical protein  43.63 
 
 		 567 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0446171  normal  0.409491 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4592  hypothetical protein  41.09 
 
 		 545 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1296  hypothetical protein  40.82 
 
 		 545 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3156  hypothetical protein  40.22 
 
 		 552 aa  422  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2985  sulfatase  40.96 
 
 		 544 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00955472  normal  0.0251459 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1387  phosphatidylethanolamine:Kdo2-lipid A phosphoethanolamine transferase  40.81 
 
 		 549 aa  420  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2204  putative cell division protein  40 
 
 		 545 aa  420  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00407882  hitchhiker  0.00021657 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1865  sulfatase  40.75 
 
 		 575 aa  416  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65649 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2097  sulfatase  42.45 
 
 		 541 aa  413  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1810  hypothetical protein  43.14 
 
 		 551 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1562  sulfatase  40.3 
 
 		 558 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0048353  hitchhiker  0.00604368 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21210  hypothetical protein  43.77 
 
 		 551 aa  412  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2091  protein of unknown function DUF1705  40.8 
 
 		 541 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0178711  normal  0.189898 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2103  hypothetical protein  40.8 
 
 		 541 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2371  hypothetical protein  41 
 
 		 541 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00897064  normal  0.689534 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2254  hypothetical protein  40.8 
 
 		 541 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000771345  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2048  hypothetical protein  40.6 
 
 		 541 aa  402  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0024  hypothetical protein  41.52 
 
 		 565 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.454428  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0039  hypothetical protein  41.52 
 
 		 565 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2103  sulfatase  41.29 
 
 		 541 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.381763  normal  0.850087 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0042  hypothetical protein  41.52 
 
 		 565 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.281715 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0039  hypothetical protein  41.52 
 
 		 565 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.328486  hitchhiker  0.000197782 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5584  hypothetical protein  39.74 
 
 		 549 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2326  sulfatase  40.99 
 
 		 547 aa  397  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.995391  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1871  sulfatase  40.66 
 
 		 541 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.754116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3478  sulfatase  41.2 
 
 		 541 aa  397  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2228  sulfatase  41.08 
 
 		 541 aa  397  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2041  hypothetical protein  38.28 
 
 		 542 aa  398  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.017573 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1724  hypothetical protein  36.93 
 
 		 552 aa  391  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0657943  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3835  putative cell division protein  36.2 
 
 		 548 aa  391  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.830183  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2532  sulfatase  40.46 
 
 		 544 aa  392  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.301618  normal  0.874005 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4015  putative cell division protein  36.43 
 
 		 548 aa  391  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0311  putative cell division protein  38.66 
 
 		 547 aa  387  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00469316  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0471  phosphatidylethanolamine:Kdo2-lipid A phosphoethanolamine transferase  39.7 
 
 		 555 aa  386  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.882488 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1758  hypothetical protein  39.96 
 
 		 538 aa  385  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.534399  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1873  putative cell division protein  38.72 
 
 		 545 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000430233  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2563  putative cell division protein  38.72 
 
 		 545 aa  387  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000004423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1916  sulfatase  36.84 
 
 		 545 aa  385  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.725859  normal  0.322218 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1764  putative cell division protein  38.53 
 
 		 545 aa  385  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.95541e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0352  membrane associated sultatease  37.29 
 
 		 551 aa  379  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.310824  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2705  sulfatase  38.69 
 
 		 557 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1783  sulfatase  38.5 
 
 		 552 aa  382  1e-104  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.349972  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04472  inner membrane protein  39.55 
 
 		 532 aa  377  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.898006  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0802  sulfatase  38.48 
 
 		 531 aa  376  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2128  sulfatase  39.6 
 
 		 549 aa  374  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1454  sulfatase  36.62 
 
 		 542 aa  372  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1228  sulfatase  35.96 
 
 		 569 aa  370  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.199097  normal  0.54589 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1931  sulfatase  40.15 
 
 		 582 aa  370  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.514301  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1798  putative cell division protein  38.36 
 
 		 543 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000435221  normal  0.0343315 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1854  inner membrane protein  37.29 
 
 		 552 aa  368  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.458981  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05289  lipid A phosphoethanolamine transferase  39.08 
 
 		 550 aa  368  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000583  hypothetical protein  37.18 
 
 		 551 aa  365  1e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3878  sulfatase  37.36 
 
 		 557 aa  364  2e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3913  putative cell division protein  37.36 
 
 		 547 aa  364  3e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.482913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5627  putative cell division protein  37.36 
 
 		 547 aa  364  3e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.53448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4579  putative cell division protein  37.55 
 
 		 547 aa  363  4e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.507155  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03985  predicted metal dependent hydrolase  37.17 
 
 		 547 aa  363  6e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03946  hypothetical protein  37.17 
 
 		 547 aa  363  6e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4354  putative cell division protein  37.17 
 
 		 557 aa  362  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4668  putative cell division protein  37.17 
 
 		 557 aa  362  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4639  putative cell division protein  37.41 
 
 		 547 aa  362  8e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.739605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4555  putative cell division protein  37.41 
 
 		 547 aa  362  9e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4639  putative cell division protein  37.75 
 
 		 547 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.500642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4548  putative cell division protein  37.75 
 
 		 547 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0141  hypothetical protein  38.45 
 
 		 502 aa  360  3e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1978  sulfatase  37.31 
 
 		 545 aa  359  8e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3435  sulfatase  36.41 
 
 		 560 aa  349  9e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2037  sulfatase  37.33 
 
 		 518 aa  347  4e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2717  putative sulfatase  37.41 
 
 		 555 aa  345  1e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.914458  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0236  sulfatase  35.98 
 
 		 535 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3130  sulfatase  36.01 
 
 		 564 aa  343  4e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.013055 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1318  integral membrane protein  36.13 
 
 		 539 aa  343  5e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3642  sulfatase  35.9 
 
 		 560 aa  342  1e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.418054  normal  0.084742 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2995  sulfatase  38.24 
 
 		 549 aa  341  2.9999999999999998e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00588254  normal  0.0336769 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0341  phosphatidylethanolamine:Kdo2-lipid A phosphoethanolamine transferase  37.38 
 
 		 532 aa  338  1.9999999999999998e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1858  phosphatidylethanolamine:Kdo2-lipid A phosphoethanolamine transferase  40.31 
 
 		 554 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2213  sulfatase  40.47 
 
 		 557 aa  337  5e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2193  sulfatase  38.16 
 
 		 542 aa  336  5.999999999999999e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1048  sulfatase  35.53 
 
 		 580 aa  334  2e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4349  sulfatase  37.48 
 
 		 579 aa  333  4e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.398112  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3264  putative sulfatase  37.03 
 
 		 556 aa  331  2e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.225612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3282  sulfatase  37.2 
 
 		 583 aa  330  5.0000000000000004e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.100906  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1161  phosphatidylethanolamine:Kdo2-lipid A phosphoethanolamine transferase  35.37 
 
 		 576 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1718  sulfatase  36.35 
 
 		 588 aa  329  1.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292423 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2500  hypothetical protein  39.13 
 
 		 573 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.549124 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1723  type III effector HopAH2-2  36.57 
 
 		 509 aa  318  2e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1245  sulfatase  34.66 
 
 		 572 aa  315  9.999999999999999e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.761831 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1955  sulfatase  34.31 
 
 		 589 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.822176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1142  sulfatase  36.16 
 
 		 583 aa  305  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.285373  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>