170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1088 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1088  Sec-independent protein translocase, MttA/Hcf106 family  100 
 
 		 79 aa  155  2e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.502554  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1795  twin-arginine translocation protein TatA/E  58.44 
 
 		 81 aa  81.3  0.000000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0544  twin arginine-targeting protein translocase  69.81 
 
 		 73 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0291571  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1435  hypothetical protein  58.46 
 
 		 71 aa  67.8  0.00000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0191  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.85 
 
 		 62 aa  63.9  0.0000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0104423  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1310  twin arginine-targeting protein translocase  75 
 
 		 79 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1191  twin arginine-targeting protein translocase  75 
 
 		 79 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0553  twin arginine-targeting protein translocase  75 
 
 		 79 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.459235  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2323  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  61.11 
 
 		 63 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.405896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3836  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.647162 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1459  sec-independent protein translocase  54.72 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0926084  normal  0.0392107 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0040  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  53.49 
 
 		 74 aa  54.3  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.620384  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3837  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  59.46 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.669997 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1332  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  42.11 
 
 		 71 aa  53.5  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2623  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  42.11 
 
 		 71 aa  53.5  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2527  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  42.11 
 
 		 71 aa  53.5  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.190921  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1252  twin argininte translocase protein A  65 
 
 		 63 aa  52.8  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2333  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.84 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.192204  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1253  twin-arginine translocation protein TatA/E  60 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0354  twin arginine translocase protein A  39.71 
 
 		 76 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0363  twin arginine translocase protein A  39.71 
 
 		 76 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0231  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  52.08 
 
 		 81 aa  51.2  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.74798e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2671  twin arginine translocase protein A  39.71 
 
 		 76 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336217  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0436  twin arginine translocase protein A  39.71 
 
 		 76 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.510795  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0415  twin arginine translocase protein A  39.71 
 
 		 76 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00507108 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3376  twin arginine-targeting protein translocase  45.59 
 
 		 76 aa  51.6  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0852423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3795  twin arginine-targeting protein translocase  53.06 
 
 		 89 aa  51.6  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743518  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0339  twin arginine translocase protein A  42.19 
 
 		 76 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1023  twin arginine-targeting protein translocase  54.55 
 
 		 59 aa  50.8  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4202  Sec-independent protein translocase protein TatA  50 
 
 		 88 aa  50.4  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1964  twin arginine-targeting protein translocase  35.85 
 
 		 92 aa  50.8  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.485465 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2560  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44.23 
 
 		 68 aa  50.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.835870000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3554  twin arginine-targeting protein translocase  50 
 
 		 85 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0402  twin arginine-targeting protein translocase  50 
 
 		 85 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1255  twin-arginine translocation protein TatA/E  71.43 
 
 		 70 aa  50.4  0.000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4099  twin arginine-targeting protein translocase  42.03 
 
 		 78 aa  50.4  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.966415 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3534  twin arginine translocase protein A  38.24 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36939  normal  0.426161 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1094  twin arginine-targeting protein translocase  44 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3898  twin arginine-targeting protein translocase  44.44 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3093  twin arginine translocase protein A  52.78 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370382  normal  0.391884 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0503  twin arginine-targeting protein translocase  46.03 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0416  twin arginine-targeting protein translocase  44.44 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0981  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  45.28 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0428  twin arginine-targeting protein translocase  44.44 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000041421 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0442  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44.44 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3728  twin arginine-targeting protein translocase  48.21 
 
 		 85 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1204  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  43.18 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1896  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.62 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.431023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3442  twin arginine translocase protein A  50 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.385779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0524  twin arginine-targeting protein translocase  48 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.897575 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0744  twin arginine translocase protein A  41.82 
 
 		 82 aa  47.8  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0632356  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2474  twin arginine translocase protein A  50 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2519  twin arginine translocase protein A  50 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2511  twin arginine translocase protein A  50 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256791  normal  0.624979 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3100  twin arginine translocase protein A  38.24 
 
 		 73 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  34.72 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0781  twin arginine translocase protein A  41.82 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0308647 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12129  twin arginine translocase protein A  45.95 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119011  normal  0.626487 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07460  Twin-arginine translocation protein TatA/E  47.5 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0195  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.86 
 
 		 86 aa  47.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0115  twin arginine translocase protein A  41.18 
 
 		 73 aa  47.4  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2703  twin arginine translocase protein A  37.5 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3682  twin arginine translocase protein A  37.5 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.759225  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3250  twin arginine translocase protein A  37.5 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1799  twin arginine translocase protein A  37.5 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3655  twin arginine translocase protein A  37.5 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3713  twin arginine translocase protein A  37.5 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2754  twin arginine translocase protein A  37.5 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2748  twin arginine translocase protein A  39.06 
 
 		 78 aa  47  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0016  twin arginine-targeting protein translocase  42 
 
 		 85 aa  47  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1046  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  37.5 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00953669 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3237  twin arginine translocase protein A  36.23 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0116  twin arginine translocase protein A  40.62 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.51 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1671  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3980  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  28.77 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.368125  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2548  sec-independent protein translocase, protein  61.11 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0910954  normal  0.655548 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0240  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  63.89 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.443858  normal  0.816195 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0814  twin arginine translocase protein A  52.78 
 
 		 83 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.514575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4461  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  54.05 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.408951 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1005  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  37.14 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0917  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.68 
 
 		 62 aa  45.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2982  twin arginine translocase protein A  35.94 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0472  twin arginine-targeting protein translocase  51.16 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3682  twin arginine-targeting protein translocase  43.64 
 
 		 60 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000036766  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3375  twin arginine translocase protein A  38.33 
 
 		 76 aa  45.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0706  twin arginine translocase protein A  52.78 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.121051  normal  0.444547 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6972  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.04 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3549  twin arginine translocase protein A  37.5 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0475634  hitchhiker  0.000865371 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1180  twin arginine translocase protein A  50 
 
 		 82 aa  44.3  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2319  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.86 
 
 		 103 aa  44.3  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000189125  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2549  Sec-independent protein translocase TatA  58.33 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.130237  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1053  twin arginine translocase protein A  52.78 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3667  twin arginine-targeting protein translocase  44.19 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2334  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  35.8 
 
 		 94 aa  43.5  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.396798  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1972  twin arginine-targeting protein translocase  47.37 
 
 		 86 aa  43.5  0.0009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113539  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2607  twin arginine-targeting protein translocase  43.18 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181166  normal  0.0738114 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  47.06 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1725  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44.68 
 
 		 58 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3420  twin arginine-targeting protein translocase  43.14 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.984089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>