More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4918 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4918  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
316 aa  654    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1828  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.67 
 
 
306 aa  217  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0122431 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0081  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.67 
 
 
321 aa  216  5e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.384606 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2096  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  37.1 
 
 
314 aa  216  5e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.644928  hitchhiker  0.0000124933 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.82 
 
 
316 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4447  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.49 
 
 
316 aa  215  7e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.633837  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1041  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.75 
 
 
318 aa  215  8e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2127  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.61 
 
 
314 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.29 
 
 
314 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198534  normal  0.135614 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 
314 aa  214  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.467345  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.07 
 
 
312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.49 
 
 
316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1542  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.74 
 
 
335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.920861  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.79 
 
 
314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3544  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.07 
 
 
312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.92 
 
 
314 aa  211  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.118371 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.98 
 
 
337 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.51 
 
 
312 aa  210  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 
318 aa  209  5e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3150  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.24 
 
 
324 aa  208  9e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.44 
 
 
324 aa  208  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.721722  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3396  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.6 
 
 
312 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.312565 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0450  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.04 
 
 
333 aa  204  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0947626  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4753  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.05 
 
 
324 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.42 
 
 
324 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.221885  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4242  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.72 
 
 
311 aa  204  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0896711  normal  0.0692369 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0962  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.42 
 
 
324 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5688  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.41 
 
 
313 aa  202  8e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.874346 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0771  bifunctional GDP-fucose synthetase: GDP-4-dehydro-6-deoxy-D-mannose epimerase and GDP-4-dehydro-6-L-deoxygalactose reductase  36.54 
 
 
322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0933619 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2842  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 
324 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.53 
 
 
321 aa  198  9e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.757489 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.86 
 
 
345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.141904 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1313  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.24 
 
 
320 aa  196  5.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0865  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.05 
 
 
309 aa  196  6e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.043091  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11546  nucleotide-sugar epimerase epiA  36.72 
 
 
322 aa  195  7e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1084  putative GDP-fucose synthetase  37.05 
 
 
316 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37 
 
 
319 aa  194  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00831994  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4142  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.92 
 
 
313 aa  195  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.92 
 
 
312 aa  194  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.144888  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.47 
 
 
335 aa  194  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1864  GDP-L-fucose synthetase  33.85 
 
 
319 aa  193  3e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0035  GDP-fucose synthetase  33.66 
 
 
312 aa  192  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0178713 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1700  GDP-fucose synthetase NAD dependent epimerase/dehydratase  35.97 
 
 
314 aa  192  5e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231068  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2362  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.09 
 
 
313 aa  192  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000746713  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2345  GDP-L-fucose synthetase  34.62 
 
 
321 aa  192  6e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2666  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.26 
 
 
321 aa  192  6e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.350076 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1147  GDP-L-fucose synthetase  34.6 
 
 
322 aa  191  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4620  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.6 
 
 
312 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000717233 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.77 
 
 
308 aa  190  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00578096  normal  0.490082 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3371  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.97 
 
 
326 aa  190  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4219  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.77 
 
 
309 aa  191  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13691  putative fucose synthetase  31.03 
 
 
332 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1010  GDP-L-fucose synthetase  34.29 
 
 
321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2987  GDP-L-fucose synthetase  34.29 
 
 
321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.54 
 
 
313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.235303  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01958  bifunctional GDP-fucose synthetase: GDP-4-dehydro-6-deoxy-D-mannose epimerase/ GDP-4-dehydro-6-L-deoxygalactose reductase  33.97 
 
 
321 aa  189  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.881949  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1605  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.97 
 
 
321 aa  189  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.171954  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01947  hypothetical protein  33.97 
 
 
321 aa  189  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.2 
 
 
356 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.435131  normal  0.526104 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1775  GDP-L-fucose synthetase  37.34 
 
 
327 aa  189  5e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2350  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.12 
 
 
312 aa  189  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2116  putative nucleotide di-P-sugar epimerase or dehydratase  33.55 
 
 
319 aa  189  5e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.987047 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1253  GDP-L-fucose synthetase  33.23 
 
 
321 aa  189  5e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000974466  hitchhiker  0.000000000000993367 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3182  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 
321 aa  189  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.092333  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3040  GDP-L-fucose synthetase  33.23 
 
 
321 aa  189  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0060  GDP-fucose synthetase  33.67 
 
 
308 aa  189  7e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.396896  normal  0.0281476 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0624  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.12 
 
 
308 aa  189  8e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1091  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.98 
 
 
309 aa  188  9e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0822  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.85 
 
 
319 aa  188  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2730  GDP-L-fucose synthetase  35.91 
 
 
326 aa  188  9e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1234  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.76 
 
 
310 aa  188  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0254  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.3 
 
 
329 aa  188  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.29 
 
 
322 aa  188  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3191  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
324 aa  188  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26933  normal  0.010449 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5160  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.69 
 
 
312 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195142  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1180  GDP-L-fucose synthetase  33.97 
 
 
321 aa  187  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3862  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  34.2 
 
 
319 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2967  GDP-L-fucose synthetase  35.26 
 
 
321 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000296227 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1589  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.97 
 
 
321 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2470  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.18 
 
 
331 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.482517 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
323 aa  186  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.429243  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35 
 
 
306 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.881493 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2233  GDP-L-fucose synthetase  34.94 
 
 
321 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.487603  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14001  putative fucose synthetase  31.23 
 
 
322 aa  186  6e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.881279  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.89 
 
 
320 aa  185  8e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.38 
 
 
326 aa  185  9e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00285763  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0418  fucose synthetase family protein  35.2 
 
 
326 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0709177  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2448  GDP-L-fucose synthetase  34.08 
 
 
321 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0192641 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0619  GDP-fucose synthetase  35.21 
 
 
308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.22 
 
 
314 aa  184  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.660712  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2341  GDP-L-fucose synthetase  34.29 
 
 
321 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0361  fucose synthetase family protein  35.31 
 
 
326 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0252323  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4108  putative nucleotide di-P-sugar epimerase or dehydratase  32.7 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353388  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2092  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2290  GDP-L-fucose synthetase  34.39 
 
 
321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.711318  normal  0.0100272 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14451  putative fucose synthetase  31.99 
 
 
337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.638706  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0627  GDP-fucose synthetase  34.88 
 
 
314 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1235  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.28 
 
 
320 aa  182  6e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2334  GDP-L-fucose synthetase  33.97 
 
 
321 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.371509 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.07 
 
 
321 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>