139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4075 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4075  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 
434 aa  860    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00469462  normal  0.209954 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6734  ATPase  58.27 
 
 
385 aa  393  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0140161  normal  0.0815898 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6855  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.05 
 
 
430 aa  386  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00217466  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3726  ATPase  35.03 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0460635  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3799  ATPase  35.03 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00566869 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3738  ATPase  35.03 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.232377  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3615  nitric-oxide reductase NorQ protein  34.06 
 
 
280 aa  75.9  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0071998  normal  0.061838 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4196  ATPase  33.33 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220432  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2458  ATPase  33.76 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0905  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  30.18 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3121  ATPase  29.15 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.209587  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  34.91 
 
 
263 aa  73.2  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  34.91 
 
 
263 aa  73.2  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0979  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  33.14 
 
 
263 aa  72.4  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4155  ATPase  34.85 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0322  NorQ protein required for nitric oxide reductase activity  31.85 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1967  ATPase  31.85 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3640  ATPase  30.39 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232524  normal  0.0364996 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2538  ATPase  34.09 
 
 
283 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2583  ATPase  34.09 
 
 
283 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2576  ATPase  34.09 
 
 
283 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0133764  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0972  ATPase  33.33 
 
 
265 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0871  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  31.65 
 
 
267 aa  69.7  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1499  ATPase  29.14 
 
 
267 aa  68.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00779848  normal  0.0229938 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06310  midasin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12150)  29.93 
 
 
4917 aa  68.2  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.589937  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2622  rubisco activation protein CbbQ  30 
 
 
267 aa  67.8  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4065  hypothetical protein  28.07 
 
 
271 aa  67.8  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.312415 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1844  ATPase AAA_5  32 
 
 
279 aa  67  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.79049  normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3190  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  30.94 
 
 
267 aa  67  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.209478  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.36 
 
 
278 aa  66.6  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2482  ATPase  31.91 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1515  ATPase  31.68 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00619619 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0621  regulatory protein NirQ  32.14 
 
 
260 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2746  cbbQ protein  27.92 
 
 
266 aa  65.1  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.728078  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1376  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  30 
 
 
267 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.428584  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1977  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  29.38 
 
 
265 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3434  ATPase  30.81 
 
 
267 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1678  p30 protein  30 
 
 
267 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.155235  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0423  ATPase  28.57 
 
 
266 aa  65.1  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06770  regulatory protein NirQ  31.78 
 
 
260 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0601  ATPase  29.48 
 
 
265 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.309548  normal  0.0418283 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2319  denitrification regulatory protein nirQ  31.11 
 
 
260 aa  64.3  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.101351  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2838  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  28.22 
 
 
268 aa  64.3  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2156  CbbQ protein  27.45 
 
 
272 aa  64.3  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1815  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  27.45 
 
 
272 aa  64.3  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3185  nitric oxide reductase Q protein  30.32 
 
 
268 aa  64.3  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.540661  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0131  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  28.95 
 
 
268 aa  63.9  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3053  CbbQ protein  29.38 
 
 
267 aa  63.5  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2662  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  29.38 
 
 
267 aa  63.5  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2766  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.27 
 
 
267 aa  63.5  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27338  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0824  nitric oxide reductase activation protein NorQ  31.5 
 
 
270 aa  62.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.569782  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2119  ATPase  28.73 
 
 
270 aa  62.8  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.976188 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2684  ATPase  29.45 
 
 
279 aa  62.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1547  ATPase  28.74 
 
 
269 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.591966  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4904  ATPase  28.57 
 
 
272 aa  62  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1044  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  27.81 
 
 
268 aa  62.4  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.552849  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0429  ATPase  28.78 
 
 
272 aa  61.2  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6287  ATPase  30.69 
 
 
272 aa  61.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2637  rubisco activation protein CbbQ  27.38 
 
 
268 aa  60.8  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1848  ATPase  32.79 
 
 
275 aa  60.8  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71553  predicted protein  27.24 
 
 
4979 aa  60.8  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.473575 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0106  AAA family ATPase  29.67 
 
 
322 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0687561  normal  0.0739465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1966  putative cbbQ/nirQ/norQ/gpvN family protein  30.59 
 
 
266 aa  60.8  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.947732 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0538  ATPase  36.73 
 
 
297 aa  60.8  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1976  ATPase  28.78 
 
 
307 aa  60.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.919685  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7219  ATPase AAA_5  34.19 
 
 
400 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172501  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0119  ATPase  27.27 
 
 
270 aa  60.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3766  CbbQ/NirQ/NorQ domain-containing protein  29.8 
 
 
268 aa  60.8  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5308  Cobaltochelatase  32.48 
 
 
409 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1094  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  30.41 
 
 
267 aa  60.1  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3134  ATPase  28.57 
 
 
280 aa  60.1  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2158  cobS protein, putative  38.02 
 
 
313 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0693  norQ protein, putative  36.05 
 
 
297 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0591  NorQ protein  34.97 
 
 
297 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0535  nitric-oxide reductase  34.97 
 
 
297 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0535  nitric-oxide reductase  34.97 
 
 
297 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01380  midasin, putative  27.03 
 
 
4844 aa  59.3  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0624  norq protein  34.97 
 
 
297 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.695502  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1301  hypothetical protein  32.48 
 
 
315 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146345  normal  0.342986 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4344  ATPase  29.5 
 
 
278 aa  58.9  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.785303  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0753  putative norQ protein  34.97 
 
 
297 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0679  putative norQ protein  34.97 
 
 
297 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000358877 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0661  putative norQ protein  36.05 
 
 
297 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4676  putative norQ protein  36.05 
 
 
297 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.7049199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  31.82 
 
 
620 aa  58.9  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2608  ATPase  31.2 
 
 
324 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.8348 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1633  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.97 
 
 
290 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000122684  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.41 
 
 
307 aa  57.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0207  ATPase  29.41 
 
 
307 aa  57.8  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.93 
 
 
308 aa  57.8  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.44 
 
 
286 aa  57.4  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0536  ATPase  33.57 
 
 
297 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1978  ATPase  27.05 
 
 
285 aa  57  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1643  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.72 
 
 
270 aa  57.4  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2090  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity (putative chaperone, ATPase)  27.85 
 
 
269 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.835685 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1517  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.8 
 
 
271 aa  55.8  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0250  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  29.1 
 
 
270 aa  55.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.326852  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1254  ATPase  25.71 
 
 
284 aa  55.5  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2541  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.17 
 
 
291 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3194  ATPase  26.9 
 
 
260 aa  54.3  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>