More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0822 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0822  ISCpe6, transposase orfB  100 
 
 
185 aa  387  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0328  transposase  64.52 
 
 
296 aa  262  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3932  integrase catalytic region  65.05 
 
 
297 aa  260  8e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0728765  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2280  integrase catalytic region  65.05 
 
 
297 aa  260  8e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3448  integrase catalytic region  64.52 
 
 
297 aa  257  5.0000000000000005e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2163  transposase  61.8 
 
 
311 aa  238  4e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0047  transposase, C-terminal region  59.62 
 
 
160 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.432779  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0006  IS3 family transposase  44.07 
 
 
261 aa  138  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149374 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1459  IS3 family transposase  44.07 
 
 
261 aa  138  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000914872  normal  0.0630219 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1788  IS3 family transposase  44.07 
 
 
261 aa  138  4.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4363  transposase  42.7 
 
 
215 aa  137  7e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0267789  hitchhiker  2.99756e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1018  integrase core domain protein  42.7 
 
 
270 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4383  integrase core domain protein  42.7 
 
 
270 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.364071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1280  integrase core domain protein  42.7 
 
 
270 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.613069  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02200  YadA protein  43.89 
 
 
279 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04289  transposase  43.89 
 
 
279 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02377  hypothetical protein  43.89 
 
 
279 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02160  hypothetical protein  43.89 
 
 
279 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.604012  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1564  integrase catalytic subunit  40.23 
 
 
278 aa  134  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00620  IS150 putative transposase  42.11 
 
 
283 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03409  IS150 putative transposase  42.11 
 
 
283 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04283  IS150 putative transposase  42.11 
 
 
283 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04284  IS150 putative transposase  42.11 
 
 
283 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0153  Integrase catalytic region  42.11 
 
 
283 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03577  hypothetical protein  42.11 
 
 
283 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3760  IS150, transposase orfB  42.11 
 
 
283 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02652  hypothetical protein  42.11 
 
 
283 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3880  IS150 transposase orfB  42.11 
 
 
283 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636384  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1074  IS150 transposase orfB  42.11 
 
 
283 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.274968 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00609  hypothetical protein  42.11 
 
 
283 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03360  hypothetical protein  42.11 
 
 
283 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0717  integrase catalytic subunit  43.75 
 
 
261 aa  132  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.558663  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0848  integrase catalytic subunit  43.75 
 
 
261 aa  132  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.283499  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1577  integrase catalytic subunit  43.75 
 
 
261 aa  132  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.279406  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2077  integrase catalytic subunit  43.75 
 
 
261 aa  132  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.74373  normal  0.201044 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2412  integrase catalytic subunit  43.75 
 
 
261 aa  132  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.714231 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2437  integrase catalytic subunit  43.75 
 
 
261 aa  132  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1128  IS3 family transposase OrfB  44 
 
 
267 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0056  IS3 family transposase OrfB  44 
 
 
267 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0109  IS3-family transposase, OrfB  44 
 
 
249 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0514465  hitchhiker  0.00000245789 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1197  IS3-family transposase, OrfB  44 
 
 
249 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000397952  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5561  integrase catalytic region  40.34 
 
 
278 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  normal  0.319693 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3939  integrase catalytic region  40.34 
 
 
278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.997818  normal  0.816377 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1339  integrase catalytic region  40.34 
 
 
278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327623 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0288  integrase catalytic region  40.34 
 
 
278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.010827  normal  0.364185 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1165  integrase catalytic region  40.34 
 
 
222 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000468999 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2164  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  42.94 
 
 
239 aa  127  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1975  integrase catalytic subunit  41.52 
 
 
268 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.259629 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4860  integrase catalytic subunit  41.52 
 
 
268 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.434054  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2250  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  42.94 
 
 
239 aa  127  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3041  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  42.94 
 
 
239 aa  127  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2533  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  42.94 
 
 
239 aa  127  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3662  integrase core domain protein  40.45 
 
 
265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3620  transposase  40.45 
 
 
265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0498053  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0307  transposase orfB, IS150-related  40.45 
 
 
269 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1714  transposase  38.29 
 
 
278 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2654  integrase catalytic subunit  40.94 
 
 
268 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.596052  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3317  integrase catalytic subunit  40.94 
 
 
268 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.817536  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0026  transposase  40.45 
 
 
269 aa  125  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0124  ISPsy8, transposase OrfB  40.46 
 
 
259 aa  124  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0450  ISPsy8, transposase OrfB  40.46 
 
 
259 aa  124  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0516  ISPsy8, transposase OrfB  40.46 
 
 
259 aa  124  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.390784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5509  ISPsy8, transposase OrfB  40.46 
 
 
259 aa  124  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.359281  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2727  integrase catalytic region  38.15 
 
 
248 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.74831  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1458  integrase catalytic region  38.15 
 
 
248 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31397  normal  0.395934 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3446  transposase  38.33 
 
 
284 aa  123  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000031866 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5066  ISPsy8, transposase OrfB  40.46 
 
 
259 aa  123  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4456  integrase catalytic region  38.15 
 
 
248 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1740  integrase catalytic region  38.15 
 
 
248 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  hitchhiker  0.000236948 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3912  integrase catalytic region  38.15 
 
 
248 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553017  normal  0.660901 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2352  integrase catalytic region  37.93 
 
 
278 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  0.149217 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0564  integrase catalytic region  37.93 
 
 
278 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22633  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3346  integrase catalytic region  38.15 
 
 
248 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0096806 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2397  integrase catalytic region  38.15 
 
 
248 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.861552 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2938  integrase catalytic region  38.15 
 
 
248 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1436  isrso11-transposase orfb protein  38.86 
 
 
278 aa  123  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2265  isrso11-transposase orfb protein  38.86 
 
 
269 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3089  isrso11-transposase orfb protein  38.86 
 
 
278 aa  123  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3743  transposase  73.24 
 
 
71 aa  123  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0273  integrase catalytic subunit  38.07 
 
 
278 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0592  integrase catalytic subunit  38.07 
 
 
278 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398355  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1176  integrase catalytic subunit  38.07 
 
 
278 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.155999  normal  0.139612 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4616  integrase catalytic subunit  38.07 
 
 
278 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.698457  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4680  integrase catalytic subunit  38.07 
 
 
278 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6205  integrase catalytic subunit  38.29 
 
 
260 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.346125  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2564  integrase catalytic subunit  38.29 
 
 
278 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95917  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2714  integrase catalytic subunit  38.29 
 
 
278 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0814  integrase catalytic subunit  38.29 
 
 
278 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1446  integrase catalytic subunit  38.29 
 
 
278 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1432  integrase catalytic subunit  40.11 
 
 
270 aa  122  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0298  integrase catalytic subunit  40.11 
 
 
270 aa  122  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2862  transposase  41.86 
 
 
246 aa  121  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.318  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1365  transposase  42.35 
 
 
246 aa  121  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0447e-22 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0515  transposase  41.86 
 
 
246 aa  121  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1312  transposase  41.86 
 
 
246 aa  121  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000889717  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2024  transposase  41.86 
 
 
246 aa  121  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.08352e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2994  transposase  41.86 
 
 
246 aa  121  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4078  transposase  41.86 
 
 
246 aa  121  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0741694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1522  transposase  41.86 
 
 
246 aa  121  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.60985e-43 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1099  transposase  41.86 
 
 
246 aa  121  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.41959e-57 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>