81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0192 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0192  transferase, putative  100 
 
 
209 aa  411  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0496333  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0194  hypothetical protein  97.13 
 
 
209 aa  377  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1935  acetyltransferase  22.12 
 
 
227 aa  85.5  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1575  acetyltransferase (the isoleucine patch superfamily)  25.12 
 
 
212 aa  74.7  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  9.09781e-19 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5253  hexapeptide repeat-containing transferase  21.6 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3060  hexapaptide repeat-containing transferase  17.54 
 
 
218 aa  69.3  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.820425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3388  YvfD  27.47 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163166  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001766  putative serine O-acetyltransferase  26.32 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00483498  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1915  bacterial transferase, hexapeptide repeat protein  22.93 
 
 
213 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00871959  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0715  transferase hexapeptide repeat containing protein  25.12 
 
 
197 aa  65.5  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1212  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  28.47 
 
 
203 aa  64.7  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2333  hexapaptide repeat-containing transferase  23.08 
 
 
220 aa  64.7  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0546  hypothetical protein  16.67 
 
 
216 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.882481 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5687  sugar O-acyltransferase, sialic acid O- acetyltransferase NeuD family  25.6 
 
 
210 aa  62.8  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3899  putative acetyltransferase protein  15.57 
 
 
219 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1574  putative serine O-acetyltransferase  22.01 
 
 
217 aa  60.5  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1269  acetyltransferase  21.21 
 
 
296 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83932  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12993  putative acetyltransferase  29.84 
 
 
204 aa  58.5  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4746  transferase hexapeptide repeat containing protein  27.64 
 
 
181 aa  57.4  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00152727  normal  0.0166501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2641  Serine acetyltransferase-like protein  25.83 
 
 
216 aa  57.4  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0919  hypothetical protein  26.73 
 
 
214 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0491377 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3841  putative acetyltransferase  22.9 
 
 
210 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0293  carbonic anhydrase  22.15 
 
 
214 aa  56.2  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.436969  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2518  putative acetyltransferase protein  21.46 
 
 
212 aa  55.5  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2304  hypothetical protein  25.65 
 
 
203 aa  55.1  0.0000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1128  hexapaptide repeat-containing transferase  20.47 
 
 
223 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2607  putative acetyltransferase  23.16 
 
 
190 aa  53.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000773835  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3872  hexapaptide repeat-containing transferase  17.7 
 
 
210 aa  53.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4004  pilin glycosylation protein  21.36 
 
 
211 aa  53.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0572  putative acetyltransferase  23.16 
 
 
197 aa  52.8  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0399272  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0094  putative acetyltransferase  23.2 
 
 
210 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.315578 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3476  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like  18.4 
 
 
269 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16960  transferase hexapeptide repeat protein  27.07 
 
 
209 aa  50.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3036  hexapeptide transferase family protein  19.71 
 
 
216 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0594  acetyl transferase  24.29 
 
 
191 aa  50.8  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4057  acetyltransferases  15.57 
 
 
222 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2767  putative serine O-acetyltransferase  17.96 
 
 
215 aa  49.3  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2647  putative acetyltransferase  23.9 
 
 
213 aa  49.3  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30060  Trimeric LpxA-like family protein  20 
 
 
209 aa  49.3  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219117  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1700  Serine acetyltransferase-like protein  21.48 
 
 
211 aa  49.3  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3702  acetyltransferase  24.6 
 
 
213 aa  48.9  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1999  hexapaptide repeat-containing transferase  19.05 
 
 
229 aa  48.9  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.776075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2808  hexapeptide transferase family protein  19.42 
 
 
216 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0101  hexapeptide transferase family protein  23.48 
 
 
210 aa  48.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3879  hexapeptide repeat-containing transferase  23.48 
 
 
210 aa  48.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0586  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  34.26 
 
 
469 aa  47.4  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000143766  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1736  transferase hexapeptide repeat containing protein  17.8 
 
 
218 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2882  hexapeptide transferase family protein  22.61 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1344  hexapaptide repeat-containing transferase  19.85 
 
 
226 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.966213 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4284  acetyltransferase  21.43 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3457  hexapeptide transferase family protein  22.61 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10928  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1662  hexapeptide transferase family protein  22.61 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3961  hexapeptide repeat-containing transferase  22.61 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3093  hexapeptide transferase family protein  22.61 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.915098  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3630  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  22.29 
 
 
196 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2692  acetyltransferase  23.33 
 
 
214 aa  46.2  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1168  putative acetyl transferase protein  20.28 
 
 
217 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.7385 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  27.54 
 
 
385 aa  45.8  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0632  sugar O-acyltransferase, sialic acid O-acetyltransferase NeuD family  17.7 
 
 
211 aa  45.8  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1210  diguanylate cyclase  20.97 
 
 
194 aa  45.8  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0820  hypothetical protein  23.77 
 
 
202 aa  45.1  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4087  carbonic anhydrase  21.57 
 
 
212 aa  45.1  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2395  hexapeptide transferase family protein  20.18 
 
 
212 aa  44.7  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4155  acetyltransferase  21.26 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.603693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8498  acetyltransferase  22.05 
 
 
225 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.898885  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3981  hypothetical protein  19 
 
 
225 aa  43.5  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2227  hexapaptide repeat-containing transferase  22.09 
 
 
174 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0598  general glycosylation pathway protein  26.28 
 
 
203 aa  43.5  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.707027  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3016  putative acetyltransferase  25.93 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0791  hypothetical protein  23.7 
 
 
202 aa  42.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2245  pilin glycosylation protein  21.99 
 
 
192 aa  42.7  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0796956  normal  0.0504546 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0251  hexapaptide repeat-containing transferase  34.38 
 
 
202 aa  42.4  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1876  hypothetical protein  23.33 
 
 
195 aa  42.4  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.851217 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1140  general glycosylation pathway protein  24.82 
 
 
203 aa  42  0.006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.672363  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001799  putative acetyltransferase  24.04 
 
 
217 aa  42  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1127  putative acetyl transferase protein  17.54 
 
 
220 aa  42  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.037936  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2934  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  22.73 
 
 
464 aa  41.6  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.04737e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0084  putative sugar acetyltransferase  21.78 
 
 
246 aa  41.6  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.546093  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4281  hypothetical protein  28.77 
 
 
208 aa  41.6  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01411  carbonic anhydrase  22.73 
 
 
226 aa  41.6  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0707  hypothetical protein  21.02 
 
 
222 aa  41.2  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.727411  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>