48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL06550 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006681  CNL06550  orotidine-5'-phosphate decarboxylase, putative  100 
 
 		 269 aa  552  1e-156  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115741  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50417  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase (OMP decarboxylase) (OMPDCase) (OMPdecase) (Uridine 5'-monophosphate synthase) (UMP synthase) (PYRF)  50.93 
 
 		 267 aa  268  8e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.571106 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19418  Uridine 5'- monophosphate synthase  49.44 
 
 		 474 aa  248  8e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0102475  normal  0.110461 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06157  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase (EC 4.1.1.23)(OMP decarboxylase)(OMPdecase)(OMPDCase)(Uridine 5'-monophosphate synthase)(UMP synthase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P10652]  44.44 
 
 		 274 aa  218  8.999999999999998e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.985289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1958  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28.44 
 
 		 231 aa  62  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000470134  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2119  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.97 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000535005  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1740  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28.31 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000416133  hitchhiker  0.0025421 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2294  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.52 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000688308  unclonable  0.0000000000829203 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1981  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.61 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191461  unclonable  0.0000000000644794 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2315  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.06 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0273911  hitchhiker  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1928  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.15 
 
 		 231 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128014  unclonable  0.0000000000403388 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2225  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.13 
 
 		 234 aa  53.1  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000264072  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2392  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.48 
 
 		 231 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000113777  unclonable  0.00000908556 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2038  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.15 
 
 		 231 aa  52.4  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000333047  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3220  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.15 
 
 		 235 aa  52.4  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2275  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.48 
 
 		 231 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000296065  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2074  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.48 
 
 		 231 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000167126  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2463  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.88 
 
 		 231 aa  52  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000296014  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0131  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28.87 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.471911 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2070  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.48 
 
 		 231 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000195505  unclonable  0.0000000000022204 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3009  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.22 
 
 		 234 aa  52  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00223674  normal  0.753586 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2398  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.69 
 
 		 231 aa  50.4  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1031  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.85 
 
 		 236 aa  49.7  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0374618  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1137  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28.37 
 
 		 250 aa  48.9  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2718  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  26.25 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0305405  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0683  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.31 
 
 		 235 aa  47.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1703  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.23 
 
 		 243 aa  46.2  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00220988  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4816  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.11 
 
 		 236 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322083  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0923  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.57 
 
 		 232 aa  46.2  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.881435  normal  0.442892 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1067  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.57 
 
 		 232 aa  46.2  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0060  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28.32 
 
 		 221 aa  45.8  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0980  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28.89 
 
 		 231 aa  45.4  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0327269  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2594  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  28.51 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1491  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.18 
 
 		 232 aa  45.4  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.669269 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1047  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28.5 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.176456  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1836  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  22.22 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.533386  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1000  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.51 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1913  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.34 
 
 		 245 aa  43.9  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268139  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2024  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.34 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0902574  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1404  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.25 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2353  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  26.75 
 
 		 271 aa  43.9  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2958  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.39 
 
 		 244 aa  43.5  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2128  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.43 
 
 		 238 aa  43.5  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.303572  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0072  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.25 
 
 		 232 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.109683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2761  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.52 
 
 		 277 aa  43.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1670  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.59 
 
 		 232 aa  43.1  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0087165  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1468  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.67 
 
 		 237 aa  43.1  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.522803  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0298  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  24.19 
 
 		 249 aa  42.7  0.006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>