32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_50417 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009048  PICST_50417  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase (OMP decarboxylase) (OMPDCase) (OMPdecase) (Uridine 5'-monophosphate synthase) (UMP synthase) (PYRF)  100 
 
 		 267 aa  549  1e-155  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.571106 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06550  orotidine-5'-phosphate decarboxylase, putative  51.3 
 
 		 269 aa  256  3e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115741  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06157  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase (EC 4.1.1.23)(OMP decarboxylase)(OMPdecase)(OMPDCase)(Uridine 5'-monophosphate synthase)(UMP synthase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P10652]  48.33 
 
 		 274 aa  249  4e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.985289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19418  Uridine 5'- monophosphate synthase  51.36 
 
 		 474 aa  246  4e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0102475  normal  0.110461 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00919  conserved hypothetical protein  34.86 
 
 		 458 aa  54.3  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.591168  normal  0.347502 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1376  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.45 
 
 		 229 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1958  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.68 
 
 		 231 aa  54.7  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000470134  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1380  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.45 
 
 		 229 aa  53.9  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0923  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  24.15 
 
 		 232 aa  50.4  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.881435  normal  0.442892 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1067  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  24.15 
 
 		 232 aa  50.4  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2068  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.62 
 
 		 243 aa  49.3  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02117  orotidine 5-phosphate decarboxylase  24.53 
 
 		 232 aa  49.3  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000184829  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3220  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  23.48 
 
 		 235 aa  49.3  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2077  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.11 
 
 		 231 aa  48.9  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0111408  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1740  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  24.23 
 
 		 233 aa  47.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000416133  hitchhiker  0.0025421 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1309  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  24.9 
 
 		 246 aa  48.1  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.940136  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1217  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  23.08 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.839138  normal  0.22387 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1866  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.52 
 
 		 241 aa  46.6  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4816  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28.15 
 
 		 236 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322083  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2761  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.32 
 
 		 277 aa  45.8  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1687  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  22.95 
 
 		 245 aa  45.4  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.660624  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0126  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  33.86 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000390122  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2349  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  22.77 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.872566 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2681  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.85 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.774339 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0944  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.35 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000217759  normal  0.240259 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0684  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  26.63 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595201  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2278  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.58 
 
 		 232 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4051  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.27 
 
 		 232 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26890  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  22.32 
 
 		 232 aa  42.7  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.131013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1137  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.51 
 
 		 250 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2066  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  22.37 
 
 		 239 aa  42.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0034827  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1836  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  21.55 
 
 		 244 aa  42  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.533386  normal  0.407013 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>