29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB04600 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006684  CNB04600  uridine transporter, putative  100 
 
 
203 aa  412  1e-114  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108014  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07955  hypothetical transporter, cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin family (Eurofung)  35.03 
 
 
597 aa  103  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.214148 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04152  conserved hypothetical protein  33.9 
 
 
483 aa  87.8  9e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.983602 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29465  Thiamine Metabolism  33.54 
 
 
555 aa  87.8  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00460  allantoin permease, putative  31.58 
 
 
546 aa  85.9  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00690  uracil permease, putative  35.62 
 
 
560 aa  78.2  0.00000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00660  uracil transporter (Eurofung)  33.72 
 
 
478 aa  70.1  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0940122  normal  0.0243267 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30685  allantoin transport  26.94 
 
 
575 aa  65.1  0.0000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.22109 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3444  NCS1 nucleoside transporter family  26.67 
 
 
507 aa  56.6  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000477865  normal  0.0865773 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08416  conserved hypothetical protein  25.15 
 
 
527 aa  55.5  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2863  NCS1 nucleoside transporter  26.16 
 
 
497 aa  54.3  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03352  uracil transporter, putative (Eurofung)  24.72 
 
 
578 aa  53.9  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.32896  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11211  conserved hypothetical protein  27.91 
 
 
563 aa  53.9  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0468046  normal  0.297594 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42384  allantoin permease  27.74 
 
 
596 aa  53.5  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.338848  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02280  hypothetical protein  26.52 
 
 
573 aa  50.8  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104271  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02550  conserved hypothetical protein  28.49 
 
 
557 aa  48.1  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.169602  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33169  allantoin permease  25.36 
 
 
593 aa  46.2  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0477743  normal  0.268616 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0968  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  34.44 
 
 
489 aa  45.1  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.553781  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4150  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  27.16 
 
 
494 aa  44.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1233  transporter transmembrane protein  27.33 
 
 
502 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0759006  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6713  NCS1 nucleoside transporter  24.66 
 
 
502 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.997894 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1533  NCS1 nucleoside transporter  24.73 
 
 
503 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.578632  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2688  NCS1 nucleoside transporter family  24.73 
 
 
503 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.931856  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2210  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.83 
 
 
502 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5720  NCS1 nucleoside transporter  23.97 
 
 
502 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244182  normal  0.497544 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5964  NCS1 nucleoside transporter  23.97 
 
 
502 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0145337  normal  0.627469 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3590  NCS1 nucleoside transporter  27.69 
 
 
490 aa  42  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.483466 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2385  NCS1 nucleoside transporter family  23.94 
 
 
492 aa  41.6  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2703  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  40.35 
 
 
492 aa  41.2  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>