228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1664 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1664  putative nucleotide-binding protein  100 
 
 
165 aa  317  3.9999999999999996e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1649  putative nucleotide-binding protein  78.18 
 
 
165 aa  255  2e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1539  putative nucleotide-binding protein  73.94 
 
 
165 aa  245  2e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1583  putative nucleotide-binding protein  65.45 
 
 
163 aa  198  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1551  putative nucleotide-binding protein  63.64 
 
 
163 aa  199  1.9999999999999998e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0423  putative nucleotide-binding protein  64.85 
 
 
163 aa  196  7.999999999999999e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0398  putative nucleotide-binding protein  64.85 
 
 
163 aa  196  9e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.167613  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0092  protein of unknown function DUF520  52.12 
 
 
165 aa  165  2.9999999999999998e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0039  putative nucleotide-binding protein  43.64 
 
 
165 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  43.64 
 
 
164 aa  138  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0537  putative nucleotide-binding protein  45 
 
 
163 aa  134  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.323651  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0476  putative nucleotide-binding protein  45 
 
 
163 aa  133  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0482  putative nucleotide-binding protein  45 
 
 
163 aa  133  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.101201 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0495  putative nucleotide-binding protein  45 
 
 
163 aa  133  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0474  putative nucleotide-binding protein  45 
 
 
163 aa  133  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1036  putative nucleotide-binding protein  43.75 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.448426  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2291  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 
163 aa  132  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000470515  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0893  putative nucleotide-binding protein  43.75 
 
 
163 aa  132  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3275  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 
163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1084  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 
163 aa  128  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.235952  hitchhiker  0.00000304548 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3067  putative nucleotide-binding protein  42.86 
 
 
163 aa  128  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3247  putative nucleotide-binding protein  42.86 
 
 
163 aa  128  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3104  putative nucleotide-binding protein  42.86 
 
 
163 aa  128  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00374  nucleotide-binding protein  43.12 
 
 
163 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3183  protein of unknown function DUF520  43.12 
 
 
163 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.387868  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00378  hypothetical protein  43.12 
 
 
163 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0510  putative nucleotide-binding protein  43.12 
 
 
163 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.781965  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0498  putative nucleotide-binding protein  43.12 
 
 
163 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0462  putative nucleotide-binding protein  43.12 
 
 
163 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3207  putative nucleotide-binding protein  43.12 
 
 
163 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000536011 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0348  putative nucleotide-binding protein  43.12 
 
 
163 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0458  putative nucleotide-binding protein  43.12 
 
 
163 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3079  putative nucleotide-binding protein  43.12 
 
 
163 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421568  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2804  protein of unknown function DUF520  41.82 
 
 
165 aa  122  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000772661  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1927  putative nucleotide-binding protein  44.85 
 
 
166 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0682804  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2888  putative nucleotide-binding protein  41.25 
 
 
163 aa  122  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0688  putative nucleotide-binding protein  41.61 
 
 
163 aa  120  9e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.067831  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0876  putative nucleotide-binding protein  41.21 
 
 
163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1061  putative nucleotide-binding protein  41.57 
 
 
163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000318846  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0136  hypothetical protein  43.03 
 
 
164 aa  118  3e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0711  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
163 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000320146  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1196  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
160 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.699154  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1273  putative nucleotide-binding protein  41.82 
 
 
163 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.152949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1081  putative nucleotide-binding protein  41.82 
 
 
163 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1064  putative nucleotide-binding protein  41.82 
 
 
163 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1059  putative nucleotide-binding protein  41.82 
 
 
163 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3028  putative nucleotide-binding protein  39.13 
 
 
164 aa  117  7.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.208181  normal  0.91414 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1166  putative nucleotide-binding protein  41.82 
 
 
163 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1240  putative nucleotide-binding protein  41.82 
 
 
163 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1318  putative nucleotide-binding protein  41.82 
 
 
163 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1539  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
163 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1706  putative nucleotide-binding protein  41.61 
 
 
164 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.280602  hitchhiker  0.00217335 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2028  putative nucleotide-binding protein  41.82 
 
 
164 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2479  putative nucleotide-binding protein  36.88 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0562563  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4128  putative nucleotide-binding protein  41.82 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0402113  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1115  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2826  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
161 aa  114  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.931729 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0818  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 
161 aa  114  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4781  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 
161 aa  114  7.999999999999999e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0520927  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2420  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
161 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1213  putative nucleotide-binding protein  41.21 
 
 
163 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0290  hypothetical protein  37.5 
 
 
161 aa  114  7.999999999999999e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3127  putative nucleotide-binding protein  40.61 
 
 
163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.266318  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3769  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0094  putative nucleotide-binding protein  36.25 
 
 
162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0533  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4311  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57751  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2603  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 
161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2474  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 
161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0278079 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0730  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04099  nucleotide-binding protein  36.25 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2750  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821102  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2240  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
161 aa  112  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.065474  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0782  putative nucleotide-binding protein  37.5 
 
 
161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0633  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.897e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0619  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 
161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0491781  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0318  protein of unknown function DUF520  36.88 
 
 
161 aa  111  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2585  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
160 aa  111  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358565  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0373  putative nucleotide-binding protein  37.5 
 
 
161 aa  110  6e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1071  putative nucleotide-binding protein  37.5 
 
 
161 aa  110  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5887  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
161 aa  110  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3156  putative nucleotide-binding protein  37.5 
 
 
161 aa  111  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0811  putative nucleotide-binding protein  37.5 
 
 
161 aa  111  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10690  hypothetical protein  34.55 
 
 
165 aa  110  6e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0100552  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0673  putative nucleotide-binding protein  37.5 
 
 
161 aa  110  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2508  putative nucleotide-binding protein  37.5 
 
 
161 aa  110  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0915  putative nucleotide-binding protein  37.5 
 
 
161 aa  110  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0919  putative nucleotide-binding protein  37.5 
 
 
161 aa  110  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0122  putative nucleotide-binding protein  37.5 
 
 
161 aa  110  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0977  hypothetical protein  37.5 
 
 
161 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1670  putative nucleotide-binding protein  37.5 
 
 
161 aa  110  8.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.502764  normal  0.473324 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1091  protein of unknown function DUF520  37.5 
 
 
161 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0959  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 
161 aa  110  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2549  putative nucleotide-binding protein  38.12 
 
 
161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1993  putative nucleotide-binding protein  41.25 
 
 
160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0973999  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2033  hypothetical protein  36.42 
 
 
161 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0203  putative nucleotide-binding protein  41.25 
 
 
160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17650  putative nucleotide-binding protein  40.35 
 
 
162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.839683  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1596  putative nucleotide-binding protein  41.25 
 
 
161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.938712  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02358  putative nucleotide-binding protein  36.25 
 
 
160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>