More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2298 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2298  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
490 aa  964    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.195792  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0115  aldehyde dehydrogenase  63.54 
 
 
495 aa  559  1e-158  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5096  2-ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase / NADP-dependent aldehyde dehydrogenase  52.8 
 
 
495 aa  433  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.845756  normal  0.435826 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1484  aldehyde dehydrogenase  45.21 
 
 
497 aa  345  8e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2585  aldehyde dehydrogenase family protein  42.65 
 
 
526 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3131  aldehyde dehydrogenase  42.86 
 
 
526 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0227  aldehyde dehydrogenase  42.24 
 
 
527 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003674  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase  41.08 
 
 
510 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.690417  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3253  aldehyde dehydrogenase  42.24 
 
 
526 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.177644 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36050  putative aldehyde dehydrogenase  42.74 
 
 
527 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0976275  hitchhiker  0.00000000280554 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3072  putative aldehyde dehydrogenase  42.53 
 
 
527 aa  333  4e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3112  aldehyde dehydrogenase  44.03 
 
 
527 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4139  putative semialdehyde dehydrogenase  44.67 
 
 
526 aa  331  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.557422  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2364  aldehyde dehydrogenase  40.2 
 
 
521 aa  329  8e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0248212  normal  0.117766 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5736  Aldehyde Dehydrogenase  43.09 
 
 
533 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.437114  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4113  Aldehyde Dehydrogenase  42.71 
 
 
504 aa  324  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0832  aldehyde dehydrogenase  42.39 
 
 
525 aa  324  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0547808 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4947  aldehyde dehydrogenase  42.45 
 
 
525 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3335  aldehyde dehydrogenase  47.87 
 
 
489 aa  323  3e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3869  aldehyde dehydrogenase  42.86 
 
 
505 aa  323  4e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1760  aldehyde dehydrogenase  40.12 
 
 
521 aa  322  8e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000916491  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6431  aldehyde dehydrogenase  44.28 
 
 
530 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00291714  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0786  Aldehyde Dehydrogenase  49.22 
 
 
502 aa  322  9.999999999999999e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0369146 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3135  Aldehyde Dehydrogenase  45.8 
 
 
483 aa  322  9.999999999999999e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.18311 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3045  aldehyde dehydrogenase  42.25 
 
 
525 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1837  aldehyde dehydrogenase  42.98 
 
 
536 aa  321  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5321  aldehyde dehydrogenase  42.25 
 
 
525 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.711093 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2116  aldehyde dehydrogenase  42.26 
 
 
525 aa  320  5e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.458004  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1998  aldehyde dehydrogenase  44.4 
 
 
524 aa  320  5e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0448113  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3323  aldehyde dehydrogenase family protein  42.14 
 
 
527 aa  320  5e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559722  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0328  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  42.62 
 
 
525 aa  320  5e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49290  Aldehyde dehydrogenase  42.06 
 
 
526 aa  319  6e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.213935  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48010  putative semialdehyde dehydrogenase  43.21 
 
 
526 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014327  normal  0.873423 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0864  aldehyde dehydrogenase  39 
 
 
528 aa  318  1e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.321546 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4441  aldehyde dehydrogenase  40.78 
 
 
526 aa  318  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1140  aldehyde dehydrogenase  39.84 
 
 
525 aa  316  5e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4272  Aldehyde Dehydrogenase  42.29 
 
 
489 aa  315  9e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3157  aldehyde dehydrogenase  42.14 
 
 
527 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000809211  normal  0.137723 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3224  aldehyde dehydrogenase  41.7 
 
 
526 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.169196  normal  0.562334 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05180  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  41.29 
 
 
525 aa  314  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2824  aldehyde dehydrogenase  40.9 
 
 
521 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.614012 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5206  aldehyde dehydrogenase  42.21 
 
 
525 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.222173 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3399  aldehyde dehydrogenase  42.01 
 
 
525 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202581  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4865  aldehyde dehydrogenase  42.58 
 
 
504 aa  313  3.9999999999999997e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.670882 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4679  aldehyde dehydrogenase  42.21 
 
 
525 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2442  NADP-dependent fatty aldehyde dehydrogenase  43.94 
 
 
501 aa  313  4.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1706  putative aldehyde dehydrogenase  45.68 
 
 
517 aa  312  6.999999999999999e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155195  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5346  Aldehyde Dehydrogenase  43.29 
 
 
505 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.671468 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2460  aldehyde dehydrogenase  41.36 
 
 
527 aa  311  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000205723 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4869  aldehyde dehydrogenase  44.06 
 
 
530 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2670  aldehyde dehydrogenase  40.79 
 
 
533 aa  310  2.9999999999999997e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4783  aldehyde dehydrogenase  44.06 
 
 
530 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.233271  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4199  aldehyde dehydrogenase  42.44 
 
 
522 aa  310  4e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3101  aldehyde dehydrogenase  41.14 
 
 
526 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1451  fatty aldehyde dehydrogenase  38.76 
 
 
510 aa  309  9e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5346  Aldehyde Dehydrogenase  44.47 
 
 
485 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0811797 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0186  aldehyde dehydrogenase family protein  42.44 
 
 
524 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2314  aldehyde dehydrogenase  40.85 
 
 
526 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0433257  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4861  Aldehyde Dehydrogenase  40.7 
 
 
527 aa  307  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.187571 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5169  aldehyde dehydrogenase  43.65 
 
 
530 aa  307  3e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0593368 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3624  aldehyde dehydrogenase  41.61 
 
 
525 aa  307  3e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.186491  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3078  aldehyde dehydrogenase  42.83 
 
 
528 aa  306  4.0000000000000004e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.165309 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2306  aldehyde dehydrogenase  41.77 
 
 
530 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.862226  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0844  aldehyde dehydrogenase  41.81 
 
 
508 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5585  Aldehyde Dehydrogenase  43.18 
 
 
482 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.553725  normal  0.902956 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3602  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase  40.94 
 
 
526 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.133791  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1805  putative fatty aldehyde dehydrogenase  40.5 
 
 
527 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00336157  normal  0.0125854 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1031  aldehyde dehydrogenase  43.02 
 
 
532 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3912  dehydrogenase  39.74 
 
 
504 aa  304  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0195751  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4104  aldehyde dehydrogenase  41.76 
 
 
502 aa  305  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000295252 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1743  aldehyde dehydrogenase  44.24 
 
 
502 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0112208  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3264  aldehyde dehydrogenase  41.7 
 
 
508 aa  303  3.0000000000000004e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000455371 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2817  aldehyde dehydrogenase  41.49 
 
 
526 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106118  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3325  aldehyde dehydrogenase  43.94 
 
 
506 aa  302  1e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0037  aldehyde dehydrogenase  42.24 
 
 
537 aa  300  3e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3713  aldehyde dehydrogenase  40.97 
 
 
525 aa  300  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1008  Aldehyde Dehydrogenase  40.38 
 
 
536 aa  299  6e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.69554 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1283  aldehyde dehydrogenase  40.45 
 
 
525 aa  299  7e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.435 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5547  aldehyde dehydrogenase  42.17 
 
 
507 aa  299  8e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0649354 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1256  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase  40.62 
 
 
525 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.333102 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1529  fatty aldehyde dehydrogenase  40.26 
 
 
515 aa  298  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5410  Aldehyde Dehydrogenase  42.64 
 
 
505 aa  297  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.263721  decreased coverage  0.00137707 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1702  aldehyde dehydrogenase  38.28 
 
 
521 aa  297  3e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.124447  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6846  Aldehyde Dehydrogenase  40.17 
 
 
515 aa  297  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.29435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1486  aldehyde dehydrogenase  44.4 
 
 
485 aa  297  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2395  Aldehyde Dehydrogenase  43.41 
 
 
504 aa  296  5e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4135  aldehyde dehydrogenase  42.44 
 
 
525 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2501  Aldehyde Dehydrogenase  38.05 
 
 
537 aa  294  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.551853 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3656  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  40.22 
 
 
508 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0043  aldehyde dehydrogenase  40.26 
 
 
526 aa  293  6e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0253475  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0057  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  40.26 
 
 
526 aa  293  6e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2498  Aldehyde Dehydrogenase  40.94 
 
 
549 aa  293  6e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0042  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  40.26 
 
 
656 aa  292  8e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0035  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  40.69 
 
 
526 aa  292  8e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1470  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  40.69 
 
 
526 aa  292  8e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1189  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  40.26 
 
 
656 aa  292  8e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1541  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  40.34 
 
 
659 aa  292  9e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.211116  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0233  aldehyde dehydrogenase  44.71 
 
 
490 aa  292  9e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0038  aldehyde dehydrogenase  41.9 
 
 
526 aa  292  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3617  aldehyde dehydrogenase  41.41 
 
 
512 aa  291  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>