More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1706 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1706  putative aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
517 aa  1031    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155195  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2395  Aldehyde Dehydrogenase  61.98 
 
 
504 aa  547  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4113  Aldehyde Dehydrogenase  57.59 
 
 
504 aa  520  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1484  aldehyde dehydrogenase  53.24 
 
 
497 aa  458  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3125  aldehyde dehydrogenase  52.11 
 
 
502 aa  438  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3135  Aldehyde Dehydrogenase  53.04 
 
 
483 aa  434  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.18311 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3335  aldehyde dehydrogenase  52.88 
 
 
489 aa  431  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5346  Aldehyde Dehydrogenase  51.03 
 
 
485 aa  402  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0811797 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1743  aldehyde dehydrogenase  53.06 
 
 
502 aa  394  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0112208  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0786  Aldehyde Dehydrogenase  54.41 
 
 
502 aa  394  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0369146 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1086  aldehyde dehydrogenase  53.53 
 
 
490 aa  390  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0121968  decreased coverage  0.00153229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1486  aldehyde dehydrogenase  51.3 
 
 
485 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0037  aldehyde dehydrogenase  48.13 
 
 
537 aa  382  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003674  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase  43.03 
 
 
510 aa  375  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.690417  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0844  aldehyde dehydrogenase  46.54 
 
 
508 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1998  aldehyde dehydrogenase  49.02 
 
 
524 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0448113  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4865  aldehyde dehydrogenase  46.61 
 
 
504 aa  365  1e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.670882 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4139  putative semialdehyde dehydrogenase  47.22 
 
 
526 aa  364  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.557422  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48010  putative semialdehyde dehydrogenase  47.32 
 
 
526 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014327  normal  0.873423 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1008  Aldehyde Dehydrogenase  44.33 
 
 
536 aa  357  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.69554 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3869  aldehyde dehydrogenase  44.52 
 
 
505 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3325  aldehyde dehydrogenase  46.35 
 
 
506 aa  357  3.9999999999999996e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3253  aldehyde dehydrogenase  44.82 
 
 
526 aa  356  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.177644 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4947  aldehyde dehydrogenase  45.28 
 
 
525 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2314  aldehyde dehydrogenase  45.13 
 
 
526 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0433257  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0864  aldehyde dehydrogenase  40.88 
 
 
528 aa  354  2e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.321546 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4679  aldehyde dehydrogenase  45.06 
 
 
525 aa  355  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3101  aldehyde dehydrogenase  45.33 
 
 
526 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05180  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  46.38 
 
 
525 aa  353  2.9999999999999997e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3045  aldehyde dehydrogenase  45.26 
 
 
525 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5321  aldehyde dehydrogenase  45.26 
 
 
525 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.711093 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49290  Aldehyde dehydrogenase  46.38 
 
 
526 aa  353  4e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.213935  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3656  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  45.71 
 
 
508 aa  353  5e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0227  aldehyde dehydrogenase  43.81 
 
 
527 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2585  aldehyde dehydrogenase family protein  46.98 
 
 
526 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2817  aldehyde dehydrogenase  45.73 
 
 
526 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106118  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4676  aldehyde dehydrogenase  49.04 
 
 
495 aa  352  1e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.310641  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3131  aldehyde dehydrogenase  47.1 
 
 
526 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5206  aldehyde dehydrogenase  44.66 
 
 
525 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.222173 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3399  aldehyde dehydrogenase  44.09 
 
 
525 aa  350  3e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202581  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2460  aldehyde dehydrogenase  45.02 
 
 
527 aa  350  3e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000205723 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4441  aldehyde dehydrogenase  42.31 
 
 
526 aa  350  5e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0328  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  44.86 
 
 
525 aa  350  5e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3602  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase  45.13 
 
 
526 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.133791  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4199  aldehyde dehydrogenase  45.79 
 
 
522 aa  348  2e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0233  aldehyde dehydrogenase  46.37 
 
 
490 aa  347  4e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3394  aldehyde dehydrogenase  45.92 
 
 
508 aa  346  5e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1837  aldehyde dehydrogenase  46.67 
 
 
536 aa  346  6e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5346  Aldehyde Dehydrogenase  45.61 
 
 
505 aa  345  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.671468 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3264  aldehyde dehydrogenase  45.13 
 
 
508 aa  343  2.9999999999999997e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000455371 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3224  aldehyde dehydrogenase  44.61 
 
 
526 aa  343  5e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.169196  normal  0.562334 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1140  aldehyde dehydrogenase  40.75 
 
 
525 aa  343  5e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3912  dehydrogenase  43.86 
 
 
504 aa  343  5.999999999999999e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0195751  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6713  aldehyde dehydrogenase  43.87 
 
 
529 aa  340  4e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4721  aldehyde dehydrogenase  46.79 
 
 
457 aa  340  5e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36050  putative aldehyde dehydrogenase  45.44 
 
 
527 aa  339  7e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0976275  hitchhiker  0.00000000280554 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6431  aldehyde dehydrogenase  44.36 
 
 
530 aa  339  8e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00291714  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0832  aldehyde dehydrogenase  42.6 
 
 
525 aa  338  9e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0547808 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3072  putative aldehyde dehydrogenase  45.44 
 
 
527 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2501  Aldehyde Dehydrogenase  40.91 
 
 
537 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.551853 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4272  Aldehyde Dehydrogenase  39.79 
 
 
489 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3112  aldehyde dehydrogenase  43.98 
 
 
527 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3374  aldehyde dehydrogenase  45.55 
 
 
508 aa  336  5e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3713  aldehyde dehydrogenase  44.15 
 
 
525 aa  334  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3323  aldehyde dehydrogenase family protein  41.72 
 
 
527 aa  334  3e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559722  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3157  aldehyde dehydrogenase  42 
 
 
527 aa  334  3e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000809211  normal  0.137723 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1470  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  42.89 
 
 
526 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0035  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  42.89 
 
 
526 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2670  aldehyde dehydrogenase  42.63 
 
 
533 aa  332  9e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0042  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  42.89 
 
 
656 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1189  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  42.89 
 
 
656 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1541  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  42.68 
 
 
659 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.211116  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0038  aldehyde dehydrogenase  41.83 
 
 
526 aa  331  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0043  aldehyde dehydrogenase  42.68 
 
 
526 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0253475  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0057  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  42.68 
 
 
526 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5410  Aldehyde Dehydrogenase  44.35 
 
 
505 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.263721  decreased coverage  0.00137707 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4104  aldehyde dehydrogenase  44 
 
 
502 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000295252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5169  aldehyde dehydrogenase  45.32 
 
 
530 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0593368 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2442  NADP-dependent fatty aldehyde dehydrogenase  46.28 
 
 
501 aa  325  1e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0186  aldehyde dehydrogenase family protein  45.24 
 
 
524 aa  324  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4869  aldehyde dehydrogenase  44.88 
 
 
530 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4783  aldehyde dehydrogenase  44.88 
 
 
530 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.233271  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1256  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase  42.26 
 
 
525 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.333102 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2306  aldehyde dehydrogenase  41.93 
 
 
530 aa  324  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.862226  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0086  aldehyde dehydrogenase  45.65 
 
 
509 aa  324  3e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.932272  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1283  aldehyde dehydrogenase  41.87 
 
 
525 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1031  aldehyde dehydrogenase  42.41 
 
 
532 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0566  aldehyde dehydrogenase family protein  44.35 
 
 
530 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1883  aldehyde dehydrogenase family protein  44.35 
 
 
530 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1805  putative fatty aldehyde dehydrogenase  41.07 
 
 
527 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00336157  normal  0.0125854 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2364  aldehyde dehydrogenase  39.63 
 
 
521 aa  320  5e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0248212  normal  0.117766 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1897  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase  41.96 
 
 
527 aa  320  5e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.271045  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0468  aldehyde dehydrogenase family protein  44.35 
 
 
530 aa  320  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315073  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5736  Aldehyde Dehydrogenase  42.56 
 
 
533 aa  318  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.437114  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3952  Aldehyde Dehydrogenase  47.66 
 
 
580 aa  318  2e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4137  aldehyde dehydrogenase  42.86 
 
 
530 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0528665  normal  0.209657 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4229  aldehyde dehydrogenase  42.86 
 
 
530 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.857739  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0877  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  44.13 
 
 
530 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.854859  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2192  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  44.13 
 
 
530 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.65984  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1422  aldehyde dehydrogenase family protein  44.13 
 
 
530 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.24251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>