More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2395 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2395  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 
504 aa  989    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4113  Aldehyde Dehydrogenase  60.71 
 
 
504 aa  564  1.0000000000000001e-159  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1706  putative aldehyde dehydrogenase  61.98 
 
 
517 aa  558  1e-158  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155195  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3125  aldehyde dehydrogenase  50.61 
 
 
502 aa  442  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1484  aldehyde dehydrogenase  51.29 
 
 
497 aa  433  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3135  Aldehyde Dehydrogenase  52.51 
 
 
483 aa  428  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.18311 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3335  aldehyde dehydrogenase  51.92 
 
 
489 aa  422  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5346  Aldehyde Dehydrogenase  49.28 
 
 
485 aa  381  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0811797 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1743  aldehyde dehydrogenase  51.18 
 
 
502 aa  377  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0112208  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1086  aldehyde dehydrogenase  51.89 
 
 
490 aa  373  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0121968  decreased coverage  0.00153229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1486  aldehyde dehydrogenase  48.73 
 
 
485 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1008  Aldehyde Dehydrogenase  45.77 
 
 
536 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.69554 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3656  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  48.3 
 
 
508 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0786  Aldehyde Dehydrogenase  50 
 
 
502 aa  365  1e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0369146 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0227  aldehyde dehydrogenase  46.14 
 
 
527 aa  362  1e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0037  aldehyde dehydrogenase  46.72 
 
 
537 aa  360  5e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003674  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase  43.42 
 
 
510 aa  358  9e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.690417  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2670  aldehyde dehydrogenase  44.44 
 
 
533 aa  357  3.9999999999999996e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48010  putative semialdehyde dehydrogenase  46.6 
 
 
526 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014327  normal  0.873423 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4139  putative semialdehyde dehydrogenase  47.32 
 
 
526 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.557422  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3224  aldehyde dehydrogenase  46.93 
 
 
526 aa  354  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.169196  normal  0.562334 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3869  aldehyde dehydrogenase  44.56 
 
 
505 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3394  aldehyde dehydrogenase  48.3 
 
 
508 aa  353  4e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1998  aldehyde dehydrogenase  46.61 
 
 
524 aa  352  8e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0448113  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0832  aldehyde dehydrogenase  43.51 
 
 
525 aa  347  3e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0547808 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1140  aldehyde dehydrogenase  41.67 
 
 
525 aa  346  5e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3072  putative aldehyde dehydrogenase  45.33 
 
 
527 aa  346  5e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2585  aldehyde dehydrogenase family protein  44.11 
 
 
526 aa  346  7e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3399  aldehyde dehydrogenase  45.36 
 
 
525 aa  345  8e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202581  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4676  aldehyde dehydrogenase  49.46 
 
 
495 aa  345  8e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.310641  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3112  aldehyde dehydrogenase  44.4 
 
 
527 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3325  aldehyde dehydrogenase  44.51 
 
 
506 aa  345  1e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0844  aldehyde dehydrogenase  44.31 
 
 
508 aa  345  1e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36050  putative aldehyde dehydrogenase  45.33 
 
 
527 aa  345  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0976275  hitchhiker  0.00000000280554 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4272  Aldehyde Dehydrogenase  40.78 
 
 
489 aa  344  2e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3131  aldehyde dehydrogenase  43.91 
 
 
526 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2460  aldehyde dehydrogenase  45.38 
 
 
527 aa  343  4e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000205723 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5206  aldehyde dehydrogenase  45.92 
 
 
525 aa  343  5e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.222173 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3253  aldehyde dehydrogenase  44.11 
 
 
526 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.177644 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0864  aldehyde dehydrogenase  41.77 
 
 
528 aa  342  8e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.321546 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3374  aldehyde dehydrogenase  48.11 
 
 
508 aa  342  9e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05180  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  44.22 
 
 
525 aa  342  1e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4679  aldehyde dehydrogenase  45.92 
 
 
525 aa  342  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3045  aldehyde dehydrogenase  45.53 
 
 
525 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5321  aldehyde dehydrogenase  45.53 
 
 
525 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.711093 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3713  aldehyde dehydrogenase  45.08 
 
 
525 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4947  aldehyde dehydrogenase  45.17 
 
 
525 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4865  aldehyde dehydrogenase  45.67 
 
 
504 aa  339  5.9999999999999996e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.670882 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49290  Aldehyde dehydrogenase  43.82 
 
 
526 aa  339  8e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.213935  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1837  aldehyde dehydrogenase  44.66 
 
 
536 aa  338  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3323  aldehyde dehydrogenase family protein  42.89 
 
 
527 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559722  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5736  Aldehyde Dehydrogenase  44.4 
 
 
533 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.437114  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4199  aldehyde dehydrogenase  45.75 
 
 
522 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3912  dehydrogenase  43.99 
 
 
504 aa  337  2.9999999999999997e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0195751  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0328  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  45.13 
 
 
525 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3157  aldehyde dehydrogenase  42.69 
 
 
527 aa  336  5e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000809211  normal  0.137723 
 
 
-
 
NC_003296  RS05368  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase protein  45.29 
 
 
528 aa  335  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.588855  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2314  aldehyde dehydrogenase  43.23 
 
 
526 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0433257  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6431  aldehyde dehydrogenase  44.95 
 
 
530 aa  334  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00291714  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0186  aldehyde dehydrogenase family protein  45.63 
 
 
524 aa  333  3e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0233  aldehyde dehydrogenase  44.47 
 
 
490 aa  333  3e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0035  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  44.93 
 
 
526 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1470  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  44.93 
 
 
526 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5346  Aldehyde Dehydrogenase  44.16 
 
 
505 aa  333  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.671468 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2817  aldehyde dehydrogenase  44.22 
 
 
526 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106118  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1189  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  44.93 
 
 
656 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0042  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  44.93 
 
 
656 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3624  aldehyde dehydrogenase  44.07 
 
 
525 aa  332  1e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.186491  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4869  aldehyde dehydrogenase  47.28 
 
 
530 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4783  aldehyde dehydrogenase  47.28 
 
 
530 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.233271  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3101  aldehyde dehydrogenase  43.34 
 
 
526 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0043  aldehyde dehydrogenase  44.93 
 
 
526 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0253475  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5169  aldehyde dehydrogenase  47.49 
 
 
530 aa  330  3e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0593368 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0057  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  44.93 
 
 
526 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1541  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  44.93 
 
 
659 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.211116  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3078  aldehyde dehydrogenase  45.15 
 
 
528 aa  330  4e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.165309 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4441  aldehyde dehydrogenase  43.01 
 
 
526 aa  329  7e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4721  aldehyde dehydrogenase  47.41 
 
 
457 aa  329  7e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2501  Aldehyde Dehydrogenase  40.28 
 
 
537 aa  327  3e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.551853 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3602  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase  43.34 
 
 
526 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.133791  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2442  NADP-dependent fatty aldehyde dehydrogenase  46.85 
 
 
501 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4451  Aldehyde Dehydrogenase  47.2 
 
 
523 aa  326  6e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4585  Aldehyde Dehydrogenase  47.2 
 
 
523 aa  326  6e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414415  normal  0.785416 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1805  putative fatty aldehyde dehydrogenase  42.4 
 
 
527 aa  325  9e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00336157  normal  0.0125854 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3617  aldehyde dehydrogenase  45.43 
 
 
512 aa  325  1e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0036  aldehyde dehydrogenase  42.21 
 
 
538 aa  325  1e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4861  Aldehyde Dehydrogenase  42.4 
 
 
527 aa  325  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.187571 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2306  aldehyde dehydrogenase  40.86 
 
 
530 aa  325  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.862226  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5410  Aldehyde Dehydrogenase  44.35 
 
 
505 aa  323  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.263721  decreased coverage  0.00137707 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0038  aldehyde dehydrogenase  43.91 
 
 
526 aa  323  6e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3264  aldehyde dehydrogenase  43.28 
 
 
508 aa  322  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000455371 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4104  aldehyde dehydrogenase  43.72 
 
 
502 aa  321  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000295252 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6526  aldehyde dehydrogenase  43.6 
 
 
527 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.0487781 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0086  aldehyde dehydrogenase  45.95 
 
 
509 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.932272  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3952  Aldehyde Dehydrogenase  48.32 
 
 
580 aa  316  6e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2116  aldehyde dehydrogenase  44.03 
 
 
525 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.458004  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5585  Aldehyde Dehydrogenase  43.22 
 
 
482 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.553725  normal  0.902956 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2498  Aldehyde Dehydrogenase  43.39 
 
 
549 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4665  aldehyde dehydrogenase  44.64 
 
 
524 aa  312  6.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0350  Aldehyde Dehydrogenase  42.38 
 
 
537 aa  310  4e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>