More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3325 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5346  Aldehyde Dehydrogenase  69.18 
 
 		 505 aa  653    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.671468 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3869  aldehyde dehydrogenase  71.71 
 
 		 505 aa  721    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2442  NADP-dependent fatty aldehyde dehydrogenase  75 
 
 		 501 aa  714    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3912  dehydrogenase  70.48 
 
 		 504 aa  717    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0195751  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3656  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  71.71 
 
 		 508 aa  706    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4865  aldehyde dehydrogenase  73.11 
 
 		 504 aa  742    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.670882 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4104  aldehyde dehydrogenase  71.8 
 
 		 502 aa  681    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000295252 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3325  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 506 aa  1020    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0844  aldehyde dehydrogenase  64.61 
 
 		 508 aa  662    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3264  aldehyde dehydrogenase  71.12 
 
 		 508 aa  702    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000455371 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3394  aldehyde dehydrogenase  71.71 
 
 		 508 aa  685    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5410  Aldehyde Dehydrogenase  67.99 
 
 		 505 aa  634  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.263721  decreased coverage  0.00137707 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3374  aldehyde dehydrogenase  65.01 
 
 		 508 aa  602  1.0000000000000001e-171  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1140  aldehyde dehydrogenase  53.47 
 
 		 525 aa  503  1e-141  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3045  aldehyde dehydrogenase  54.55 
 
 		 525 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4679  aldehyde dehydrogenase  53.52 
 
 		 525 aa  502  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5206  aldehyde dehydrogenase  53.91 
 
 		 525 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.222173 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4441  aldehyde dehydrogenase  53.07 
 
 		 526 aa  501  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5321  aldehyde dehydrogenase  54.55 
 
 		 525 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.711093 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1256  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase  54.37 
 
 		 525 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.333102 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4947  aldehyde dehydrogenase  54.55 
 
 		 525 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0328  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  53.24 
 
 		 525 aa  498  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3399  aldehyde dehydrogenase  54.33 
 
 		 525 aa  497  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1283  aldehyde dehydrogenase  53.97 
 
 		 525 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.435 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4135  aldehyde dehydrogenase  53.97 
 
 		 525 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1470  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  52.37 
 
 		 526 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0035  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  52.37 
 
 		 526 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1541  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  52.37 
 
 		 659 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.211116  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0043  aldehyde dehydrogenase  52.37 
 
 		 526 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0253475  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2306  aldehyde dehydrogenase  53.35 
 
 		 530 aa  482  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.862226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0057  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  52.37 
 
 		 526 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4861  Aldehyde Dehydrogenase  52.27 
 
 		 527 aa  483  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.187571 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3078  aldehyde dehydrogenase  55.58 
 
 		 528 aa  483  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.165309 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1189  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  52.37 
 
 		 656 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0042  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  52.37 
 
 		 656 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2289  aldehyde dehydrogenase  50.59 
 
 		 525 aa  481  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1805  putative fatty aldehyde dehydrogenase  52.27 
 
 		 527 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00336157  normal  0.0125854 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003674  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase  50.21 
 
 		 510 aa  480  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.690417  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0038  aldehyde dehydrogenase  51.38 
 
 		 526 aa  477  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0186  aldehyde dehydrogenase family protein  55.03 
 
 		 524 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0227  aldehyde dehydrogenase  50.39 
 
 		 527 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3253  aldehyde dehydrogenase  53.17 
 
 		 526 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177644 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1998  aldehyde dehydrogenase  56.08 
 
 		 524 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0448113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6713  aldehyde dehydrogenase  52.94 
 
 		 529 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2364  aldehyde dehydrogenase  49.6 
 
 		 521 aa  462  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0248212  normal  0.117766 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4451  Aldehyde Dehydrogenase  54.3 
 
 		 523 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4585  Aldehyde Dehydrogenase  54.3 
 
 		 523 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414415  normal  0.785416 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0832  aldehyde dehydrogenase  50.59 
 
 		 525 aa  455  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0547808 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1031  aldehyde dehydrogenase  52.49 
 
 		 532 aa  457  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2585  aldehyde dehydrogenase family protein  51.59 
 
 		 526 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4199  aldehyde dehydrogenase  51.29 
 
 		 522 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49290  Aldehyde dehydrogenase  52.31 
 
 		 526 aa  452  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.213935  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6526  aldehyde dehydrogenase  52.27 
 
 		 527 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.0487781 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2116  aldehyde dehydrogenase  52.52 
 
 		 525 aa  451  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.458004  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05368  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase protein  54.41 
 
 		 528 aa  449  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.588855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3072  putative aldehyde dehydrogenase  50.99 
 
 		 527 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3224  aldehyde dehydrogenase  50.88 
 
 		 526 aa  451  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.169196  normal  0.562334 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05180  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  50.2 
 
 		 525 aa  451  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2314  aldehyde dehydrogenase  50.99 
 
 		 526 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0433257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4665  aldehyde dehydrogenase  54.29 
 
 		 524 aa  451  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3131  aldehyde dehydrogenase  51.19 
 
 		 526 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2670  aldehyde dehydrogenase  47.54 
 
 		 533 aa  450  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36050  putative aldehyde dehydrogenase  50.99 
 
 		 527 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0976275  hitchhiker  0.00000000280554 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3101  aldehyde dehydrogenase  50.6 
 
 		 526 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3323  aldehyde dehydrogenase family protein  50.1 
 
 		 527 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559722  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6431  aldehyde dehydrogenase  50.5 
 
 		 530 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00291714  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1897  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase  50.59 
 
 		 527 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.271045  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6846  Aldehyde Dehydrogenase  49.8 
 
 		 515 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29435 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3624  aldehyde dehydrogenase  50.51 
 
 		 525 aa  447  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.186491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0864  aldehyde dehydrogenase  48.95 
 
 		 528 aa  448  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.321546 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0036  aldehyde dehydrogenase  49.51 
 
 		 538 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3602  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase  50.99 
 
 		 526 aa  445  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.133791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3112  aldehyde dehydrogenase  51.09 
 
 		 527 aa  445  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3157  aldehyde dehydrogenase  49.9 
 
 		 527 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000809211  normal  0.137723 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3713  aldehyde dehydrogenase  51.09 
 
 		 525 aa  444  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3382  aldehyde dehydrogenase  50.69 
 
 		 530 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869145  normal  0.274011 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0350  Aldehyde Dehydrogenase  49.41 
 
 		 537 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4869  aldehyde dehydrogenase  51.57 
 
 		 530 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4029  aldehyde dehydrogenase  51.2 
 
 		 530 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123507  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4783  aldehyde dehydrogenase  51.57 
 
 		 530 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.233271  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4139  putative semialdehyde dehydrogenase  51.23 
 
 		 526 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.557422  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1702  aldehyde dehydrogenase  47 
 
 		 521 aa  437  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.124447  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1760  aldehyde dehydrogenase  47.92 
 
 		 521 aa  436  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000916491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4450  aldehyde dehydrogenase  50.4 
 
 		 530 aa  437  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.888148 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4229  aldehyde dehydrogenase  50.79 
 
 		 530 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.857739  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5169  aldehyde dehydrogenase  51.38 
 
 		 530 aa  438  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0593368 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5547  aldehyde dehydrogenase  48.81 
 
 		 507 aa  438  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0649354 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4137  aldehyde dehydrogenase  50.79 
 
 		 530 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0528665  normal  0.209657 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2498  Aldehyde Dehydrogenase  52.04 
 
 		 549 aa  434  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3617  aldehyde dehydrogenase  53.66 
 
 		 512 aa  432  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2460  aldehyde dehydrogenase  51.05 
 
 		 527 aa  435  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000205723 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1451  fatty aldehyde dehydrogenase  47.05 
 
 		 510 aa  430  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2824  aldehyde dehydrogenase  47.52 
 
 		 521 aa  431  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.614012 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2817  aldehyde dehydrogenase  48.81 
 
 		 526 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3548  aldehyde dehydrogenase  50.89 
 
 		 530 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1837  aldehyde dehydrogenase  51.66 
 
 		 536 aa  427  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1008  Aldehyde Dehydrogenase  45.69 
 
 		 536 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.69554 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0468  aldehyde dehydrogenase family protein  52.19 
 
 		 530 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315073  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2070  aldehyde dehydrogenase family protein  52.77 
 
 		 530 aa  422  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48010  putative semialdehyde dehydrogenase  51.05 
 
 		 526 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014327  normal  0.873423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>