More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3869 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5346  Aldehyde Dehydrogenase  76.74 
 
 		 505 aa  734    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.671468 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2442  NADP-dependent fatty aldehyde dehydrogenase  72.56 
 
 		 501 aa  699    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4104  aldehyde dehydrogenase  68.07 
 
 		 502 aa  657    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000295252 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3656  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  74.9 
 
 		 508 aa  733    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3912  dehydrogenase  68.59 
 
 		 504 aa  705    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0195751  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4865  aldehyde dehydrogenase  79.32 
 
 		 504 aa  811    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.670882 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3869  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 505 aa  1016    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3325  aldehyde dehydrogenase  71.71 
 
 		 506 aa  684    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3264  aldehyde dehydrogenase  78.04 
 
 		 508 aa  768    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000455371 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0844  aldehyde dehydrogenase  67.66 
 
 		 508 aa  682    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3394  aldehyde dehydrogenase  74.7 
 
 		 508 aa  714    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5410  Aldehyde Dehydrogenase  75.55 
 
 		 505 aa  716    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.263721  decreased coverage  0.00137707 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3374  aldehyde dehydrogenase  66.47 
 
 		 508 aa  624  1e-177  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4947  aldehyde dehydrogenase  53.57 
 
 		 525 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3045  aldehyde dehydrogenase  53.57 
 
 		 525 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5321  aldehyde dehydrogenase  53.57 
 
 		 525 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.711093 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5206  aldehyde dehydrogenase  52.98 
 
 		 525 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.222173 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0328  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  53.17 
 
 		 525 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4441  aldehyde dehydrogenase  51.98 
 
 		 526 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3399  aldehyde dehydrogenase  53.39 
 
 		 525 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4679  aldehyde dehydrogenase  52.78 
 
 		 525 aa  490  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4861  Aldehyde Dehydrogenase  53.4 
 
 		 527 aa  484  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.187571 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1805  putative fatty aldehyde dehydrogenase  54.26 
 
 		 527 aa  481  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00336157  normal  0.0125854 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2306  aldehyde dehydrogenase  53.3 
 
 		 530 aa  478  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.862226  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1256  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase  54.18 
 
 		 525 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.333102 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1283  aldehyde dehydrogenase  54.56 
 
 		 525 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.435 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3078  aldehyde dehydrogenase  56.21 
 
 		 528 aa  470  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.165309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4135  aldehyde dehydrogenase  53.83 
 
 		 525 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1140  aldehyde dehydrogenase  51.23 
 
 		 525 aa  467  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0227  aldehyde dehydrogenase  52.87 
 
 		 527 aa  464  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0186  aldehyde dehydrogenase family protein  51.59 
 
 		 524 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4585  Aldehyde Dehydrogenase  54.29 
 
 		 523 aa  455  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414415  normal  0.785416 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6713  aldehyde dehydrogenase  52 
 
 		 529 aa  457  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0038  aldehyde dehydrogenase  49.5 
 
 		 526 aa  457  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4451  Aldehyde Dehydrogenase  54.29 
 
 		 523 aa  455  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2364  aldehyde dehydrogenase  49.5 
 
 		 521 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0248212  normal  0.117766 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1470  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  49.9 
 
 		 526 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1189  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  49.51 
 
 		 656 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0035  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  49.9 
 
 		 526 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1541  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  49.51 
 
 		 659 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.211116  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0057  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  49.9 
 
 		 526 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003674  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase  48.94 
 
 		 510 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.690417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0043  aldehyde dehydrogenase  49.9 
 
 		 526 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0253475  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0042  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  49.51 
 
 		 656 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05368  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase protein  52.39 
 
 		 528 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.588855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6431  aldehyde dehydrogenase  52.06 
 
 		 530 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00291714  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2289  aldehyde dehydrogenase  47.42 
 
 		 525 aa  448  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5547  aldehyde dehydrogenase  50.64 
 
 		 507 aa  448  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0649354 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3617  aldehyde dehydrogenase  54.91 
 
 		 512 aa  447  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6526  aldehyde dehydrogenase  52.55 
 
 		 527 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.0487781 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1998  aldehyde dehydrogenase  52.61 
 
 		 524 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0448113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3253  aldehyde dehydrogenase  51.56 
 
 		 526 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177644 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0832  aldehyde dehydrogenase  52.11 
 
 		 525 aa  442  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0547808 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49290  Aldehyde dehydrogenase  51.27 
 
 		 526 aa  442  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.213935  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0036  aldehyde dehydrogenase  49.02 
 
 		 538 aa  443  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2585  aldehyde dehydrogenase family protein  51.11 
 
 		 526 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05180  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  51.06 
 
 		 525 aa  438  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1008  Aldehyde Dehydrogenase  48.68 
 
 		 536 aa  439  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.69554 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1760  aldehyde dehydrogenase  49.5 
 
 		 521 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000916491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4199  aldehyde dehydrogenase  50.99 
 
 		 522 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4665  aldehyde dehydrogenase  55.2 
 
 		 524 aa  441  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2460  aldehyde dehydrogenase  50.32 
 
 		 527 aa  437  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000205723 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3224  aldehyde dehydrogenase  49.26 
 
 		 526 aa  436  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.169196  normal  0.562334 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1897  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase  50.64 
 
 		 527 aa  435  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.271045  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0864  aldehyde dehydrogenase  48.31 
 
 		 528 aa  437  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.321546 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4450  aldehyde dehydrogenase  50.53 
 
 		 530 aa  436  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.888148 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3157  aldehyde dehydrogenase  51.13 
 
 		 527 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000809211  normal  0.137723 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3131  aldehyde dehydrogenase  50.67 
 
 		 526 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1702  aldehyde dehydrogenase  47 
 
 		 521 aa  432  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.124447  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2670  aldehyde dehydrogenase  47.21 
 
 		 533 aa  429  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3323  aldehyde dehydrogenase family protein  50.56 
 
 		 527 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559722  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2498  Aldehyde Dehydrogenase  52.94 
 
 		 549 aa  431  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4029  aldehyde dehydrogenase  49.1 
 
 		 530 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123507  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0350  Aldehyde Dehydrogenase  49.41 
 
 		 537 aa  432  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1031  aldehyde dehydrogenase  51.79 
 
 		 532 aa  431  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2824  aldehyde dehydrogenase  47.32 
 
 		 521 aa  431  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.614012 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3713  aldehyde dehydrogenase  49.01 
 
 		 525 aa  426  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2116  aldehyde dehydrogenase  50.22 
 
 		 525 aa  426  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.458004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2070  aldehyde dehydrogenase family protein  52.23 
 
 		 530 aa  428  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4229  aldehyde dehydrogenase  50.11 
 
 		 530 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.857739  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3382  aldehyde dehydrogenase  50.11 
 
 		 530 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869145  normal  0.274011 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4137  aldehyde dehydrogenase  50.11 
 
 		 530 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0528665  normal  0.209657 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0566  aldehyde dehydrogenase family protein  51.68 
 
 		 530 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1883  aldehyde dehydrogenase family protein  51.68 
 
 		 530 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3072  putative aldehyde dehydrogenase  50.11 
 
 		 527 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2314  aldehyde dehydrogenase  51.48 
 
 		 526 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0433257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6846  Aldehyde Dehydrogenase  47.71 
 
 		 515 aa  422  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29435 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3602  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase  51.03 
 
 		 526 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.133791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3101  aldehyde dehydrogenase  50.8 
 
 		 526 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1451  fatty aldehyde dehydrogenase  47.74 
 
 		 510 aa  419  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3112  aldehyde dehydrogenase  50.41 
 
 		 527 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0468  aldehyde dehydrogenase family protein  51.68 
 
 		 530 aa  422  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315073  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3548  aldehyde dehydrogenase  48.7 
 
 		 530 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36050  putative aldehyde dehydrogenase  49.89 
 
 		 527 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0976275  hitchhiker  0.00000000280554 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1422  aldehyde dehydrogenase family protein  51.23 
 
 		 530 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.24251  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0877  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  51.23 
 
 		 530 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.854859  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2192  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  51.23 
 
 		 530 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.65984  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4139  putative semialdehyde dehydrogenase  49.78 
 
 		 526 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.557422  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3624  aldehyde dehydrogenase  48.45 
 
 		 525 aa  409  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.186491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1529  fatty aldehyde dehydrogenase  45.74 
 
 		 515 aa  409  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.908196 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>