More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4721 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4721  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 457 aa  892    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5346  Aldehyde Dehydrogenase  53.44 
 
 		 485 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0811797 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3135  Aldehyde Dehydrogenase  52.29 
 
 		 483 aa  395  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.18311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1484  aldehyde dehydrogenase  51.39 
 
 		 497 aa  386  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0233  aldehyde dehydrogenase  51.09 
 
 		 490 aa  381  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3335  aldehyde dehydrogenase  51.36 
 
 		 489 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4676  aldehyde dehydrogenase  54.2 
 
 		 495 aa  377  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.310641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0786  Aldehyde Dehydrogenase  51.93 
 
 		 502 aa  356  3.9999999999999996e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0369146 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2306  aldehyde dehydrogenase  46.88 
 
 		 530 aa  348  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.862226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2116  aldehyde dehydrogenase  48.16 
 
 		 525 aa  346  4e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.458004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4869  aldehyde dehydrogenase  48.21 
 
 		 530 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4783  aldehyde dehydrogenase  48.21 
 
 		 530 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.233271  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1140  aldehyde dehydrogenase  44.21 
 
 		 525 aa  343  5e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5169  aldehyde dehydrogenase  48.12 
 
 		 530 aa  342  5.999999999999999e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0593368 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0832  aldehyde dehydrogenase  47.75 
 
 		 525 aa  342  7e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0547808 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3374  aldehyde dehydrogenase  46.43 
 
 		 508 aa  341  1e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3325  aldehyde dehydrogenase  46.07 
 
 		 506 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1706  putative aldehyde dehydrogenase  47.66 
 
 		 517 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155195  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4272  Aldehyde Dehydrogenase  43.07 
 
 		 489 aa  339  7e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3078  aldehyde dehydrogenase  47.5 
 
 		 528 aa  338  9.999999999999999e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.165309 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4113  Aldehyde Dehydrogenase  49.09 
 
 		 504 aa  338  9.999999999999999e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1086  aldehyde dehydrogenase  50.59 
 
 		 490 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0121968  decreased coverage  0.00153229 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3912  dehydrogenase  43.86 
 
 		 504 aa  337  3.9999999999999995e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0195751  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2442  NADP-dependent fatty aldehyde dehydrogenase  46.12 
 
 		 501 aa  336  5e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4679  aldehyde dehydrogenase  45.79 
 
 		 525 aa  335  7e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1760  aldehyde dehydrogenase  43.61 
 
 		 521 aa  335  1e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000916491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0328  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  45.57 
 
 		 525 aa  335  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0844  aldehyde dehydrogenase  46.64 
 
 		 508 aa  335  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003674  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase  42 
 
 		 510 aa  333  3e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.690417  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5206  aldehyde dehydrogenase  45.36 
 
 		 525 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.222173 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2824  aldehyde dehydrogenase  42.31 
 
 		 521 aa  333  5e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.614012 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4865  aldehyde dehydrogenase  44.12 
 
 		 504 aa  332  6e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.670882 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4947  aldehyde dehydrogenase  45.36 
 
 		 525 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5321  aldehyde dehydrogenase  45.14 
 
 		 525 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.711093 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3045  aldehyde dehydrogenase  45.14 
 
 		 525 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6431  aldehyde dehydrogenase  46.57 
 
 		 530 aa  332  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00291714  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1897  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase  45.28 
 
 		 527 aa  331  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.271045  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2395  Aldehyde Dehydrogenase  48.58 
 
 		 504 aa  330  2e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1283  aldehyde dehydrogenase  45.56 
 
 		 525 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1031  aldehyde dehydrogenase  45.31 
 
 		 532 aa  330  2e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4199  aldehyde dehydrogenase  46.53 
 
 		 522 aa  330  4e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0086  aldehyde dehydrogenase  48.76 
 
 		 509 aa  329  5.0000000000000004e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.932272  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1008  Aldehyde Dehydrogenase  45.76 
 
 		 536 aa  328  1.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.69554 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1998  aldehyde dehydrogenase  44.67 
 
 		 524 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0448113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3624  aldehyde dehydrogenase  47.24 
 
 		 525 aa  327  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.186491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0115  aldehyde dehydrogenase  49.31 
 
 		 495 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2670  aldehyde dehydrogenase  44.89 
 
 		 533 aa  327  3e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2289  aldehyde dehydrogenase  42.7 
 
 		 525 aa  327  3e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4104  aldehyde dehydrogenase  43.72 
 
 		 502 aa  326  4.0000000000000003e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000295252 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3713  aldehyde dehydrogenase  46.65 
 
 		 525 aa  325  7e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1256  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase  44.89 
 
 		 525 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.333102 
 
 
-
 
NC_003296  RS05368  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase protein  45.38 
 
 		 528 aa  325  9e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.588855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4665  aldehyde dehydrogenase  46.89 
 
 		 524 aa  325  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3131  aldehyde dehydrogenase  43.92 
 
 		 526 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2585  aldehyde dehydrogenase family protein  44.14 
 
 		 526 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3399  aldehyde dehydrogenase  44.73 
 
 		 525 aa  323  4e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0186  aldehyde dehydrogenase family protein  45.06 
 
 		 524 aa  323  4e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1702  aldehyde dehydrogenase  41.59 
 
 		 521 aa  322  6e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.124447  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3656  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  43.84 
 
 		 508 aa  322  8e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0227  aldehyde dehydrogenase  43.75 
 
 		 527 aa  322  8e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3869  aldehyde dehydrogenase  42.58 
 
 		 505 aa  322  9.000000000000001e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1529  fatty aldehyde dehydrogenase  42.57 
 
 		 515 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4451  Aldehyde Dehydrogenase  45.66 
 
 		 523 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4441  aldehyde dehydrogenase  43.78 
 
 		 526 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4585  Aldehyde Dehydrogenase  45.66 
 
 		 523 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414415  normal  0.785416 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3264  aldehyde dehydrogenase  43.63 
 
 		 508 aa  321  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000455371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3253  aldehyde dehydrogenase  43.79 
 
 		 526 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177644 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3617  aldehyde dehydrogenase  44.87 
 
 		 512 aa  321  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3382  aldehyde dehydrogenase  44.02 
 
 		 530 aa  319  5e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869145  normal  0.274011 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4137  aldehyde dehydrogenase  44.02 
 
 		 530 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0528665  normal  0.209657 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5547  aldehyde dehydrogenase  44.47 
 
 		 507 aa  318  9e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0649354 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4229  aldehyde dehydrogenase  44.02 
 
 		 530 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.857739  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4135  aldehyde dehydrogenase  45.33 
 
 		 525 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0864  aldehyde dehydrogenase  40.52 
 
 		 528 aa  318  1e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.321546 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5346  Aldehyde Dehydrogenase  45.84 
 
 		 505 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.671468 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3157  aldehyde dehydrogenase  43.72 
 
 		 527 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000809211  normal  0.137723 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1837  aldehyde dehydrogenase  43.95 
 
 		 536 aa  317  4e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4029  aldehyde dehydrogenase  44.09 
 
 		 530 aa  316  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123507  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1805  putative fatty aldehyde dehydrogenase  44.47 
 
 		 527 aa  317  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00336157  normal  0.0125854 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4450  aldehyde dehydrogenase  45.38 
 
 		 530 aa  316  7e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.888148 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3323  aldehyde dehydrogenase family protein  43.08 
 
 		 527 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559722  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0035  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  44.75 
 
 		 526 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2501  Aldehyde Dehydrogenase  42.47 
 
 		 537 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.551853 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1470  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  44.75 
 
 		 526 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0042  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  44.75 
 
 		 656 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1189  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  44.75 
 
 		 656 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6846  Aldehyde Dehydrogenase  43.88 
 
 		 515 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29435 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3224  aldehyde dehydrogenase  42.47 
 
 		 526 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.169196  normal  0.562334 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2364  aldehyde dehydrogenase  42.05 
 
 		 521 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0248212  normal  0.117766 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2460  aldehyde dehydrogenase  42.38 
 
 		 527 aa  313  5.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000205723 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2070  aldehyde dehydrogenase family protein  45.33 
 
 		 530 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05180  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  43.21 
 
 		 525 aa  312  7.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4861  Aldehyde Dehydrogenase  44.47 
 
 		 527 aa  312  9e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.187571 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5410  Aldehyde Dehydrogenase  44.27 
 
 		 505 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.263721  decreased coverage  0.00137707 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0043  aldehyde dehydrogenase  44.33 
 
 		 526 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0253475  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3072  putative aldehyde dehydrogenase  41.93 
 
 		 527 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1541  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  44.33 
 
 		 659 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.211116  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0057  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  44.4 
 
 		 526 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1743  aldehyde dehydrogenase  46.9 
 
 		 502 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0112208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1486  aldehyde dehydrogenase  48.47 
 
 		 485 aa  309  5.9999999999999995e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>