More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1529 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_1529  fatty aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
515 aa  1046    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2824  aldehyde dehydrogenase  57.06 
 
 
521 aa  593  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.614012 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2364  aldehyde dehydrogenase  54.35 
 
 
521 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0248212  normal  0.117766 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1760  aldehyde dehydrogenase  55.75 
 
 
521 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000916491  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1702  aldehyde dehydrogenase  52.83 
 
 
521 aa  558  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.124447  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1451  fatty aldehyde dehydrogenase  48.82 
 
 
510 aa  481  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0844  aldehyde dehydrogenase  49.9 
 
 
508 aa  456  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4865  aldehyde dehydrogenase  48.73 
 
 
504 aa  445  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.670882 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003674  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase  46.67 
 
 
510 aa  429  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.690417  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1031  aldehyde dehydrogenase  46.73 
 
 
532 aa  431  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4869  aldehyde dehydrogenase  47.71 
 
 
530 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2306  aldehyde dehydrogenase  46.57 
 
 
530 aa  424  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.862226  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3264  aldehyde dehydrogenase  46.51 
 
 
508 aa  422  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000455371 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1140  aldehyde dehydrogenase  46.45 
 
 
525 aa  424  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4783  aldehyde dehydrogenase  47.71 
 
 
530 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.233271  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4104  aldehyde dehydrogenase  48.61 
 
 
502 aa  421  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000295252 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3656  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  47.8 
 
 
508 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3394  aldehyde dehydrogenase  47.8 
 
 
508 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0832  aldehyde dehydrogenase  45.71 
 
 
525 aa  421  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0547808 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5169  aldehyde dehydrogenase  47.23 
 
 
530 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0593368 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4441  aldehyde dehydrogenase  45.02 
 
 
526 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3869  aldehyde dehydrogenase  45.74 
 
 
505 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3912  dehydrogenase  44.77 
 
 
504 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0195751  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3325  aldehyde dehydrogenase  47.52 
 
 
506 aa  412  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1256  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase  44.73 
 
 
525 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.333102 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3713  aldehyde dehydrogenase  44.92 
 
 
525 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5346  Aldehyde Dehydrogenase  46.35 
 
 
505 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.671468 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1008  Aldehyde Dehydrogenase  45.19 
 
 
536 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.69554 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1283  aldehyde dehydrogenase  45.13 
 
 
525 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.435 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0227  aldehyde dehydrogenase  44.55 
 
 
527 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2442  NADP-dependent fatty aldehyde dehydrogenase  46.69 
 
 
501 aa  403  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2116  aldehyde dehydrogenase  45.07 
 
 
525 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.458004  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6431  aldehyde dehydrogenase  45.9 
 
 
530 aa  403  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00291714  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2289  aldehyde dehydrogenase  44.56 
 
 
525 aa  402  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4135  aldehyde dehydrogenase  45.73 
 
 
525 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0043  aldehyde dehydrogenase  44.51 
 
 
526 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0253475  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0042  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  44.51 
 
 
656 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0035  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  44.51 
 
 
526 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1541  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  44.51 
 
 
659 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.211116  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1189  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  44.51 
 
 
656 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0057  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  44.51 
 
 
526 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1470  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  44.51 
 
 
526 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3078  aldehyde dehydrogenase  46.06 
 
 
528 aa  393  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.165309 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5410  Aldehyde Dehydrogenase  45.36 
 
 
505 aa  395  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.263721  decreased coverage  0.00137707 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4585  Aldehyde Dehydrogenase  47.22 
 
 
523 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414415  normal  0.785416 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4451  Aldehyde Dehydrogenase  47.22 
 
 
523 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3624  aldehyde dehydrogenase  45.13 
 
 
525 aa  395  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.186491  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0038  aldehyde dehydrogenase  43.7 
 
 
526 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4861  Aldehyde Dehydrogenase  42.57 
 
 
527 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.187571 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2670  aldehyde dehydrogenase  42.52 
 
 
533 aa  390  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05368  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase protein  46.37 
 
 
528 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.588855  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2460  aldehyde dehydrogenase  43.39 
 
 
527 aa  386  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000205723 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1805  putative fatty aldehyde dehydrogenase  42.63 
 
 
527 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00336157  normal  0.0125854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2501  Aldehyde Dehydrogenase  42.22 
 
 
537 aa  386  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.551853 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5321  aldehyde dehydrogenase  43.59 
 
 
525 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.711093 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4665  aldehyde dehydrogenase  45.96 
 
 
524 aa  385  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4450  aldehyde dehydrogenase  44.05 
 
 
530 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.888148 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3323  aldehyde dehydrogenase family protein  43.44 
 
 
527 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559722  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3224  aldehyde dehydrogenase  42.55 
 
 
526 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.169196  normal  0.562334 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0186  aldehyde dehydrogenase family protein  45.05 
 
 
524 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3382  aldehyde dehydrogenase  44.95 
 
 
530 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869145  normal  0.274011 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3399  aldehyde dehydrogenase  43.81 
 
 
525 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202581  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3045  aldehyde dehydrogenase  43.59 
 
 
525 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6713  aldehyde dehydrogenase  42.44 
 
 
529 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3072  putative aldehyde dehydrogenase  43.81 
 
 
527 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2585  aldehyde dehydrogenase family protein  43.53 
 
 
526 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3101  aldehyde dehydrogenase  43.55 
 
 
526 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4029  aldehyde dehydrogenase  43.71 
 
 
530 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123507  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0328  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  43.33 
 
 
525 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1897  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase  43.87 
 
 
527 aa  382  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.271045  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3131  aldehyde dehydrogenase  43.74 
 
 
526 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4947  aldehyde dehydrogenase  43.2 
 
 
525 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4272  Aldehyde Dehydrogenase  44.25 
 
 
489 aa  379  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5206  aldehyde dehydrogenase  43.15 
 
 
525 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.222173 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4679  aldehyde dehydrogenase  43.35 
 
 
525 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1998  aldehyde dehydrogenase  44.51 
 
 
524 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0448113  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5547  aldehyde dehydrogenase  43.87 
 
 
507 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0649354 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3157  aldehyde dehydrogenase  42.86 
 
 
527 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000809211  normal  0.137723 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4199  aldehyde dehydrogenase  43.3 
 
 
522 aa  377  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2314  aldehyde dehydrogenase  43.55 
 
 
526 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0433257  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6846  Aldehyde Dehydrogenase  42.94 
 
 
515 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.29435 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3374  aldehyde dehydrogenase  46 
 
 
508 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36050  putative aldehyde dehydrogenase  43.81 
 
 
527 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0976275  hitchhiker  0.00000000280554 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3602  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase  43.35 
 
 
526 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.133791  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0350  Aldehyde Dehydrogenase  44.53 
 
 
537 aa  375  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5736  Aldehyde Dehydrogenase  43.97 
 
 
533 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.437114  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4229  aldehyde dehydrogenase  44.33 
 
 
530 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.857739  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4137  aldehyde dehydrogenase  44.33 
 
 
530 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0528665  normal  0.209657 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2817  aldehyde dehydrogenase  41.97 
 
 
526 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106118  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49290  Aldehyde dehydrogenase  41.93 
 
 
526 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.213935  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3112  aldehyde dehydrogenase  42.35 
 
 
527 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0864  aldehyde dehydrogenase  40.7 
 
 
528 aa  372  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.321546 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3253  aldehyde dehydrogenase  43.48 
 
 
526 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.177644 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0036  aldehyde dehydrogenase  44.47 
 
 
538 aa  370  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4139  putative semialdehyde dehydrogenase  43.33 
 
 
526 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.557422  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0197  aldehyde dehydrogenase  46.6 
 
 
522 aa  367  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3617  aldehyde dehydrogenase  43.72 
 
 
512 aa  366  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05180  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  42.72 
 
 
525 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48010  putative semialdehyde dehydrogenase  43.53 
 
 
526 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014327  normal  0.873423 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3548  aldehyde dehydrogenase  43.78 
 
 
530 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623229  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>