More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1283 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1256  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase  96.76 
 
 
525 aa  989    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.333102 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4135  aldehyde dehydrogenase  92.38 
 
 
525 aa  924    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2306  aldehyde dehydrogenase  77.86 
 
 
530 aa  826    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.862226  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0186  aldehyde dehydrogenase family protein  64.24 
 
 
524 aa  638    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2289  aldehyde dehydrogenase  64.18 
 
 
525 aa  697    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1140  aldehyde dehydrogenase  66.79 
 
 
525 aa  714    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1283  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
525 aa  1048    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.435 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4585  Aldehyde Dehydrogenase  64.94 
 
 
523 aa  628  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414415  normal  0.785416 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4451  Aldehyde Dehydrogenase  64.94 
 
 
523 aa  628  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1031  aldehyde dehydrogenase  64.23 
 
 
532 aa  630  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1897  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase  63.72 
 
 
527 aa  625  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.271045  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4861  Aldehyde Dehydrogenase  60.99 
 
 
527 aa  624  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.187571 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5321  aldehyde dehydrogenase  63.62 
 
 
525 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.711093 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1805  putative fatty aldehyde dehydrogenase  60.8 
 
 
527 aa  624  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00336157  normal  0.0125854 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5206  aldehyde dehydrogenase  63.05 
 
 
525 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.222173 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3045  aldehyde dehydrogenase  63.62 
 
 
525 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4947  aldehyde dehydrogenase  63.62 
 
 
525 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3382  aldehyde dehydrogenase  63.92 
 
 
530 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869145  normal  0.274011 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4450  aldehyde dehydrogenase  64.49 
 
 
530 aa  619  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.888148 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4441  aldehyde dehydrogenase  61.11 
 
 
526 aa  619  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4679  aldehyde dehydrogenase  62.86 
 
 
525 aa  620  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3399  aldehyde dehydrogenase  62.86 
 
 
525 aa  615  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202581  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05368  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase protein  64.11 
 
 
528 aa  616  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.588855  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0328  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  63.24 
 
 
525 aa  617  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4137  aldehyde dehydrogenase  63.34 
 
 
530 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0528665  normal  0.209657 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4229  aldehyde dehydrogenase  63.34 
 
 
530 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.857739  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3713  aldehyde dehydrogenase  62.84 
 
 
525 aa  610  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3078  aldehyde dehydrogenase  63.17 
 
 
528 aa  603  1.0000000000000001e-171  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.165309 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4029  aldehyde dehydrogenase  62.96 
 
 
530 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123507  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6431  aldehyde dehydrogenase  61.3 
 
 
530 aa  599  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00291714  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3548  aldehyde dehydrogenase  63.34 
 
 
530 aa  600  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623229  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1470  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  60.15 
 
 
526 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0057  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  59.96 
 
 
526 aa  597  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0035  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  60.15 
 
 
526 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0043  aldehyde dehydrogenase  60.15 
 
 
526 aa  598  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0253475  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0042  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  60.15 
 
 
656 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1189  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  60.15 
 
 
656 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1541  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  60.15 
 
 
659 aa  596  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.211116  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0038  aldehyde dehydrogenase  59.96 
 
 
526 aa  597  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0832  aldehyde dehydrogenase  59.96 
 
 
525 aa  595  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0547808 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6526  aldehyde dehydrogenase  60.23 
 
 
527 aa  590  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.0487781 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0566  aldehyde dehydrogenase family protein  63.15 
 
 
530 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2116  aldehyde dehydrogenase  60.88 
 
 
525 aa  590  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.458004  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1883  aldehyde dehydrogenase family protein  63.15 
 
 
530 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0468  aldehyde dehydrogenase family protein  62.96 
 
 
530 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315073  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0877  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  62.96 
 
 
530 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.854859  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1422  aldehyde dehydrogenase family protein  62.96 
 
 
530 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.24251  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2192  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  62.96 
 
 
530 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.65984  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6713  aldehyde dehydrogenase  59.32 
 
 
529 aa  586  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3624  aldehyde dehydrogenase  61.64 
 
 
525 aa  582  1.0000000000000001e-165  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.186491  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3617  aldehyde dehydrogenase  63.35 
 
 
512 aa  580  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2070  aldehyde dehydrogenase family protein  62.38 
 
 
530 aa  580  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4783  aldehyde dehydrogenase  61.04 
 
 
530 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.233271  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4869  aldehyde dehydrogenase  61.04 
 
 
530 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6846  Aldehyde Dehydrogenase  59.45 
 
 
515 aa  571  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.29435 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5169  aldehyde dehydrogenase  60.84 
 
 
530 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0593368 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4665  aldehyde dehydrogenase  62.19 
 
 
524 aa  566  1e-160  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5547  aldehyde dehydrogenase  58.86 
 
 
507 aa  557  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0649354 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0350  Aldehyde Dehydrogenase  56.11 
 
 
537 aa  536  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0197  aldehyde dehydrogenase  64.3 
 
 
522 aa  532  1e-150  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0036  aldehyde dehydrogenase  55.22 
 
 
538 aa  535  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1008  Aldehyde Dehydrogenase  53.54 
 
 
536 aa  527  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.69554 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3253  aldehyde dehydrogenase  55.34 
 
 
526 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.177644 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2585  aldehyde dehydrogenase family protein  54.83 
 
 
526 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1998  aldehyde dehydrogenase  56.24 
 
 
524 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0448113  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2670  aldehyde dehydrogenase  52.94 
 
 
533 aa  516  1.0000000000000001e-145  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4199  aldehyde dehydrogenase  54.7 
 
 
522 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3131  aldehyde dehydrogenase  54.63 
 
 
526 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2314  aldehyde dehydrogenase  53.89 
 
 
526 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0433257  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0227  aldehyde dehydrogenase  51.53 
 
 
527 aa  509  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3101  aldehyde dehydrogenase  53.7 
 
 
526 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3602  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase  53.32 
 
 
526 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.133791  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3224  aldehyde dehydrogenase  52.96 
 
 
526 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.169196  normal  0.562334 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1631  aldehyde dehydrogenase family protein  59.39 
 
 
536 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.464757  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2460  aldehyde dehydrogenase  53.28 
 
 
527 aa  505  9.999999999999999e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000205723 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05180  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  52.4 
 
 
525 aa  503  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2498  Aldehyde Dehydrogenase  56.07 
 
 
549 aa  504  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49290  Aldehyde dehydrogenase  51.82 
 
 
526 aa  503  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.213935  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0864  aldehyde dehydrogenase  50.4 
 
 
528 aa  500  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.321546 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3323  aldehyde dehydrogenase family protein  51.63 
 
 
527 aa  501  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559722  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3157  aldehyde dehydrogenase  51.25 
 
 
527 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000809211  normal  0.137723 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3273  aldehyde dehydrogenase  50.38 
 
 
521 aa  500  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0985078 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5736  Aldehyde Dehydrogenase  52.99 
 
 
533 aa  499  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.437114  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3072  putative aldehyde dehydrogenase  52.68 
 
 
527 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2817  aldehyde dehydrogenase  52.37 
 
 
526 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106118  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36050  putative aldehyde dehydrogenase  52.87 
 
 
527 aa  497  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0976275  hitchhiker  0.00000000280554 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4865  aldehyde dehydrogenase  56.28 
 
 
504 aa  488  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.670882 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3112  aldehyde dehydrogenase  53.56 
 
 
527 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3869  aldehyde dehydrogenase  54.56 
 
 
505 aa  483  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3912  dehydrogenase  51.57 
 
 
504 aa  484  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0195751  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4139  putative semialdehyde dehydrogenase  55.32 
 
 
526 aa  482  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.557422  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3325  aldehyde dehydrogenase  53.97 
 
 
506 aa  475  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0844  aldehyde dehydrogenase  53.06 
 
 
508 aa  475  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48010  putative semialdehyde dehydrogenase  51.63 
 
 
526 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014327  normal  0.873423 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4104  aldehyde dehydrogenase  52.28 
 
 
502 aa  475  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000295252 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2364  aldehyde dehydrogenase  49.23 
 
 
521 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0248212  normal  0.117766 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1837  aldehyde dehydrogenase  53.96 
 
 
536 aa  464  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2501  Aldehyde Dehydrogenase  45.58 
 
 
537 aa  462  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.551853 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003674  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase  46.68 
 
 
510 aa  457  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.690417  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3656  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  52.38 
 
 
508 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>