More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1760 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_1760  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
521 aa  1071    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000916491  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2824  aldehyde dehydrogenase  78.31 
 
 
521 aa  853    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.614012 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2364  aldehyde dehydrogenase  67.75 
 
 
521 aa  733    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0248212  normal  0.117766 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1702  aldehyde dehydrogenase  71.4 
 
 
521 aa  781    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.124447  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1529  fatty aldehyde dehydrogenase  55.75 
 
 
515 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1451  fatty aldehyde dehydrogenase  51.07 
 
 
510 aa  483  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2306  aldehyde dehydrogenase  48.53 
 
 
530 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.862226  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3399  aldehyde dehydrogenase  48.46 
 
 
525 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202581  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4441  aldehyde dehydrogenase  47.86 
 
 
526 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1140  aldehyde dehydrogenase  47.84 
 
 
525 aa  456  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1283  aldehyde dehydrogenase  50.3 
 
 
525 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.435 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0832  aldehyde dehydrogenase  47.45 
 
 
525 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0547808 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0844  aldehyde dehydrogenase  49.51 
 
 
508 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4679  aldehyde dehydrogenase  47.68 
 
 
525 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3624  aldehyde dehydrogenase  47.85 
 
 
525 aa  450  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.186491  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4861  Aldehyde Dehydrogenase  47.16 
 
 
527 aa  451  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.187571 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5206  aldehyde dehydrogenase  47.49 
 
 
525 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.222173 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1256  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase  49.5 
 
 
525 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.333102 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4865  aldehyde dehydrogenase  49.51 
 
 
504 aa  446  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.670882 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6431  aldehyde dehydrogenase  48.14 
 
 
530 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00291714  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3713  aldehyde dehydrogenase  46.86 
 
 
525 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3869  aldehyde dehydrogenase  49.5 
 
 
505 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4104  aldehyde dehydrogenase  50 
 
 
502 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000295252 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0328  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  46.91 
 
 
525 aa  443  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3078  aldehyde dehydrogenase  49.61 
 
 
528 aa  444  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.165309 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1805  putative fatty aldehyde dehydrogenase  46.58 
 
 
527 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00336157  normal  0.0125854 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2289  aldehyde dehydrogenase  45.69 
 
 
525 aa  444  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5321  aldehyde dehydrogenase  46.91 
 
 
525 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.711093 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3045  aldehyde dehydrogenase  46.91 
 
 
525 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1031  aldehyde dehydrogenase  47.95 
 
 
532 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0038  aldehyde dehydrogenase  44.94 
 
 
526 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4947  aldehyde dehydrogenase  46.91 
 
 
525 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2442  NADP-dependent fatty aldehyde dehydrogenase  50.4 
 
 
501 aa  439  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0186  aldehyde dehydrogenase family protein  47.37 
 
 
524 aa  436  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1189  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  44.36 
 
 
656 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0057  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  44.36 
 
 
526 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3394  aldehyde dehydrogenase  49.3 
 
 
508 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6713  aldehyde dehydrogenase  46.47 
 
 
529 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0035  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  44.36 
 
 
526 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1541  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  44.44 
 
 
659 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.211116  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3656  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  49.3 
 
 
508 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1470  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  44.36 
 
 
526 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0043  aldehyde dehydrogenase  44.36 
 
 
526 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0253475  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0042  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  44.36 
 
 
656 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5169  aldehyde dehydrogenase  47.31 
 
 
530 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0593368 
 
 
-
 
NC_003296  RS05368  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase protein  48.28 
 
 
528 aa  431  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.588855  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4869  aldehyde dehydrogenase  47.13 
 
 
530 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4783  aldehyde dehydrogenase  47.13 
 
 
530 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.233271  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4135  aldehyde dehydrogenase  49.3 
 
 
525 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3264  aldehyde dehydrogenase  49.31 
 
 
508 aa  425  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000455371 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2460  aldehyde dehydrogenase  45.99 
 
 
527 aa  426  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000205723 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3325  aldehyde dehydrogenase  46.93 
 
 
506 aa  426  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3912  dehydrogenase  46.44 
 
 
504 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0195751  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3323  aldehyde dehydrogenase family protein  45.63 
 
 
527 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559722  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4272  Aldehyde Dehydrogenase  47 
 
 
489 aa  419  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5346  Aldehyde Dehydrogenase  48.62 
 
 
505 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.671468 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1998  aldehyde dehydrogenase  47.56 
 
 
524 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0448113  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1897  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase  46.12 
 
 
527 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.271045  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36050  putative aldehyde dehydrogenase  45.79 
 
 
527 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0976275  hitchhiker  0.00000000280554 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3157  aldehyde dehydrogenase  45.24 
 
 
527 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000809211  normal  0.137723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3382  aldehyde dehydrogenase  46.2 
 
 
530 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869145  normal  0.274011 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2670  aldehyde dehydrogenase  45.56 
 
 
533 aa  414  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3072  putative aldehyde dehydrogenase  45.79 
 
 
527 aa  415  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003674  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase  45.12 
 
 
510 aa  414  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.690417  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3374  aldehyde dehydrogenase  48.21 
 
 
508 aa  410  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5410  Aldehyde Dehydrogenase  48.02 
 
 
505 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.263721  decreased coverage  0.00137707 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0227  aldehyde dehydrogenase  44.64 
 
 
527 aa  409  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4450  aldehyde dehydrogenase  45.81 
 
 
530 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.888148 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4229  aldehyde dehydrogenase  45.7 
 
 
530 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.857739  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4137  aldehyde dehydrogenase  45.7 
 
 
530 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0528665  normal  0.209657 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4585  Aldehyde Dehydrogenase  47.15 
 
 
523 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414415  normal  0.785416 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4451  Aldehyde Dehydrogenase  47.15 
 
 
523 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2314  aldehyde dehydrogenase  46.78 
 
 
526 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0433257  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4029  aldehyde dehydrogenase  45.03 
 
 
530 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123507  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49290  Aldehyde dehydrogenase  45.81 
 
 
526 aa  408  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.213935  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3101  aldehyde dehydrogenase  46.39 
 
 
526 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05180  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  45.61 
 
 
525 aa  406  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3548  aldehyde dehydrogenase  45.81 
 
 
530 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623229  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0036  aldehyde dehydrogenase  44.83 
 
 
538 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0864  aldehyde dehydrogenase  42.97 
 
 
528 aa  403  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.321546 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2070  aldehyde dehydrogenase family protein  45.44 
 
 
530 aa  404  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2116  aldehyde dehydrogenase  44.92 
 
 
525 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.458004  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6526  aldehyde dehydrogenase  45.01 
 
 
527 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.0487781 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3602  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase  46.2 
 
 
526 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.133791  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2817  aldehyde dehydrogenase  45.61 
 
 
526 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106118  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3224  aldehyde dehydrogenase  44.57 
 
 
526 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.169196  normal  0.562334 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2585  aldehyde dehydrogenase family protein  45.06 
 
 
526 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3253  aldehyde dehydrogenase  45.85 
 
 
526 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.177644 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0468  aldehyde dehydrogenase family protein  44.34 
 
 
530 aa  398  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315073  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1883  aldehyde dehydrogenase family protein  44.34 
 
 
530 aa  399  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4139  putative semialdehyde dehydrogenase  43.84 
 
 
526 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.557422  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5547  aldehyde dehydrogenase  44.58 
 
 
507 aa  398  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0649354 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4665  aldehyde dehydrogenase  46.86 
 
 
524 aa  395  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3131  aldehyde dehydrogenase  45.26 
 
 
526 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0566  aldehyde dehydrogenase family protein  44.34 
 
 
530 aa  399  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2192  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  44.14 
 
 
530 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.65984  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4199  aldehyde dehydrogenase  44.9 
 
 
522 aa  393  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1422  aldehyde dehydrogenase family protein  44.14 
 
 
530 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.24251  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0877  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  44.14 
 
 
530 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.854859  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3617  aldehyde dehydrogenase  45.95 
 
 
512 aa  393  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>