More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0086 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0086  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
509 aa  1004    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.932272  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5346  Aldehyde Dehydrogenase  51.32 
 
 
485 aa  391  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0811797 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4676  aldehyde dehydrogenase  52.59 
 
 
495 aa  387  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.310641  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3135  Aldehyde Dehydrogenase  46.92 
 
 
483 aa  373  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.18311 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3335  aldehyde dehydrogenase  47.17 
 
 
489 aa  363  6e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0786  Aldehyde Dehydrogenase  50.22 
 
 
502 aa  347  3e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0369146 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1484  aldehyde dehydrogenase  45.95 
 
 
497 aa  344  2e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1140  aldehyde dehydrogenase  42.62 
 
 
525 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0233  aldehyde dehydrogenase  45.76 
 
 
490 aa  335  1e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4113  Aldehyde Dehydrogenase  44.57 
 
 
504 aa  334  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2289  aldehyde dehydrogenase  41.58 
 
 
525 aa  334  2e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4199  aldehyde dehydrogenase  44.49 
 
 
522 aa  333  5e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0844  aldehyde dehydrogenase  43.79 
 
 
508 aa  332  9e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3624  aldehyde dehydrogenase  46.06 
 
 
525 aa  331  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.186491  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2585  aldehyde dehydrogenase family protein  41.7 
 
 
526 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3131  aldehyde dehydrogenase  41.49 
 
 
526 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1256  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase  43.83 
 
 
525 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.333102 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1706  putative aldehyde dehydrogenase  45.65 
 
 
517 aa  327  3e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155195  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2306  aldehyde dehydrogenase  43.01 
 
 
530 aa  326  6e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.862226  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3253  aldehyde dehydrogenase  41.91 
 
 
526 aa  326  7e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.177644 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1283  aldehyde dehydrogenase  43.4 
 
 
525 aa  325  9e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.435 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5206  aldehyde dehydrogenase  42.36 
 
 
525 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.222173 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1086  aldehyde dehydrogenase  47.49 
 
 
490 aa  325  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0121968  decreased coverage  0.00153229 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3399  aldehyde dehydrogenase  43.71 
 
 
525 aa  324  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202581  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4665  aldehyde dehydrogenase  44.92 
 
 
524 aa  324  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2395  Aldehyde Dehydrogenase  46.14 
 
 
504 aa  324  3e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3125  aldehyde dehydrogenase  45.37 
 
 
502 aa  323  4e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4679  aldehyde dehydrogenase  42.15 
 
 
525 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003674  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase  41.96 
 
 
510 aa  323  4e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.690417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5169  aldehyde dehydrogenase  44.71 
 
 
530 aa  323  6e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0593368 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4721  aldehyde dehydrogenase  48.76 
 
 
457 aa  322  7e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0186  aldehyde dehydrogenase family protein  45.24 
 
 
524 aa  323  7e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1031  aldehyde dehydrogenase  44.23 
 
 
532 aa  322  7e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4441  aldehyde dehydrogenase  43.01 
 
 
526 aa  322  8e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0036  aldehyde dehydrogenase  42.74 
 
 
538 aa  322  8e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4869  aldehyde dehydrogenase  44.28 
 
 
530 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0328  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  42.98 
 
 
525 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4783  aldehyde dehydrogenase  44.28 
 
 
530 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.233271  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5736  Aldehyde Dehydrogenase  42.52 
 
 
533 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.437114  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3045  aldehyde dehydrogenase  42.77 
 
 
525 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5321  aldehyde dehydrogenase  42.77 
 
 
525 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.711093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1486  aldehyde dehydrogenase  46.33 
 
 
485 aa  320  5e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4947  aldehyde dehydrogenase  42.98 
 
 
525 aa  319  9e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4585  Aldehyde Dehydrogenase  43.2 
 
 
523 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414415  normal  0.785416 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4451  Aldehyde Dehydrogenase  43.2 
 
 
523 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1998  aldehyde dehydrogenase  42.46 
 
 
524 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0448113  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3912  dehydrogenase  43.07 
 
 
504 aa  317  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0195751  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0038  aldehyde dehydrogenase  42.95 
 
 
526 aa  317  3e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2498  Aldehyde Dehydrogenase  43.84 
 
 
549 aa  317  3e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3656  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  43.55 
 
 
508 aa  317  4e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6431  aldehyde dehydrogenase  43.36 
 
 
530 aa  316  5e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00291714  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2116  aldehyde dehydrogenase  44.51 
 
 
525 aa  316  6e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.458004  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4272  Aldehyde Dehydrogenase  39.12 
 
 
489 aa  316  8e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3617  aldehyde dehydrogenase  43.01 
 
 
512 aa  316  8e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05368  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase protein  43.39 
 
 
528 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.588855  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1805  putative fatty aldehyde dehydrogenase  42.04 
 
 
527 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00336157  normal  0.0125854 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3325  aldehyde dehydrogenase  44.57 
 
 
506 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1008  Aldehyde Dehydrogenase  41.42 
 
 
536 aa  315  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.69554 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4861  Aldehyde Dehydrogenase  42 
 
 
527 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.187571 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1897  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase  43.97 
 
 
527 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.271045  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2670  aldehyde dehydrogenase  40.99 
 
 
533 aa  312  7.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4029  aldehyde dehydrogenase  43.75 
 
 
530 aa  312  9e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123507  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0043  aldehyde dehydrogenase  42.98 
 
 
526 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0253475  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0832  aldehyde dehydrogenase  41.41 
 
 
525 aa  312  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0547808 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3394  aldehyde dehydrogenase  43.76 
 
 
508 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4450  aldehyde dehydrogenase  43.97 
 
 
530 aa  311  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.888148 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1541  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  42.98 
 
 
659 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.211116  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0057  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  42.98 
 
 
526 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1702  aldehyde dehydrogenase  38.98 
 
 
521 aa  311  2e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.124447  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1743  aldehyde dehydrogenase  44.76 
 
 
502 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0112208  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0350  Aldehyde Dehydrogenase  42.92 
 
 
537 aa  311  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48010  putative semialdehyde dehydrogenase  41.68 
 
 
526 aa  310  4e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014327  normal  0.873423 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1470  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  42.77 
 
 
526 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0035  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  42.77 
 
 
526 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0042  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  42.77 
 
 
656 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1189  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  42.77 
 
 
656 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0864  aldehyde dehydrogenase  37.16 
 
 
528 aa  309  8e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.321546 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4135  aldehyde dehydrogenase  42.98 
 
 
525 aa  309  9e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3078  aldehyde dehydrogenase  44.61 
 
 
528 aa  308  2.0000000000000002e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.165309 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3374  aldehyde dehydrogenase  44.32 
 
 
508 aa  307  3e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3382  aldehyde dehydrogenase  44.3 
 
 
530 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869145  normal  0.274011 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4229  aldehyde dehydrogenase  43.54 
 
 
530 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.857739  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4137  aldehyde dehydrogenase  43.54 
 
 
530 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0528665  normal  0.209657 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3224  aldehyde dehydrogenase  40.43 
 
 
526 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.169196  normal  0.562334 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2070  aldehyde dehydrogenase family protein  44.61 
 
 
530 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2364  aldehyde dehydrogenase  39.19 
 
 
521 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0248212  normal  0.117766 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0227  aldehyde dehydrogenase  40.17 
 
 
527 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0468  aldehyde dehydrogenase family protein  43.97 
 
 
530 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315073  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1837  aldehyde dehydrogenase  39.74 
 
 
536 aa  303  4.0000000000000003e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4139  putative semialdehyde dehydrogenase  40.67 
 
 
526 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.557422  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3869  aldehyde dehydrogenase  41.39 
 
 
505 aa  303  6.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0037  aldehyde dehydrogenase  43.27 
 
 
537 aa  303  6.000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3548  aldehyde dehydrogenase  42.8 
 
 
530 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623229  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1883  aldehyde dehydrogenase family protein  43.97 
 
 
530 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0566  aldehyde dehydrogenase family protein  43.97 
 
 
530 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4865  aldehyde dehydrogenase  42.49 
 
 
504 aa  300  3e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.670882 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49290  Aldehyde dehydrogenase  40.55 
 
 
526 aa  300  5e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.213935  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05180  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  40.55 
 
 
525 aa  299  7e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3112  aldehyde dehydrogenase  40.17 
 
 
527 aa  299  8e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1422  aldehyde dehydrogenase family protein  43.89 
 
 
530 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.24251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>