More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5096 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5096  2-ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase / NADP-dependent aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 495 aa  993    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.845756  normal  0.435826 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0115  aldehyde dehydrogenase  58.9 
 
 		 495 aa  477  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2298  aldehyde dehydrogenase  55.78 
 
 		 490 aa  444  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.195792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3869  aldehyde dehydrogenase  42.61 
 
 		 505 aa  340  4e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3656  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  42.86 
 
 		 508 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3135  Aldehyde Dehydrogenase  46.4 
 
 		 483 aa  335  1e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.18311 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4865  aldehyde dehydrogenase  42.29 
 
 		 504 aa  332  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.670882 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3912  dehydrogenase  40.87 
 
 		 504 aa  330  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0195751  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3394  aldehyde dehydrogenase  42.42 
 
 		 508 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5346  Aldehyde Dehydrogenase  43.04 
 
 		 505 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.671468 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003674  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase  40.09 
 
 		 510 aa  324  2e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.690417  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3374  aldehyde dehydrogenase  43.5 
 
 		 508 aa  323  4e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3335  aldehyde dehydrogenase  45.33 
 
 		 489 aa  322  9.999999999999999e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2306  aldehyde dehydrogenase  43.07 
 
 		 530 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.862226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1140  aldehyde dehydrogenase  41.24 
 
 		 525 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3325  aldehyde dehydrogenase  43.34 
 
 		 506 aa  318  1e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0844  aldehyde dehydrogenase  42.08 
 
 		 508 aa  318  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6431  aldehyde dehydrogenase  41.04 
 
 		 530 aa  315  9e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00291714  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5410  Aldehyde Dehydrogenase  43.94 
 
 		 505 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.263721  decreased coverage  0.00137707 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2442  NADP-dependent fatty aldehyde dehydrogenase  41.65 
 
 		 501 aa  315  9.999999999999999e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4104  aldehyde dehydrogenase  41.12 
 
 		 502 aa  313  3.9999999999999997e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000295252 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0227  aldehyde dehydrogenase  40.53 
 
 		 527 aa  311  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3264  aldehyde dehydrogenase  41.65 
 
 		 508 aa  311  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000455371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1484  aldehyde dehydrogenase  43.46 
 
 		 497 aa  311  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1256  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase  42.26 
 
 		 525 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.333102 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4441  aldehyde dehydrogenase  39.26 
 
 		 526 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2501  Aldehyde Dehydrogenase  38.53 
 
 		 537 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.551853 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2116  aldehyde dehydrogenase  42.14 
 
 		 525 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.458004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1008  Aldehyde Dehydrogenase  39.1 
 
 		 536 aa  306  7e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.69554 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3253  aldehyde dehydrogenase  41.39 
 
 		 526 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177644 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2585  aldehyde dehydrogenase family protein  41.39 
 
 		 526 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5736  Aldehyde Dehydrogenase  42.4 
 
 		 533 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.437114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3131  aldehyde dehydrogenase  41.16 
 
 		 526 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0832  aldehyde dehydrogenase  40.08 
 
 		 525 aa  301  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0547808 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4113  Aldehyde Dehydrogenase  43.15 
 
 		 504 aa  300  3e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1805  putative fatty aldehyde dehydrogenase  40.54 
 
 		 527 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00336157  normal  0.0125854 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1283  aldehyde dehydrogenase  41.37 
 
 		 525 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.435 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1743  aldehyde dehydrogenase  43.21 
 
 		 502 aa  299  7e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0112208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1998  aldehyde dehydrogenase  42.31 
 
 		 524 aa  299  9e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0448113  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2498  Aldehyde Dehydrogenase  44.95 
 
 		 549 aa  298  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4869  aldehyde dehydrogenase  41.59 
 
 		 530 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4783  aldehyde dehydrogenase  41.59 
 
 		 530 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.233271  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4861  Aldehyde Dehydrogenase  38.84 
 
 		 527 aa  296  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.187571 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5585  Aldehyde Dehydrogenase  38.96 
 
 		 482 aa  296  5e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.553725  normal  0.902956 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1706  putative aldehyde dehydrogenase  41.99 
 
 		 517 aa  296  7e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155195  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5169  aldehyde dehydrogenase  40.86 
 
 		 530 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0593368 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5346  Aldehyde Dehydrogenase  42.86 
 
 		 485 aa  295  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0811797 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3713  aldehyde dehydrogenase  40.34 
 
 		 525 aa  295  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4139  putative semialdehyde dehydrogenase  40.81 
 
 		 526 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.557422  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0186  aldehyde dehydrogenase family protein  42.26 
 
 		 524 aa  294  3e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0864  aldehyde dehydrogenase  38.01 
 
 		 528 aa  293  3e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.321546 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1086  aldehyde dehydrogenase  46.82 
 
 		 490 aa  293  3e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0121968  decreased coverage  0.00153229 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1702  aldehyde dehydrogenase  37.45 
 
 		 521 aa  293  4e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.124447  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3224  aldehyde dehydrogenase  40.87 
 
 		 526 aa  293  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.169196  normal  0.562334 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2670  aldehyde dehydrogenase  38.4 
 
 		 533 aa  293  4e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4029  aldehyde dehydrogenase  42.76 
 
 		 530 aa  293  6e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123507  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4272  Aldehyde Dehydrogenase  38.95 
 
 		 489 aa  291  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4451  Aldehyde Dehydrogenase  42.04 
 
 		 523 aa  292  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48010  putative semialdehyde dehydrogenase  41.26 
 
 		 526 aa  292  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014327  normal  0.873423 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4585  Aldehyde Dehydrogenase  42.04 
 
 		 523 aa  292  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414415  normal  0.785416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1486  aldehyde dehydrogenase  44.71 
 
 		 485 aa  291  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4135  aldehyde dehydrogenase  42.42 
 
 		 525 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4947  aldehyde dehydrogenase  40.09 
 
 		 525 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6846  Aldehyde Dehydrogenase  40 
 
 		 515 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29435 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3078  aldehyde dehydrogenase  41.72 
 
 		 528 aa  290  3e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.165309 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2364  aldehyde dehydrogenase  39.09 
 
 		 521 aa  291  3e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0248212  normal  0.117766 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5547  aldehyde dehydrogenase  39.31 
 
 		 507 aa  290  4e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0649354 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1883  aldehyde dehydrogenase family protein  42.6 
 
 		 530 aa  290  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0566  aldehyde dehydrogenase family protein  42.6 
 
 		 530 aa  290  6e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4199  aldehyde dehydrogenase  41.83 
 
 		 522 aa  289  8e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3101  aldehyde dehydrogenase  40.04 
 
 		 526 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3548  aldehyde dehydrogenase  42.55 
 
 		 530 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623229  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05368  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase protein  41.46 
 
 		 528 aa  287  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.588855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1837  aldehyde dehydrogenase  40.18 
 
 		 536 aa  288  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3045  aldehyde dehydrogenase  39.66 
 
 		 525 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4721  aldehyde dehydrogenase  45.12 
 
 		 457 aa  288  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5321  aldehyde dehydrogenase  39.66 
 
 		 525 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.711093 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0468  aldehyde dehydrogenase family protein  42.38 
 
 		 530 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315073  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3602  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase  40.98 
 
 		 526 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.133791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49290  Aldehyde dehydrogenase  40.18 
 
 		 526 aa  287  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.213935  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7805  Aldehyde Dehydrogenase  42.16 
 
 		 471 aa  287  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1451  fatty aldehyde dehydrogenase  38.92 
 
 		 510 aa  286  4e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2314  aldehyde dehydrogenase  38.91 
 
 		 526 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0433257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1897  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase  42.04 
 
 		 527 aa  285  9e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.271045  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3399  aldehyde dehydrogenase  40.38 
 
 		 525 aa  285  9e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202581  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1422  aldehyde dehydrogenase family protein  42.38 
 
 		 530 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.24251  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0328  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  39.66 
 
 		 525 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05180  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  40.41 
 
 		 525 aa  285  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2192  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  42.38 
 
 		 530 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.65984  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36050  putative aldehyde dehydrogenase  40.36 
 
 		 527 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0976275  hitchhiker  0.00000000280554 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0877  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  42.38 
 
 		 530 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.854859  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0786  Aldehyde Dehydrogenase  45.43 
 
 		 502 aa  284  2.0000000000000002e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0369146 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3072  putative aldehyde dehydrogenase  40.36 
 
 		 527 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3382  aldehyde dehydrogenase  43.36 
 
 		 530 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869145  normal  0.274011 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4229  aldehyde dehydrogenase  43.43 
 
 		 530 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.857739  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5206  aldehyde dehydrogenase  39.78 
 
 		 525 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.222173 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4137  aldehyde dehydrogenase  43.43 
 
 		 530 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0528665  normal  0.209657 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4665  aldehyde dehydrogenase  42.79 
 
 		 524 aa  283  4.0000000000000003e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4679  aldehyde dehydrogenase  39.78 
 
 		 525 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2070  aldehyde dehydrogenase family protein  43.4 
 
 		 530 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>