More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5422 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_5422  aldo/keto reductase  100 
 
 
316 aa  646    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5330  aldo/keto reductase  74.22 
 
 
333 aa  487  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1266  aldo/keto reductase  74.69 
 
 
331 aa  473  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6222  aldo/keto reductase  57.24 
 
 
302 aa  347  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7084  aldo/keto reductase  60.67 
 
 
301 aa  339  4e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3208  aldo/keto reductase  58.04 
 
 
323 aa  317  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00561471  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2106  aldo/keto reductase  54.27 
 
 
314 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1798  twin-arginine translocation pathway signal  44.92 
 
 
308 aa  285  5e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.116127  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2471  aldo/keto reductase  49.44 
 
 
312 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.367665 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49120  Aldo/keto reductase  50.38 
 
 
305 aa  271  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0384545  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26350  Aldo/keto reductase protein  46.84 
 
 
307 aa  270  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0310  aldo/keto reductase  47.41 
 
 
309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2819  aldo/keto reductase  48.5 
 
 
317 aa  267  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.842326  normal  0.173648 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0028  aldo/keto reductase  46.08 
 
 
311 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277769  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1065  aldo/keto reductase  50 
 
 
310 aa  263  4e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0376  aldo/keto reductase  50 
 
 
306 aa  261  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3859  aldo/keto reductase  45.79 
 
 
309 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665179  normal  0.078293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4168  aldo/keto reductase  45.79 
 
 
309 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.528392 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4003  aldo/keto reductase  47.35 
 
 
271 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444769  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2662  aldo/keto reductase  43.96 
 
 
302 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1200  putative oxidoreductase protein  46.13 
 
 
305 aa  248  9e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1231  aldo/keto reductase  45.71 
 
 
302 aa  245  8e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3249  aldo/keto reductase  44.4 
 
 
272 aa  242  6e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4318  aldo/keto reductase  46.79 
 
 
317 aa  242  7e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443363  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2644  aldo/keto reductase  44.74 
 
 
303 aa  241  9e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.077473  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4782  putative aldo/keto reductase  45.93 
 
 
307 aa  239  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.476662 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2513  aldo/keto reductase  42.47 
 
 
303 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1371  aldo/keto reductase  44.33 
 
 
304 aa  236  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0446  aldo/keto reductase  44.7 
 
 
301 aa  235  6e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4332  aldo/keto reductase  44.78 
 
 
305 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00722247 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0575  twin-arginine translocation pathway signal  41.81 
 
 
345 aa  228  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.451662  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0777  aldo/keto reductase  39.25 
 
 
296 aa  225  9e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0409977  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1310  putative oxidoreductase protein  46.56 
 
 
277 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.679533  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5296  aldo/keto reductase  33.33 
 
 
271 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107588  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2824  putative aldo/keto reductase  28.62 
 
 
279 aa  89.7  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1082  aldo/keto reductase  26.22 
 
 
274 aa  86.3  6e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1038  aldo/keto reductase  26.22 
 
 
274 aa  86.3  6e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5289  aldo/keto reductase  30.27 
 
 
279 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  28.08 
 
 
343 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  28.08 
 
 
343 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5799  aldo/keto reductase  28.06 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0553  aldo/keto reductase  29.13 
 
 
281 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0509974 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1602  aldo/keto reductase  25.56 
 
 
281 aa  79.7  0.00000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  27.76 
 
 
343 aa  79.3  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0138  aldo/keto reductase  27.17 
 
 
279 aa  78.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3226  aldo/keto reductase  27.63 
 
 
277 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593826  normal  0.135876 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0329  aldo/keto reductase  34.86 
 
 
280 aa  78.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  27.99 
 
 
353 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  28.76 
 
 
350 aa  79  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3505  aldo/keto reductase  27.71 
 
 
344 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0784  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.74 
 
 
281 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.756682  normal  0.970145 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1306  aldo/keto reductase  29.07 
 
 
274 aa  78.2  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20030  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  29.39 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1519  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  27.12 
 
 
344 aa  77.4  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.481251  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1382  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  29.69 
 
 
282 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5158  aldo/keto reductase  27.33 
 
 
331 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  26.72 
 
 
355 aa  76.6  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3663  aldo/keto reductase  29.43 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3594  aldo/keto reductase  28.62 
 
 
344 aa  76.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  22.52 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  22.57 
 
 
315 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1138  oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  29.8 
 
 
314 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0715  aldo/keto reductase  31.58 
 
 
282 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2449  aldo/keto reductase  28.74 
 
 
281 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000271935 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3732  aldo/keto reductase  27.65 
 
 
273 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3453  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  27.68 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.970161  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2068  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28.46 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1887  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28.46 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0335857  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1415  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28.46 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111165  normal  0.725362 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1399  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28.46 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0161673 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  28.46 
 
 
352 aa  73.6  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0764  aldo/keto reductase  28.74 
 
 
281 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000421466 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3181  aldo/keto reductase  29.25 
 
 
281 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000770886 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  28.4 
 
 
349 aa  73.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  23.84 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0287  2,5-didehydrogluconate reductase  27.21 
 
 
277 aa  72.8  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.941845 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  29.84 
 
 
328 aa  72.8  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1553  aldo/keto reductase  26.46 
 
 
285 aa  72.8  0.000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1191  aldo/keto reductase  25.88 
 
 
331 aa  72.4  0.000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0223212  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2798  aldo/keto reductase  27.2 
 
 
281 aa  72.4  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.503233  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0033  aldo/keto reductase  28.57 
 
 
289 aa  72  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0695  aldo/keto reductase  26.2 
 
 
396 aa  72  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.994792  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0243  Aryl-alcohol dehydrogenase related enzyme  25.09 
 
 
305 aa  72  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3173  aldo/keto reductase  26.62 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.115675  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  27.36 
 
 
349 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6423  aldo/keto reductase  26.79 
 
 
339 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.251084  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3009  aldo/keto reductase  30.08 
 
 
285 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0466908 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1373  aldo/keto reductase  29.25 
 
 
284 aa  71.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3195  aldo/keto reductase  27.46 
 
 
288 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3015  putative oxidoreductase, MocA  27.99 
 
 
341 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1919  aldo/keto reductase  27.38 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2006  aldo/keto reductase  27.78 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1649  aldo/keto reductase  27.21 
 
 
325 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.328017  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2531  aldo/keto reductase  27.38 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383161  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  26.92 
 
 
345 aa  70.9  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4305  aldo/keto reductase  27.04 
 
 
342 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0836372  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2555  aldo/keto reductase  27.38 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324951 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  25.24 
 
 
352 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1427  aldo/keto reductase  27.24 
 
 
341 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4075  aldo/keto reductase  27.04 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>