More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1373 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1373  aldo/keto reductase  100 
 
 
284 aa  568  1e-161  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0033  aldo/keto reductase  66.79 
 
 
289 aa  385  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2191  aldo/keto reductase  63.1 
 
 
296 aa  354  7.999999999999999e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.41887 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5322  aldo/keto reductase  62.28 
 
 
293 aa  352  2.9999999999999997e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0362532 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2253  aldo/keto reductase  57.95 
 
 
286 aa  349  3e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.84974 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5317  aldo/keto reductase  61.87 
 
 
279 aa  347  1e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377532  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0329  aldo/keto reductase  62.37 
 
 
280 aa  342  2.9999999999999997e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2292  aldo/keto reductase  60.79 
 
 
293 aa  341  8e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3653  aldo/keto reductase  60.14 
 
 
290 aa  337  9.999999999999999e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178282 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2291  aldo/keto reductase  61.09 
 
 
293 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.77944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3009  aldo/keto reductase  60.42 
 
 
285 aa  332  4e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0466908 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0114  aldo/keto reductase  56.07 
 
 
293 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0764  aldo/keto reductase  56.23 
 
 
288 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0414529 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1685  aldo/keto reductase  58.42 
 
 
300 aa  319  3e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0104  aldo/keto reductase  56.43 
 
 
293 aa  318  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.882286  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0446  aldo/keto reductase  55.23 
 
 
283 aa  317  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00031204  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3405  aldo/keto reductase  57.4 
 
 
304 aa  316  3e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3682  aldo/keto reductase  61.13 
 
 
290 aa  313  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4689  aldo/keto reductase  57.3 
 
 
292 aa  310  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2555  aldo/keto reductase  60.29 
 
 
289 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4547  aldo/keto reductase  60.66 
 
 
278 aa  309  4e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.877781 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5154  aldo/keto reductase  57.3 
 
 
292 aa  309  4e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.849276  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5232  aldo/keto reductase  56.23 
 
 
292 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109633  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1564  aldo/keto reductase  54.71 
 
 
335 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7191  aldo/keto reductase  52.65 
 
 
281 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.633848  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2941  aldo/keto reductase  54.9 
 
 
284 aa  301  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6541  aldo/keto reductase  52.04 
 
 
288 aa  290  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.808367  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0510  Aryl-alcohol dehydrogenase related enzyme  47.54 
 
 
292 aa  289  4e-77  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.372806  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0536  aldo/keto reductase  54.09 
 
 
291 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3551  aldo/keto reductase  51.25 
 
 
300 aa  285  4e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4269  aldo/keto reductase  54.09 
 
 
287 aa  285  5e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.207462  normal  0.521186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4399  aldo/keto reductase  58.55 
 
 
285 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278504  hitchhiker  0.00297654 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2084  aldo/keto reductase  52.57 
 
 
295 aa  280  2e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.567336 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0263  aldo/keto reductase  50 
 
 
281 aa  271  9e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  decreased coverage  0.00520764 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1525  aldo/keto reductase  50.9 
 
 
287 aa  270  2e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.135772  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1321  aldo/keto reductase  49.47 
 
 
287 aa  265  7e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0669761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5228  aldo/keto reductase  55.12 
 
 
281 aa  265  7e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0449  aldo/keto reductase  51.82 
 
 
300 aa  259  4e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6534  putative oxidoreductase  46.71 
 
 
315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.35079 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1388  aldo/keto reductase  44.56 
 
 
286 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2112  putative oxidoreductase  47.24 
 
 
288 aa  249  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5911  putative oxidoreductase  46.18 
 
 
292 aa  248  7e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.360934  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0299  putative oxidoreductase  46.21 
 
 
292 aa  246  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.876534  normal  0.304239 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1859  putative oxidoreductase  46.71 
 
 
297 aa  241  7e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2776  putative oxidoreductase  46.5 
 
 
292 aa  240  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2727  aldo/keto reductase  47.48 
 
 
296 aa  235  7e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00257706  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6037  aldo/keto reductase  46.71 
 
 
293 aa  235  8e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3775  putative oxidoreductase  45.49 
 
 
294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4852  putative oxidoreductase  45.49 
 
 
294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6342  putative oxidoreductase  46.21 
 
 
291 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1976  putative oxidoreductase  46.21 
 
 
291 aa  233  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5769  putative oxidoreductase  45.04 
 
 
311 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.675112 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4576  putative oxidoreductase  45.86 
 
 
291 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25594  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0010  putative oxidoreductase  44.72 
 
 
300 aa  228  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.737964  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2239  aldo/keto reductase  44.37 
 
 
286 aa  228  7e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0140454  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1489  putative oxidoreductase  44.37 
 
 
286 aa  228  7e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2252  putative oxidoreductase  44.37 
 
 
286 aa  228  7e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.103537  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1766  putative oxidoreductase  44.37 
 
 
286 aa  228  7e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00951362 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1587  putative oxidoreductase  44.37 
 
 
286 aa  228  9e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19120  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  45.07 
 
 
310 aa  228  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.121634  normal  0.418593 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3184  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  42.16 
 
 
287 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.11057  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2008  putative oxidoreductase  43.66 
 
 
286 aa  225  7e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.865157  normal  0.493035 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2646  putative oxidoreductase  42.01 
 
 
293 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0218  aldo/keto reductase  45.13 
 
 
293 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.934292 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3802  aldo/keto reductase  43.79 
 
 
293 aa  224  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3561  putative oxidoreductase  44.64 
 
 
292 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119238  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6338  putative oxidoreductase  45.52 
 
 
291 aa  221  9e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1340  aldo/keto reductase  47.83 
 
 
293 aa  221  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.266223  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0942  aldo/keto reductase  44.37 
 
 
324 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3959  putative oxidoreductase  43.94 
 
 
290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.102223 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3050  putative oxidoreductase  41.18 
 
 
287 aa  219  6e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.378412  normal  0.0203224 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6038  putative oxidoreductase  46.9 
 
 
291 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.796364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6751  aldo/keto reductase  47.23 
 
 
275 aa  217  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296032  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2685  aldo/keto reductase  41.52 
 
 
302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.346212  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1317  aldo/keto reductase  42.18 
 
 
290 aa  215  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.329831  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1273  putative oxidoreductase  42.27 
 
 
292 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.239871  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1135  aldo/keto reductase  43.24 
 
 
294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1935  aldo/keto reductase  45.45 
 
 
289 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0134693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4872  aldo/keto reductase  42.66 
 
 
292 aa  212  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4961  aldo/keto reductase  42.66 
 
 
292 aa  212  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5463  aldo/keto reductase  42.86 
 
 
292 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2833  aldo/keto reductase  39.93 
 
 
291 aa  208  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0361368  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4700  aldo/keto reductase  45.65 
 
 
297 aa  207  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0809909 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5322  aldo/keto reductase  42.96 
 
 
285 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5411  aldo/keto reductase  42.96 
 
 
285 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.920716  normal  0.264 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5701  aldo/keto reductase  42.96 
 
 
285 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4436  aldo/keto reductase  43.66 
 
 
274 aa  205  5e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3447  aldo/keto reductase  42.7 
 
 
280 aa  205  8e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.111465  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0889  aldo/keto reductase  42.37 
 
 
268 aa  195  7e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0531022 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1329  aldo/keto reductase  43.59 
 
 
291 aa  195  9e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.398839  normal  0.735502 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0425  aldo/keto reductase  43.3 
 
 
309 aa  189  7e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38050  Aldo/keto reductase  38.41 
 
 
401 aa  185  8e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4941  aldo/keto reductase  41.36 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4719  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.33 
 
 
327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0167  aldo/keto reductase  38.76 
 
 
335 aa  179  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.691429  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3903  aldo/keto reductase  36.88 
 
 
327 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.392961  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4221  aldo/keto reductase  36.21 
 
 
390 aa  176  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.886889  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6148  aldo/keto reductase  36.04 
 
 
329 aa  176  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0475  aldo/keto reductase  36.42 
 
 
331 aa  175  7e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0402  aldo/keto reductase  36.48 
 
 
335 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0608954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>