More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1065 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1065  aldo/keto reductase  100 
 
 
310 aa  632  1e-180  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0777  aldo/keto reductase  58.91 
 
 
296 aa  338  7e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0409977  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1200  putative oxidoreductase protein  61.51 
 
 
305 aa  338  8e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0028  aldo/keto reductase  56.62 
 
 
311 aa  335  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277769  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4332  aldo/keto reductase  52.86 
 
 
305 aa  331  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00722247 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2819  aldo/keto reductase  53.82 
 
 
317 aa  328  7e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.842326  normal  0.173648 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6222  aldo/keto reductase  51.16 
 
 
302 aa  288  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2471  aldo/keto reductase  46.05 
 
 
312 aa  281  9e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.367665 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7084  aldo/keto reductase  53.41 
 
 
301 aa  280  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1310  putative oxidoreductase protein  54.75 
 
 
277 aa  278  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.679533  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0310  aldo/keto reductase  49.44 
 
 
309 aa  270  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5330  aldo/keto reductase  51.3 
 
 
333 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5422  aldo/keto reductase  50 
 
 
316 aa  263  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1266  aldo/keto reductase  46.71 
 
 
331 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2106  aldo/keto reductase  44.55 
 
 
314 aa  258  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3208  aldo/keto reductase  48.94 
 
 
323 aa  253  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00561471  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0575  twin-arginine translocation pathway signal  43.65 
 
 
345 aa  242  7.999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.451662  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4003  aldo/keto reductase  45.49 
 
 
271 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444769  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1798  twin-arginine translocation pathway signal  42.3 
 
 
308 aa  236  3e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.116127  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3859  aldo/keto reductase  43.33 
 
 
309 aa  236  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665179  normal  0.078293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4168  aldo/keto reductase  43.33 
 
 
309 aa  236  4e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.528392 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26350  Aldo/keto reductase protein  43.64 
 
 
307 aa  233  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4782  putative aldo/keto reductase  42.76 
 
 
307 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.476662 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1231  aldo/keto reductase  44.29 
 
 
302 aa  227  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49120  Aldo/keto reductase  45.02 
 
 
305 aa  226  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0384545  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4318  aldo/keto reductase  43.8 
 
 
317 aa  224  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443363  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0376  aldo/keto reductase  44.55 
 
 
306 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1371  aldo/keto reductase  43.75 
 
 
304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0446  aldo/keto reductase  41.85 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2513  aldo/keto reductase  40.58 
 
 
303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2662  aldo/keto reductase  40.96 
 
 
302 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3249  aldo/keto reductase  40.22 
 
 
272 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2644  aldo/keto reductase  39.71 
 
 
303 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.077473  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5296  aldo/keto reductase  34.94 
 
 
271 aa  129  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107588  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1602  aldo/keto reductase  25.19 
 
 
281 aa  88.6  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0142  aldo/keto reductase  29.96 
 
 
280 aa  88.2  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3081  aldo/keto reductase  28.57 
 
 
277 aa  87  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1673  aldo/keto reductase  28.52 
 
 
284 aa  86.7  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.361716  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1138  oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  32.09 
 
 
314 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1975  aldo/keto reductase  30.14 
 
 
284 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0423  aldo/keto reductase  26.6 
 
 
323 aa  84  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1382  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.23 
 
 
282 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2068  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.23 
 
 
282 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1415  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.23 
 
 
282 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111165  normal  0.725362 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1399  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.23 
 
 
282 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0161673 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1887  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.23 
 
 
282 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0335857  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2881  aldo/keto reductase  30.27 
 
 
277 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10217  aldo-keto reductase (AKR13), puatative (AFU_orthologue; AFUA_7G00700)  26.54 
 
 
339 aa  82.8  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.315653 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2798  aldo/keto reductase  28.03 
 
 
281 aa  82.4  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.503233  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1623  aldo/keto reductase  27.44 
 
 
399 aa  82  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.34672  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2429  aldo/keto reductase  30.19 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.43714  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1156  aldo/keto reductase  30.3 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.721286  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4055  aldo/keto reductase  31.06 
 
 
280 aa  80.1  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4552  aldo/keto reductase  25.16 
 
 
323 aa  79.7  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.569712  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3226  aldo/keto reductase  28.79 
 
 
277 aa  79  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593826  normal  0.135876 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2005  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.29 
 
 
284 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.537147  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2737  aldo/keto reductase  30.66 
 
 
273 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0465  aldo/keto reductase  23.98 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3049  aldo/keto reductase  24.92 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0553  aldo/keto reductase  27.94 
 
 
281 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0509974 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1373  aldo/keto reductase  29.63 
 
 
284 aa  75.5  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0951  aldo/keto reductase  27.47 
 
 
406 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2291  aldo/keto reductase  26.28 
 
 
337 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000272492  hitchhiker  0.000000557849 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16590  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  27.41 
 
 
370 aa  75.5  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.101314  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0276  aldo/keto reductase  24.64 
 
 
397 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.874141  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01740  predicted oxidoreductase  26.25 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1578  aldo/keto reductase  28.15 
 
 
281 aa  74.7  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0586561  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3181  aldo/keto reductase  28.74 
 
 
281 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000770886 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1855  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.25 
 
 
326 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0511443  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38150  Aldo/keto reductase  31.34 
 
 
277 aa  74.3  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.451685  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01728  hypothetical protein  26.25 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1082  aldo/keto reductase  25.45 
 
 
274 aa  74.7  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2505  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  27.84 
 
 
284 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00223283  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1038  aldo/keto reductase  25.45 
 
 
274 aa  74.7  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01750  predicted oxidoreductase  27.45 
 
 
284 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.725881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1861  aldo/keto reductase  27.45 
 
 
284 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000447998  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2369  aldo/keto reductase  26.24 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1866  aldo/keto reductase family oxidoreductase  27.45 
 
 
284 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00718625  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1851  aldo/keto reductase  27.45 
 
 
284 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0581012  hitchhiker  0.000414581 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01738  hypothetical protein  27.45 
 
 
284 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723055  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0667  aldo/keto reductase  27.62 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4714  oxidoreductase  29.5 
 
 
273 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1410  aldo/keto reductase family oxidoreductase  27.84 
 
 
284 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.198521  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2495  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  26.25 
 
 
326 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2006  aldo/keto reductase  28.46 
 
 
281 aa  73.6  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1871  aldo/keto reductase  25.83 
 
 
326 aa  72.8  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0202934  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1995  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.83 
 
 
326 aa  72.8  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0763  aldo/keto reductase  28.36 
 
 
400 aa  72.8  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000804851 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2056  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  27.46 
 
 
327 aa  72.8  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0299722 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2449  aldo/keto reductase  28.29 
 
 
281 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000271935 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4295  aldo/keto reductase  26.2 
 
 
327 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895367  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2007  aldo/keto reductase  28.85 
 
 
277 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.664286  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1308  aldo/keto reductase  25.37 
 
 
282 aa  72  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2639  aldo/keto reductase  26.95 
 
 
400 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258498  normal  0.182592 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1420  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.83 
 
 
326 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0706  aldo/keto reductase  25.28 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000923637  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0764  aldo/keto reductase  28.9 
 
 
281 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000421466 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1422  aldo/keto reductase  27.74 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3350  aldo/keto reductase  27.8 
 
 
398 aa  70.1  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.343434  normal  0.051891 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1306  aldo/keto reductase  28.52 
 
 
274 aa  70.5  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>