More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4782 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4782  putative aldo/keto reductase  100 
 
 		 307 aa  624  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.476662 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4003  aldo/keto reductase  75.37 
 
 		 271 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444769  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0376  aldo/keto reductase  51.42 
 
 		 306 aa  277  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49120  Aldo/keto reductase  50.74 
 
 		 305 aa  266  4e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0384545  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2106  aldo/keto reductase  44.84 
 
 		 314 aa  263  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2513  aldo/keto reductase  52 
 
 		 303 aa  262  6e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3249  aldo/keto reductase  52.36 
 
 		 272 aa  261  8e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7084  aldo/keto reductase  50 
 
 		 301 aa  260  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6222  aldo/keto reductase  49.29 
 
 		 302 aa  258  7e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1798  twin-arginine translocation pathway signal  47.12 
 
 		 308 aa  258  9e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.116127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2644  aldo/keto reductase  50.94 
 
 		 303 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.077473  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2471  aldo/keto reductase  44.41 
 
 		 312 aa  255  6e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.367665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2662  aldo/keto reductase  49.27 
 
 		 302 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26350  Aldo/keto reductase protein  49.82 
 
 		 307 aa  250  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5330  aldo/keto reductase  44.66 
 
 		 333 aa  249  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2819  aldo/keto reductase  46.79 
 
 		 317 aa  246  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.842326  normal  0.173648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0310  aldo/keto reductase  43.97 
 
 		 309 aa  245  6e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1266  aldo/keto reductase  44.55 
 
 		 331 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5422  aldo/keto reductase  45.93 
 
 		 316 aa  239  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3859  aldo/keto reductase  42.9 
 
 		 309 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665179  normal  0.078293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4168  aldo/keto reductase  42.57 
 
 		 309 aa  231  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.528392 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0028  aldo/keto reductase  44.37 
 
 		 311 aa  228  7e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1065  aldo/keto reductase  42.76 
 
 		 310 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4318  aldo/keto reductase  43.75 
 
 		 317 aa  227  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1231  aldo/keto reductase  44.44 
 
 		 302 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0446  aldo/keto reductase  42.7 
 
 		 301 aa  225  8e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0777  aldo/keto reductase  41.98 
 
 		 296 aa  219  6e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0409977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3208  aldo/keto reductase  43.82 
 
 		 323 aa  218  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00561471  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0575  twin-arginine translocation pathway signal  38.29 
 
 		 345 aa  215  7e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.451662  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1371  aldo/keto reductase  42.05 
 
 		 304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1200  putative oxidoreductase protein  42.59 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4332  aldo/keto reductase  36.48 
 
 		 305 aa  188  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722247 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1310  putative oxidoreductase protein  36.23 
 
 		 277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.679533  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5296  aldo/keto reductase  33.33 
 
 		 271 aa  113  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1382  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.2 
 
 		 282 aa  85.9  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1673  aldo/keto reductase  28.85 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.361716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1415  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  29.48 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111165  normal  0.725362 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1887  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  29.48 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0335857  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1399  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  29.48 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0161673 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2068  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  29.48 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333228 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3226  aldo/keto reductase  28.63 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593826  normal  0.135876 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5774  aldo/keto reductase  35.48 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2005  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.56 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.537147  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5799  aldo/keto reductase  31.3 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2505  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00223283  normal  0.840205 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01750  predicted oxidoreductase  29.6 
 
 		 284 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.725881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1861  aldo/keto reductase  29.6 
 
 		 284 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000447998  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01738  hypothetical protein  29.6 
 
 		 284 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723055  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1866  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.6 
 
 		 284 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00718625  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1410  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.198521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1851  aldo/keto reductase  29.6 
 
 		 284 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0581012  hitchhiker  0.000414581 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2217  aldo/keto reductase  30.57 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2029  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.4 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.848992  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2798  aldo/keto reductase  27.27 
 
 		 281 aa  73.6  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.503233  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1975  aldo/keto reductase  28.24 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3081  aldo/keto reductase  27.41 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2050  aldo/keto reductase  25.98 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.495803  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  27.1 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5289  aldo/keto reductase  29.65 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2006  aldo/keto reductase  29.7 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3732  aldo/keto reductase  29.17 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4552  aldo/keto reductase  26.01 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.569712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0138  aldo/keto reductase  27.17 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1335  aldo/keto reductase  31.41 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.546872 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1156  aldo/keto reductase  30.61 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.721286  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0423  aldo/keto reductase  25.87 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1537  aldo/keto reductase  27.56 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499861 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1681  aldo/keto reductase  25.59 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2369  aldo/keto reductase  27.67 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2987  aldo/keto reductase  27.64 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4055  aldo/keto reductase  30.5 
 
 		 280 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1997  aldo/keto reductase  28.46 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2138  aldo/keto reductase  24.36 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2881  aldo/keto reductase  28.63 
 
 		 277 aa  67  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3132  aldo/keto reductase  27.64 
 
 		 319 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  29.37 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2824  putative aldo/keto reductase  27.31 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1003  aldo/keto reductase  28.11 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3314  aldo/keto reductase  27.65 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2429  aldo/keto reductase  30.57 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.43714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1963  aldo/keto reductase  26.82 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.152585  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3100  aldo/keto reductase  28.04 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.124867  normal  0.776601 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20030  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  28.96 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2428  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  27.6 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.466791 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  30.31 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1630  aldo/keto reductase  25.94 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0243  Aryl-alcohol dehydrogenase related enzyme  24.83 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1762  aldo/keto reductase  26.64 
 
 		 327 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2866  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  27.6 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3502  aldo/keto reductase  32.27 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0118394  normal  0.431594 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5669  aldo/keto reductase  28.9 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.192891 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0491  aldo/keto reductase  32.28 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00588566  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  26.77 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  30.8 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  27.14 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1077  aldo/keto reductase  31.1 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000399165 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2769  aldo/keto reductase  28.77 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3311  aldo/keto reductase  26.48 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.917987  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3173  aldo/keto reductase  27.97 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.115675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1775  aldo/keto reductase  29.57 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0360255  normal  0.42247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>