More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1310 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1310  putative oxidoreductase protein  100 
 
 
277 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.679533  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1065  aldo/keto reductase  54.75 
 
 
310 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0777  aldo/keto reductase  48.66 
 
 
296 aa  257  1e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0409977  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6222  aldo/keto reductase  51.74 
 
 
302 aa  246  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1200  putative oxidoreductase protein  46.47 
 
 
305 aa  246  2e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4332  aldo/keto reductase  43.8 
 
 
305 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00722247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7084  aldo/keto reductase  48.47 
 
 
301 aa  237  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0028  aldo/keto reductase  46.95 
 
 
311 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277769  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2471  aldo/keto reductase  42.75 
 
 
312 aa  232  6e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.367665 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5330  aldo/keto reductase  46.35 
 
 
333 aa  228  6e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2819  aldo/keto reductase  43.51 
 
 
317 aa  225  7e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.842326  normal  0.173648 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2106  aldo/keto reductase  46.55 
 
 
314 aa  224  9e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5422  aldo/keto reductase  46.56 
 
 
316 aa  222  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1266  aldo/keto reductase  46.01 
 
 
331 aa  218  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3208  aldo/keto reductase  48.61 
 
 
323 aa  212  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00561471  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0310  aldo/keto reductase  40.3 
 
 
309 aa  209  4e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0575  twin-arginine translocation pathway signal  37.81 
 
 
345 aa  195  7e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.451662  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4003  aldo/keto reductase  40.07 
 
 
271 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444769  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1798  twin-arginine translocation pathway signal  39.34 
 
 
308 aa  189  5e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.116127  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49120  Aldo/keto reductase  40.29 
 
 
305 aa  186  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0384545  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26350  Aldo/keto reductase protein  39.13 
 
 
307 aa  185  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3249  aldo/keto reductase  38.83 
 
 
272 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2662  aldo/keto reductase  37.36 
 
 
302 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0376  aldo/keto reductase  39.78 
 
 
306 aa  177  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2513  aldo/keto reductase  38.46 
 
 
303 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2644  aldo/keto reductase  38.1 
 
 
303 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.077473  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3859  aldo/keto reductase  36.23 
 
 
309 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665179  normal  0.078293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4168  aldo/keto reductase  36.23 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.528392 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1371  aldo/keto reductase  36.86 
 
 
304 aa  169  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4318  aldo/keto reductase  36.23 
 
 
317 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443363  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1231  aldo/keto reductase  37.45 
 
 
302 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4782  putative aldo/keto reductase  36.23 
 
 
307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.476662 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0446  aldo/keto reductase  34.06 
 
 
301 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5296  aldo/keto reductase  35.82 
 
 
271 aa  128  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107588  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0234  aldo/keto reductase  23.93 
 
 
328 aa  83.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0871019 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1602  aldo/keto reductase  27.04 
 
 
281 aa  75.1  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4789  putative aldo/keto reductase  28.63 
 
 
272 aa  71.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0553  aldo/keto reductase  30.8 
 
 
281 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0509974 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1373  aldo/keto reductase  27.1 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2291  aldo/keto reductase  25.19 
 
 
337 aa  69.7  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000272492  hitchhiker  0.000000557849 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1210  aldo/keto reductase  21.65 
 
 
409 aa  68.9  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.97605  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02792  probable oxidoreductase  26.57 
 
 
278 aa  67.8  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1184  aldo/keto reductase  25.69 
 
 
329 aa  67.4  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1226  aldo/keto reductase  21.17 
 
 
408 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4422  aldo/keto reductase  24.25 
 
 
323 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000370601  normal  0.543562 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44630  Aldo/keto reductase family protein  28.04 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0940461  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0033  aldo/keto reductase  27.44 
 
 
289 aa  66.2  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0510  Aryl-alcohol dehydrogenase related enzyme  24.06 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.372806  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2292  aldo/keto reductase  29.71 
 
 
293 aa  65.9  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1138  oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  28.29 
 
 
314 aa  65.5  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0236  aldo/keto reductase  21.48 
 
 
376 aa  65.5  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062444  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4689  aldo/keto reductase  28.32 
 
 
292 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2056  hypothetical protein  26.01 
 
 
399 aa  64.7  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0216146  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0329  aldo/keto reductase  28.41 
 
 
280 aa  64.3  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10217  aldo-keto reductase (AKR13), puatative (AFU_orthologue; AFUA_7G00700)  23.38 
 
 
339 aa  63.9  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.315653 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2415  aldo/keto reductase  24.49 
 
 
296 aa  63.9  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0539  aldo/keto reductase  26.81 
 
 
271 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1826  aldo/keto reductase  25.45 
 
 
329 aa  63.5  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5154  aldo/keto reductase  28.32 
 
 
292 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.849276  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3434  pyridoxal 4-dehydrogenase  25.17 
 
 
323 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0581734 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4932  aldo/keto reductase  25.9 
 
 
270 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06660  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  26.25 
 
 
277 aa  63.2  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0146  aldo/keto reductase  24.77 
 
 
327 aa  63.2  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.743062 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0423  aldo/keto reductase  26.9 
 
 
323 aa  63.2  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0745  aldo/keto reductase  22.02 
 
 
409 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5228  aldo/keto reductase  28.33 
 
 
281 aa  63.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3073  2,5-didehydrogluconate reductase  26.24 
 
 
272 aa  62.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4547  aldo/keto reductase  30.08 
 
 
278 aa  62.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.877781 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0764  aldo/keto reductase  30.71 
 
 
281 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000421466 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2410  aldo/keto reductase  24.46 
 
 
331 aa  62.4  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0936644  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3571  aldo/keto reductase  26.02 
 
 
277 aa  62.4  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0869  putative oxidoreductase  23.1 
 
 
325 aa  62  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3682  aldo/keto reductase  27.53 
 
 
290 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1615  2,5-didehydrogluconate reductase  30.15 
 
 
272 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.808798  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0142  aldo/keto reductase  25.09 
 
 
280 aa  61.6  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0556  aldo/keto reductase  26.69 
 
 
277 aa  62  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4981  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  26.81 
 
 
271 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2028  2,5-didehydrogluconate reductase  29.3 
 
 
277 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6248  2,5-didehydrogluconate reductase  24.82 
 
 
278 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  24.84 
 
 
343 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5232  aldo/keto reductase  27.75 
 
 
292 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109633  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0104  aldo/keto reductase  28.96 
 
 
294 aa  60.8  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  24.76 
 
 
343 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4981  aldo/keto reductase  25.9 
 
 
270 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480582  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0536  aldo/keto reductase  27.27 
 
 
291 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4804  aldo/keto reductase  25.9 
 
 
270 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39186  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4055  aldo/keto reductase  28.78 
 
 
280 aa  60.1  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  24.84 
 
 
343 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2432  2,5-didehydrogluconate reductase  27.34 
 
 
272 aa  60.1  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812147  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3226  aldo/keto reductase  27.6 
 
 
277 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593826  normal  0.135876 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1641  aldo/keto reductase  29.93 
 
 
286 aa  60.1  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000276497  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1850  2,5-didehydrogluconate reductase  28.91 
 
 
277 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.671813  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5322  aldo/keto reductase  29.18 
 
 
293 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0362532 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2191  aldo/keto reductase  27.06 
 
 
296 aa  59.7  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.41887 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1553  aldo/keto reductase  24.62 
 
 
285 aa  59.3  0.00000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4324  aldo/keto reductase  25.18 
 
 
393 aa  59.3  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2381  2,5-didehydrogluconate reductase  26.24 
 
 
272 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308673  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2503  aldo/keto reductase  23.39 
 
 
374 aa  58.9  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4269  aldo/keto reductase  26.98 
 
 
287 aa  58.9  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.207462  normal  0.521186 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3181  aldo/keto reductase  29.86 
 
 
281 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000770886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>