50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1385 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1385  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  217  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0965478  normal  0.615751 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1965  hypothetical protein  65.55 
 
 
119 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5372  hypothetical protein  66.67 
 
 
122 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499544 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2095  hypothetical protein  60.32 
 
 
126 aa  98.2  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.775217  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1976  hypothetical protein  49.24 
 
 
116 aa  94.7  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0198719  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2082  hypothetical protein  61.86 
 
 
118 aa  93.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2063  hypothetical protein  61.02 
 
 
118 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.227781  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6014  hypothetical protein  61.02 
 
 
118 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.810245  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2495  hypothetical protein  67.52 
 
 
117 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1213  hypothetical protein  67.86 
 
 
109 aa  83.6  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.43875 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2503  hypothetical protein  70.09 
 
 
115 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00769616  hitchhiker  0.00377548 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1609  hypothetical protein  75 
 
 
117 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0210429  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2637  hypothetical protein  75 
 
 
117 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3202  hypothetical protein  75 
 
 
117 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152158  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2549  hypothetical protein  75 
 
 
117 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2112  hypothetical protein  75 
 
 
117 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25728  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1385  hypothetical protein  75 
 
 
117 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0245118  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1634  hypothetical protein  69.23 
 
 
115 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.101283  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0256  hypothetical protein  79.41 
 
 
113 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2058  putative signal peptide protein  49.11 
 
 
126 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.148493 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4310  hypothetical protein  37.97 
 
 
92 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2211  putative signal peptide protein  48.21 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5162  signal peptide protein  37.29 
 
 
111 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3767  hypothetical protein  44.83 
 
 
92 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00933749  hitchhiker  0.00116407 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3241  hypothetical protein  44.83 
 
 
92 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0533756 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6990  hypothetical protein  33.33 
 
 
93 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.600513  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2315  putative lipoprotein  39.34 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2945  hypothetical protein  56.1 
 
 
99 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0587422  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1631  hypothetical protein  67.86 
 
 
75 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.638858  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1151  hypothetical protein  67.86 
 
 
75 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0417959  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1606  hypothetical protein  67.86 
 
 
83 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.133632  normal  0.1453 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4655  signal peptide protein  44.74 
 
 
105 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.104125 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4523  putative signal peptide protein  44.74 
 
 
105 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183789  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1607  hypothetical protein  54.76 
 
 
75 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00747509 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1052  hypothetical protein  48.33 
 
 
97 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4777  hypothetical protein  66.67 
 
 
105 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.447875  normal  0.18704 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1508  hypothetical protein  48.15 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.620222  hitchhiker  0.000360892 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6900  hypothetical protein  53.66 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.451962  normal  0.412976 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2220  hypothetical protein  50.54 
 
 
98 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1528  hypothetical protein  67.74 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386359  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2446  signal peptide protein  50 
 
 
110 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4829  hypothetical protein  42.11 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851561  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1532  hypothetical protein  48.15 
 
 
94 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4672  hypothetical protein  50 
 
 
94 aa  44.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.951454  hitchhiker  0.00900362 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2549  hypothetical protein  73.91 
 
 
94 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.309397  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0854  hypothetical protein  52.87 
 
 
94 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317726  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1721  hypothetical protein  46.3 
 
 
93 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169601  hitchhiker  0.0000197195 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3870  hypothetical protein  50.65 
 
 
178 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0956849  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4495  hypothetical protein  50.65 
 
 
178 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.408857  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1814  hypothetical protein  40.85 
 
 
165 aa  40.4  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>