36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6900 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6900  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  205  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.451962  normal  0.412976 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2945  hypothetical protein  90.91 
 
 
99 aa  140  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0587422  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4310  hypothetical protein  68.04 
 
 
92 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6990  hypothetical protein  54.17 
 
 
93 aa  90.1  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.600513  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2315  putative lipoprotein  63.64 
 
 
97 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1976  hypothetical protein  62.5 
 
 
116 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0198719  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1213  hypothetical protein  60.53 
 
 
109 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.43875 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2495  hypothetical protein  62.5 
 
 
117 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2503  hypothetical protein  60 
 
 
115 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00769616  hitchhiker  0.00377548 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2637  hypothetical protein  62.5 
 
 
117 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1385  hypothetical protein  62.5 
 
 
117 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0245118  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2549  hypothetical protein  62.5 
 
 
117 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3202  hypothetical protein  62.5 
 
 
117 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152158  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2112  hypothetical protein  62.5 
 
 
117 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25728  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1609  hypothetical protein  62.5 
 
 
117 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0210429  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1634  hypothetical protein  60 
 
 
115 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.101283  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2095  hypothetical protein  52.27 
 
 
126 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.775217  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5372  hypothetical protein  72.41 
 
 
122 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499544 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1965  hypothetical protein  66.67 
 
 
119 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2082  hypothetical protein  56.1 
 
 
118 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2063  hypothetical protein  56.1 
 
 
118 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.227781  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6014  hypothetical protein  56.1 
 
 
118 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.810245  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1607  hypothetical protein  56.25 
 
 
75 aa  46.2  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00747509 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2220  hypothetical protein  39.78 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4777  hypothetical protein  33.8 
 
 
105 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.447875  normal  0.18704 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0854  hypothetical protein  37.14 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317726  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1528  hypothetical protein  33.78 
 
 
83 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386359  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2549  hypothetical protein  36.76 
 
 
94 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.309397  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3241  hypothetical protein  37.08 
 
 
92 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0533756 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3767  hypothetical protein  37.08 
 
 
92 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00933749  hitchhiker  0.00116407 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4829  hypothetical protein  40.35 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851561  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1631  hypothetical protein  57.69 
 
 
75 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.638858  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1151  hypothetical protein  57.69 
 
 
75 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0417959  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1606  hypothetical protein  32.86 
 
 
83 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.133632  normal  0.1453 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0603  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.131447  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1385  hypothetical protein  71.43 
 
 
112 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0965478  normal  0.615751 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>