36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4310 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4310  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6900  hypothetical protein  68.04 
 
 
99 aa  92  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.451962  normal  0.412976 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2945  hypothetical protein  64.95 
 
 
99 aa  87.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0587422  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6990  hypothetical protein  52.17 
 
 
93 aa  83.6  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.600513  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2315  putative lipoprotein  46.48 
 
 
97 aa  62  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1976  hypothetical protein  50 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0198719  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4777  hypothetical protein  40.58 
 
 
105 aa  50.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.447875  normal  0.18704 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5372  hypothetical protein  60.98 
 
 
122 aa  50.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499544 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2503  hypothetical protein  77.78 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00769616  hitchhiker  0.00377548 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2495  hypothetical protein  61.54 
 
 
117 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1607  hypothetical protein  43.08 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00747509 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1213  hypothetical protein  62.5 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.43875 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1385  hypothetical protein  61.54 
 
 
117 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0245118  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2549  hypothetical protein  61.54 
 
 
117 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2637  hypothetical protein  61.54 
 
 
117 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3202  hypothetical protein  61.54 
 
 
117 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152158  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2112  hypothetical protein  61.54 
 
 
117 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25728  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1609  hypothetical protein  61.54 
 
 
117 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0210429  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1965  hypothetical protein  55.32 
 
 
119 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2095  hypothetical protein  76.92 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.775217  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1634  hypothetical protein  66.67 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.101283  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2063  hypothetical protein  63.16 
 
 
118 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.227781  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6014  hypothetical protein  63.16 
 
 
118 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.810245  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1528  hypothetical protein  43.08 
 
 
83 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386359  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1151  hypothetical protein  42.19 
 
 
75 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0417959  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1631  hypothetical protein  42.19 
 
 
75 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.638858  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2082  hypothetical protein  73.08 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0854  hypothetical protein  76 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317726  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1606  hypothetical protein  42.19 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.133632  normal  0.1453 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2549  hypothetical protein  78.26 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.309397  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4829  hypothetical protein  41.79 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851561  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3241  hypothetical protein  36.14 
 
 
92 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0533756 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3767  hypothetical protein  36.14 
 
 
92 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00933749  hitchhiker  0.00116407 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2220  hypothetical protein  56.1 
 
 
98 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0603  hypothetical protein  36.92 
 
 
168 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.131447  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1385  hypothetical protein  76.19 
 
 
112 aa  41.2  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0965478  normal  0.615751 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>