55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2095 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2095  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  245  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.775217  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1965  hypothetical protein  81.75 
 
 		 119 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5372  hypothetical protein  83.33 
 
 		 122 aa  135  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499544 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2082  hypothetical protein  78.57 
 
 		 118 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2063  hypothetical protein  77.78 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.227781  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6014  hypothetical protein  77.78 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.810245  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1976  hypothetical protein  76.19 
 
 		 116 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0198719  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1213  hypothetical protein  79.37 
 
 		 109 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.43875 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2495  hypothetical protein  78.57 
 
 		 117 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1609  hypothetical protein  79.37 
 
 		 117 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0210429  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1385  hypothetical protein  79.37 
 
 		 117 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0245118  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2549  hypothetical protein  79.37 
 
 		 117 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3202  hypothetical protein  79.37 
 
 		 117 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152158  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2112  hypothetical protein  79.37 
 
 		 117 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25728  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2637  hypothetical protein  79.37 
 
 		 117 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1385  hypothetical protein  58.73 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0965478  normal  0.615751 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2503  hypothetical protein  57.14 
 
 		 115 aa  62  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00769616  hitchhiker  0.00377548 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1634  hypothetical protein  57.38 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.101283  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0256  hypothetical protein  74.29 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4310  hypothetical protein  58.54 
 
 		 92 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4777  hypothetical protein  36.14 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.447875  normal  0.18704 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1052  hypothetical protein  55.93 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1532  hypothetical protein  55.93 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1528  hypothetical protein  46.55 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386359  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2315  putative lipoprotein  56 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1508  hypothetical protein  55.93 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.620222  hitchhiker  0.000360892 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1606  hypothetical protein  45.45 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.133632  normal  0.1453 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2058  putative signal peptide protein  38.17 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.148493 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6990  hypothetical protein  36.54 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.600513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1607  hypothetical protein  43.64 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00747509 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4523  putative signal peptide protein  39.39 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5162  signal peptide protein  33.33 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4655  signal peptide protein  39.39 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.104125 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2549  hypothetical protein  42.45 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.309397  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0854  hypothetical protein  42.31 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317726  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1631  hypothetical protein  45.28 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.638858  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3241  hypothetical protein  75 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0533756 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3767  hypothetical protein  75 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00933749  hitchhiker  0.00116407 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1151  hypothetical protein  45.28 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0417959  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1814  hypothetical protein  41.76 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4672  hypothetical protein  59.18 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.951454  hitchhiker  0.00900362 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1721  hypothetical protein  50.91 
 
 		 93 aa  45.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169601  hitchhiker  0.0000197195 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2910  signal peptide protein  43.8 
 
 		 105 aa  45.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0237846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6900  hypothetical protein  72 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.451962  normal  0.412976 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2211  putative signal peptide protein  38.93 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2220  hypothetical protein  51.16 
 
 		 98 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0603  hypothetical protein  84.21 
 
 		 168 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.131447  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2446  signal peptide protein  46.05 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2945  hypothetical protein  68 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0587422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3351  peptidase M23B  56.41 
 
 		 687 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0955739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4326  hypothetical protein  49.4 
 
 		 165 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1352  hypothetical protein  38.53 
 
 		 150 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1345  putative lipoprotein  33.86 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1423  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  36.71 
 
 		 2750 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3349  hypothetical protein  48.65 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.239806  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>