34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1528 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1528  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  166  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386359  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4777  hypothetical protein  91.53 
 
 		 105 aa  117  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.447875  normal  0.18704 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1606  hypothetical protein  96.43 
 
 		 83 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.133632  normal  0.1453 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1631  hypothetical protein  94.64 
 
 		 75 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.638858  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1151  hypothetical protein  94.64 
 
 		 75 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0417959  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1607  hypothetical protein  87.72 
 
 		 75 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00747509 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2315  putative lipoprotein  55.56 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1634  hypothetical protein  58.33 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.101283  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2503  hypothetical protein  56.25 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00769616  hitchhiker  0.00377548 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4310  hypothetical protein  43.24 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6990  hypothetical protein  36.59 
 
 		 93 aa  50.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.600513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1965  hypothetical protein  52.27 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1213  hypothetical protein  53.85 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.43875 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2095  hypothetical protein  61.76 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.775217  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2082  hypothetical protein  61.76 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6014  hypothetical protein  61.76 
 
 		 118 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.810245  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2063  hypothetical protein  61.76 
 
 		 118 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.227781  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2220  hypothetical protein  67.65 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5372  hypothetical protein  61.76 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499544 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2549  hypothetical protein  76 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.309397  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0854  hypothetical protein  78.26 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317726  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0603  hypothetical protein  69.57 
 
 		 168 aa  44.3  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.131447  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3767  hypothetical protein  64.71 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00933749  hitchhiker  0.00116407 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3241  hypothetical protein  64.71 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0533756 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1976  hypothetical protein  52.63 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0198719  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4829  hypothetical protein  85 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2495  hypothetical protein  58.33 
 
 		 117 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1385  hypothetical protein  58.33 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0245118  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2637  hypothetical protein  58.33 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2549  hypothetical protein  58.33 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3202  hypothetical protein  58.33 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152158  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2112  hypothetical protein  58.33 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25728  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1609  hypothetical protein  58.33 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0210429  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2945  hypothetical protein  59.26 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0587422  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>