52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2063 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_2063  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  230  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.227781  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6014  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  230  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.810245  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2082  hypothetical protein  99.15 
 
 		 118 aa  227  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1965  hypothetical protein  95 
 
 		 119 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1976  hypothetical protein  82.2 
 
 		 116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0198719  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5372  hypothetical protein  83.47 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499544 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2095  hypothetical protein  76.98 
 
 		 126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.775217  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2495  hypothetical protein  83.05 
 
 		 117 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1213  hypothetical protein  82.2 
 
 		 109 aa  115  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.43875 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2637  hypothetical protein  83.9 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1385  hypothetical protein  83.9 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0245118  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2549  hypothetical protein  83.9 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3202  hypothetical protein  83.9 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152158  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2112  hypothetical protein  83.9 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25728  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1609  hypothetical protein  83.9 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0210429  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1385  hypothetical protein  59.32 
 
 		 112 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0965478  normal  0.615751 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1634  hypothetical protein  64.65 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.101283  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2503  hypothetical protein  58.82 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00769616  hitchhiker  0.00377548 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0256  hypothetical protein  74.29 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6990  hypothetical protein  39.8 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.600513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4310  hypothetical protein  52.73 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2058  putative signal peptide protein  35.97 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.148493 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5162  signal peptide protein  36.75 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1052  hypothetical protein  55.93 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1532  hypothetical protein  55.93 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1528  hypothetical protein  54.35 
 
 		 83 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386359  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2315  putative lipoprotein  55.56 
 
 		 97 aa  50.1  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1508  hypothetical protein  55.93 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.620222  hitchhiker  0.000360892 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2910  signal peptide protein  51.79 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0237846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1606  hypothetical protein  54.76 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.133632  normal  0.1453 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4655  signal peptide protein  44.16 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.104125 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4523  putative signal peptide protein  44.16 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1631  hypothetical protein  54.76 
 
 		 75 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.638858  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1151  hypothetical protein  54.76 
 
 		 75 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0417959  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4777  hypothetical protein  52.38 
 
 		 105 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.447875  normal  0.18704 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2549  hypothetical protein  44 
 
 		 94 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.309397  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1607  hypothetical protein  52.38 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00747509 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1721  hypothetical protein  50.91 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169601  hitchhiker  0.0000197195 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0854  hypothetical protein  43.88 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317726  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4672  hypothetical protein  59.18 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.951454  hitchhiker  0.00900362 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3241  hypothetical protein  70.37 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0533756 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6900  hypothetical protein  72 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.451962  normal  0.412976 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3767  hypothetical protein  70.37 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00933749  hitchhiker  0.00116407 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0603  hypothetical protein  73.91 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.131447  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2211  putative signal peptide protein  38.46 
 
 		 129 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2446  signal peptide protein  46.05 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2945  hypothetical protein  68 
 
 		 99 aa  43.5  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0587422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2220  hypothetical protein  53.49 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4829  hypothetical protein  68 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1814  hypothetical protein  40.43 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3351  peptidase M23B  52.5 
 
 		 687 aa  40.8  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0955739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1352  hypothetical protein  37.27 
 
 		 150 aa  40.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.157036 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>