10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1814 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1814  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  339  1e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1352  hypothetical protein  58 
 
 		 150 aa  141  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3349  hypothetical protein  56.46 
 
 		 147 aa  114  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.239806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4326  hypothetical protein  39.25 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3614  hypothetical protein  52.78 
 
 		 116 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2446  signal peptide protein  47.06 
 
 		 110 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5730  putative signal peptide protein  38.71 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0909  hypothetical protein  49.06 
 
 		 152 aa  43.9  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1345  putative lipoprotein  38.1 
 
 		 133 aa  42  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4231  hypothetical protein  39.25 
 
 		 118 aa  40.4  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>