29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2910 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2910  signal peptide protein  100 
 
 		 105 aa  207  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0237846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2807  signal peptide protein  83.49 
 
 		 107 aa  100  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3156  putative signal peptide protein  83.49 
 
 		 107 aa  100  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.910812  hitchhiker  0.0019491 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5162  signal peptide protein  51.52 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4655  signal peptide protein  53.75 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.104125 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4523  putative signal peptide protein  53.75 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2446  signal peptide protein  48.05 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5324  hypothetical protein  49.53 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549949 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2211  putative signal peptide protein  41.88 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0042  hypothetical protein  48.24 
 
 		 100 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0046  hypothetical protein  48.24 
 
 		 100 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0024  hypothetical protein  48.24 
 
 		 100 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0024  hypothetical protein  48.86 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79005  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01741  signal peptide protein  60 
 
 		 106 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.95892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0017  hypothetical protein  48.28 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2058  putative signal peptide protein  42.59 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.148493 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1721  hypothetical protein  39.25 
 
 		 93 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169601  hitchhiker  0.0000197195 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4672  hypothetical protein  62.22 
 
 		 94 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.951454  hitchhiker  0.00900362 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1052  hypothetical protein  38.24 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1532  hypothetical protein  38.24 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3209  hypothetical protein  47.13 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1976  hypothetical protein  56.57 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0198719  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1207  hypothetical protein  47.57 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.672501 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1508  hypothetical protein  39 
 
 		 94 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.620222  hitchhiker  0.000360892 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5372  hypothetical protein  38.54 
 
 		 122 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499544 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0109  hypothetical protein  36.51 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0450953  normal  0.554596 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1814  hypothetical protein  44.07 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3825  hypothetical protein  33.73 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.347228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5730  putative signal peptide protein  37.23 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>