36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5324 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5324  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  198  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549949 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5162  signal peptide protein  48.7 
 
 		 111 aa  95.9  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2910  signal peptide protein  50.88 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0237846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2446  signal peptide protein  64.79 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4655  signal peptide protein  55.56 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.104125 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4523  putative signal peptide protein  55.56 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183789  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01741  signal peptide protein  52.38 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.95892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1508  hypothetical protein  41.58 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.620222  hitchhiker  0.000360892 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1721  hypothetical protein  40.38 
 
 		 93 aa  57  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169601  hitchhiker  0.0000197195 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4672  hypothetical protein  44.55 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.951454  hitchhiker  0.00900362 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2807  signal peptide protein  45.83 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3156  putative signal peptide protein  45.83 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.910812  hitchhiker  0.0019491 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1052  hypothetical protein  41.49 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1532  hypothetical protein  41.49 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5177  signal peptide protein  52.73 
 
 		 61 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6011  signal peptide protein  48.31 
 
 		 103 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0046  hypothetical protein  42.11 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0024  hypothetical protein  42.11 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0042  hypothetical protein  42.11 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1352  hypothetical protein  44.71 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0024  hypothetical protein  40.95 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3349  hypothetical protein  43.75 
 
 		 147 aa  47  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.239806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1207  hypothetical protein  67.5 
 
 		 95 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.672501 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0017  hypothetical protein  40.78 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2211  putative signal peptide protein  45.36 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3209  hypothetical protein  38.14 
 
 		 105 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1814  hypothetical protein  43.9 
 
 		 165 aa  45.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2058  putative signal peptide protein  42.71 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.148493 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1037  hypothetical protein  43.24 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0395947  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0128  hypothetical protein  43.24 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000200188  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1767  hypothetical protein  43.24 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0030086  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1800  hypothetical protein  41.1 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00446832  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1779  hypothetical protein  41.1 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00129784  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1955  hypothetical protein  41.1 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00000000252665  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4326  hypothetical protein  44.87 
 
 		 165 aa  41.2  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1345  putative lipoprotein  40.62 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391817  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>