23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1508 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1508  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  186  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.620222  hitchhiker  0.000360892 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1052  hypothetical protein  95.51 
 
 
97 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1532  hypothetical protein  95.51 
 
 
94 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1721  hypothetical protein  87.1 
 
 
93 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169601  hitchhiker  0.0000197195 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4672  hypothetical protein  88.76 
 
 
94 aa  120  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.951454  hitchhiker  0.00900362 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1779  hypothetical protein  68.33 
 
 
93 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00129784  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1800  hypothetical protein  68.33 
 
 
93 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00446832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1955  hypothetical protein  68.33 
 
 
90 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00000000252665  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1767  hypothetical protein  66.13 
 
 
90 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0030086  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0128  hypothetical protein  66.13 
 
 
90 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000200188  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1037  hypothetical protein  66.13 
 
 
90 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0395947  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2531  hypothetical protein  59.09 
 
 
179 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1414  hypothetical protein  77.91 
 
 
93 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575829  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1454  hypothetical protein  76.74 
 
 
93 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.994973  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4655  signal peptide protein  40.24 
 
 
105 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.104125 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4523  putative signal peptide protein  40.24 
 
 
105 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183789  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5162  signal peptide protein  32.69 
 
 
111 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3156  putative signal peptide protein  39.36 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.910812  hitchhiker  0.0019491 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2807  signal peptide protein  39.36 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0909  hypothetical protein  41.56 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0109  hypothetical protein  46.3 
 
 
100 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0450953  normal  0.554596 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2910  signal peptide protein  38.05 
 
 
105 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0237846  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2446  signal peptide protein  45.61 
 
 
110 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>