24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1414 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1414  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  184  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575829  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1454  hypothetical protein  98.92 
 
 		 93 aa  183  8e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.994973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1721  hypothetical protein  81.72 
 
 		 93 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169601  hitchhiker  0.0000197195 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4672  hypothetical protein  85.23 
 
 		 94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.951454  hitchhiker  0.00900362 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1508  hypothetical protein  84.09 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.620222  hitchhiker  0.000360892 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1052  hypothetical protein  82.95 
 
 		 97 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1532  hypothetical protein  82.95 
 
 		 94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1779  hypothetical protein  65 
 
 		 93 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00129784  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1800  hypothetical protein  65 
 
 		 93 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00446832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1955  hypothetical protein  65 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00000000252665  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1767  hypothetical protein  69.35 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0030086  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0128  hypothetical protein  69.35 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000200188  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1037  hypothetical protein  69.35 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0395947  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2531  hypothetical protein  73.17 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5162  signal peptide protein  35.92 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4655  signal peptide protein  38.16 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.104125 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4523  putative signal peptide protein  38.16 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0109  hypothetical protein  53.49 
 
 		 100 aa  47  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0450953  normal  0.554596 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3156  putative signal peptide protein  38.71 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.910812  hitchhiker  0.0019491 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2807  signal peptide protein  38.71 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3825  hypothetical protein  40 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.347228  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2910  signal peptide protein  36.61 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0237846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0909  hypothetical protein  38.96 
 
 		 152 aa  40.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2446  signal peptide protein  53.33 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>