23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4523 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4655  signal peptide protein  100 
 
 		 105 aa  208  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.104125 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4523  putative signal peptide protein  100 
 
 		 105 aa  208  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5162  signal peptide protein  49 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01741  signal peptide protein  60.2 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.95892  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2910  signal peptide protein  42.59 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0237846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0046  hypothetical protein  42 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0024  hypothetical protein  42 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0042  hypothetical protein  42 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6011  signal peptide protein  44.83 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1721  hypothetical protein  35.92 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169601  hitchhiker  0.0000197195 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2807  signal peptide protein  43.68 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3156  putative signal peptide protein  43.68 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.910812  hitchhiker  0.0019491 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0024  hypothetical protein  40.2 
 
 		 101 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0017  hypothetical protein  40 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1052  hypothetical protein  39.18 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5324  hypothetical protein  50.47 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549949 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1532  hypothetical protein  39.18 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4672  hypothetical protein  44.83 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.951454  hitchhiker  0.00900362 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0202  hypothetical protein  40.45 
 
 		 115 aa  44.3  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1207  hypothetical protein  40 
 
 		 95 aa  42.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.672501 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1508  hypothetical protein  40.3 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.620222  hitchhiker  0.000360892 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2531  hypothetical protein  40.85 
 
 		 179 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2446  signal peptide protein  35.24 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>