18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2446 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2446  signal peptide protein  100 
 
 		 110 aa  216  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1352  hypothetical protein  39.68 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5162  signal peptide protein  37.93 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4326  hypothetical protein  42.86 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0202  hypothetical protein  58.23 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0217  hypothetical protein  74.07 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1814  hypothetical protein  47.76 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3349  hypothetical protein  46.58 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.239806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5730  putative signal peptide protein  45.45 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2910  signal peptide protein  43.64 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0237846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1767  hypothetical protein  39.8 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0030086  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0128  hypothetical protein  39.8 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000200188  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1037  hypothetical protein  39.8 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0395947  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1721  hypothetical protein  48.21 
 
 		 93 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169601  hitchhiker  0.0000197195 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1508  hypothetical protein  45.61 
 
 		 94 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.620222  hitchhiker  0.000360892 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3825  hypothetical protein  54.55 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.347228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0109  hypothetical protein  54.55 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0450953  normal  0.554596 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5324  hypothetical protein  57.78 
 
 		 103 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549949 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>