16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0217 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0217  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  222  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0202  hypothetical protein  98.2 
 
 
115 aa  148  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2446  signal peptide protein  67.65 
 
 
110 aa  84.3  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1352  hypothetical protein  51.32 
 
 
150 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5162  signal peptide protein  39.05 
 
 
111 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1721  hypothetical protein  40.87 
 
 
93 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169601  hitchhiker  0.0000197195 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4523  putative signal peptide protein  44.16 
 
 
105 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183789  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4655  signal peptide protein  44.16 
 
 
105 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.104125 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1052  hypothetical protein  50.88 
 
 
97 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1532  hypothetical protein  50.88 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3349  hypothetical protein  37.37 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.239806  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1508  hypothetical protein  50.88 
 
 
94 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.620222  hitchhiker  0.000360892 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1814  hypothetical protein  45.21 
 
 
165 aa  44.7  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4672  hypothetical protein  52.73 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.951454  hitchhiker  0.00900362 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4326  hypothetical protein  45.76 
 
 
165 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3825  hypothetical protein  51.61 
 
 
103 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.347228  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>