23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0202 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0202  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  231  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0217  hypothetical protein  98.2 
 
 
111 aa  135  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2446  signal peptide protein  67.65 
 
 
110 aa  84.3  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1352  hypothetical protein  51.32 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1721  hypothetical protein  40.71 
 
 
93 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169601  hitchhiker  0.0000197195 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4655  signal peptide protein  41.98 
 
 
105 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.104125 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4523  putative signal peptide protein  41.98 
 
 
105 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183789  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5162  signal peptide protein  39.62 
 
 
111 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3349  hypothetical protein  38.54 
 
 
147 aa  47  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.239806  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1052  hypothetical protein  50.88 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1532  hypothetical protein  50.88 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1508  hypothetical protein  50.88 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.620222  hitchhiker  0.000360892 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4326  hypothetical protein  40.54 
 
 
165 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1814  hypothetical protein  43.04 
 
 
165 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4672  hypothetical protein  60.47 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.951454  hitchhiker  0.00900362 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1779  hypothetical protein  43.48 
 
 
93 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00129784  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1800  hypothetical protein  43.48 
 
 
93 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00446832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1955  hypothetical protein  43.48 
 
 
90 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00000000252665  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3825  hypothetical protein  51.61 
 
 
103 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.347228  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1767  hypothetical protein  43.66 
 
 
90 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0030086  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0128  hypothetical protein  43.66 
 
 
90 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000200188  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1037  hypothetical protein  43.66 
 
 
90 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0395947  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0109  hypothetical protein  51.61 
 
 
100 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0450953  normal  0.554596 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>