21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4672 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4672  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  186  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.951454  hitchhiker  0.00900362 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1721  hypothetical protein  84.95 
 
 
93 aa  123  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169601  hitchhiker  0.0000197195 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1508  hypothetical protein  88.76 
 
 
94 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.620222  hitchhiker  0.000360892 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1052  hypothetical protein  87.64 
 
 
97 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1532  hypothetical protein  87.64 
 
 
94 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1800  hypothetical protein  68.33 
 
 
93 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00446832  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1779  hypothetical protein  68.33 
 
 
93 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00129784  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1955  hypothetical protein  68.33 
 
 
90 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00000000252665  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0128  hypothetical protein  66.13 
 
 
90 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000200188  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1037  hypothetical protein  66.13 
 
 
90 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0395947  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1767  hypothetical protein  66.13 
 
 
90 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0030086  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1414  hypothetical protein  76.74 
 
 
93 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575829  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1454  hypothetical protein  75.58 
 
 
93 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.994973  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2531  hypothetical protein  59.7 
 
 
179 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4523  putative signal peptide protein  41.89 
 
 
105 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183789  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4655  signal peptide protein  41.89 
 
 
105 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.104125 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5162  signal peptide protein  34.74 
 
 
111 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0109  hypothetical protein  47.27 
 
 
100 aa  43.5  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0450953  normal  0.554596 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3156  putative signal peptide protein  43.53 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.910812  hitchhiker  0.0019491 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2807  signal peptide protein  43.53 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0909  hypothetical protein  40.26 
 
 
152 aa  40  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>