26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6011 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6011  signal peptide protein  100 
 
 		 103 aa  200  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5162  signal peptide protein  57.02 
 
 		 111 aa  110  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4655  signal peptide protein  65.33 
 
 		 105 aa  87.4  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.104125 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4523  putative signal peptide protein  65.33 
 
 		 105 aa  87.4  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5324  hypothetical protein  53.15 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549949 
 
 
-
 
NC_003296  RS01741  signal peptide protein  64.86 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.95892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0046  hypothetical protein  53.33 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0024  hypothetical protein  53.33 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0042  hypothetical protein  53.33 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0024  hypothetical protein  47.67 
 
 		 101 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0017  hypothetical protein  47.62 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2910  signal peptide protein  47.12 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0237846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5177  signal peptide protein  56.9 
 
 		 61 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1721  hypothetical protein  37.25 
 
 		 93 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169601  hitchhiker  0.0000197195 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1207  hypothetical protein  62.26 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.672501 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2446  signal peptide protein  45.71 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1052  hypothetical protein  37.89 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1532  hypothetical protein  37.89 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1508  hypothetical protein  35 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.620222  hitchhiker  0.000360892 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3209  hypothetical protein  45.33 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4672  hypothetical protein  37.36 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.951454  hitchhiker  0.00900362 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3156  putative signal peptide protein  43.68 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.910812  hitchhiker  0.0019491 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2807  signal peptide protein  43.68 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1800  hypothetical protein  36.84 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00446832  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1779  hypothetical protein  36.84 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00129784  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1955  hypothetical protein  36.84 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00000000252665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>