34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2211 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2211  putative signal peptide protein  100 
 
 
129 aa  253  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2058  putative signal peptide protein  88 
 
 
126 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.148493 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5162  signal peptide protein  38.66 
 
 
111 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1976  hypothetical protein  44.86 
 
 
116 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0198719  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2910  signal peptide protein  44.23 
 
 
105 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0237846  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2220  hypothetical protein  45.36 
 
 
98 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5372  hypothetical protein  36.43 
 
 
122 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499544 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2495  hypothetical protein  41.75 
 
 
117 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4829  hypothetical protein  38.46 
 
 
122 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851561  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1606  hypothetical protein  71.43 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.133632  normal  0.1453 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1151  hypothetical protein  71.43 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0417959  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3767  hypothetical protein  43.16 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00933749  hitchhiker  0.00116407 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3241  hypothetical protein  43.16 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0533756 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1631  hypothetical protein  71.43 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.638858  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4777  hypothetical protein  65.52 
 
 
105 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.447875  normal  0.18704 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0854  hypothetical protein  41.86 
 
 
94 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317726  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2549  hypothetical protein  41.86 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.309397  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1607  hypothetical protein  57.89 
 
 
75 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00747509 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2637  hypothetical protein  41.67 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2112  hypothetical protein  41.67 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25728  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3202  hypothetical protein  41.67 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152158  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1609  hypothetical protein  41.67 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0210429  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2549  hypothetical protein  41.67 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1385  hypothetical protein  41.67 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0245118  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0603  hypothetical protein  34.78 
 
 
168 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.131447  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6990  hypothetical protein  39.53 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.600513  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3156  putative signal peptide protein  42.7 
 
 
107 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.910812  hitchhiker  0.0019491 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2807  signal peptide protein  42.7 
 
 
107 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1213  hypothetical protein  41.35 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.43875 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1528  hypothetical protein  65.38 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386359  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1385  hypothetical protein  45.78 
 
 
112 aa  40.4  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0965478  normal  0.615751 
 
 
-
 
NC_003296  RS01741  signal peptide protein  40 
 
 
106 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.95892  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2315  putative lipoprotein  56.76 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2095  hypothetical protein  54 
 
 
126 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.775217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>