36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0256 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0256  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  214  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1976  hypothetical protein  56.25 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0198719  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5372  hypothetical protein  57.41 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499544 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2495  hypothetical protein  71.05 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1609  hypothetical protein  65.91 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0210429  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2549  hypothetical protein  65.91 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3202  hypothetical protein  65.91 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152158  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2112  hypothetical protein  65.91 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25728  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1385  hypothetical protein  65.91 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0245118  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2637  hypothetical protein  65.91 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2082  hypothetical protein  51.72 
 
 		 118 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2095  hypothetical protein  56.31 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.775217  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6014  hypothetical protein  51.72 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.810245  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2063  hypothetical protein  51.72 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.227781  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1965  hypothetical protein  55.34 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2446  signal peptide protein  54.29 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1213  hypothetical protein  52.68 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.43875 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2503  hypothetical protein  70.97 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00769616  hitchhiker  0.00377548 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1634  hypothetical protein  69.23 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.101283  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3767  hypothetical protein  54.84 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00933749  hitchhiker  0.00116407 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3241  hypothetical protein  54.84 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0533756 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2910  signal peptide protein  50 
 
 		 105 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0237846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4523  putative signal peptide protein  40.86 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4655  signal peptide protein  40.86 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.104125 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5747  hypothetical protein  56.18 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.970267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6990  hypothetical protein  50.91 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.600513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5162  signal peptide protein  33.04 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4829  hypothetical protein  61.54 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1385  hypothetical protein  53.85 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0965478  normal  0.615751 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1532  hypothetical protein  51.79 
 
 		 94 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1052  hypothetical protein  51.79 
 
 		 97 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2058  putative signal peptide protein  34.95 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.148493 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4310  hypothetical protein  44.68 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6900  hypothetical protein  46.51 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.451962  normal  0.412976 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2945  hypothetical protein  46.51 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0587422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4777  hypothetical protein  58.33 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.447875  normal  0.18704 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>