49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4495 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4495  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  362  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.408857  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3870  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  362  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0956849  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3657  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.583235  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3241  hypothetical protein  78.57 
 
 
92 aa  144  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0533756 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3767  hypothetical protein  78.57 
 
 
92 aa  144  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00933749  hitchhiker  0.00116407 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2220  hypothetical protein  76.53 
 
 
98 aa  137  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4829  hypothetical protein  70.25 
 
 
122 aa  135  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851561  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0854  hypothetical protein  60.2 
 
 
94 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317726  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2549  hypothetical protein  58.16 
 
 
94 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.309397  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0603  hypothetical protein  61.86 
 
 
168 aa  97.4  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.131447  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0351  hypothetical protein  60.2 
 
 
94 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1498  hypothetical protein  60.2 
 
 
94 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1694  hypothetical protein  60.2 
 
 
94 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.54167  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0317  hypothetical protein  60.2 
 
 
94 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2406  hypothetical protein  59.18 
 
 
94 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1606  hypothetical protein  53.19 
 
 
83 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.133632  normal  0.1453 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4777  hypothetical protein  55.56 
 
 
105 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.447875  normal  0.18704 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1607  hypothetical protein  49.12 
 
 
75 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00747509 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1976  hypothetical protein  58.62 
 
 
116 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0198719  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2058  putative signal peptide protein  40.86 
 
 
126 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.148493 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2211  putative signal peptide protein  45.16 
 
 
129 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1528  hypothetical protein  51.06 
 
 
83 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386359  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1151  hypothetical protein  53.19 
 
 
75 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0417959  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1631  hypothetical protein  53.19 
 
 
75 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.638858  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5372  hypothetical protein  68.29 
 
 
122 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499544 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6990  hypothetical protein  42.67 
 
 
93 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.600513  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2495  hypothetical protein  56.86 
 
 
117 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1965  hypothetical protein  56.82 
 
 
119 aa  52  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1385  hypothetical protein  55.77 
 
 
117 aa  51.6  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0245118  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2549  hypothetical protein  55.77 
 
 
117 aa  51.6  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3202  hypothetical protein  55.77 
 
 
117 aa  51.6  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152158  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2112  hypothetical protein  55.77 
 
 
117 aa  51.6  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25728  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2637  hypothetical protein  55.77 
 
 
117 aa  51.6  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1609  hypothetical protein  55.77 
 
 
117 aa  51.6  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0210429  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4310  hypothetical protein  39.36 
 
 
92 aa  50.8  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2503  hypothetical protein  54.55 
 
 
115 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00769616  hitchhiker  0.00377548 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2095  hypothetical protein  68.75 
 
 
126 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.775217  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1213  hypothetical protein  65.62 
 
 
109 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.43875 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2218  signal peptide protein  33.59 
 
 
133 aa  48.9  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.433266  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2082  hypothetical protein  54.55 
 
 
118 aa  48.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2063  hypothetical protein  72 
 
 
118 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.227781  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6014  hypothetical protein  72 
 
 
118 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.810245  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2315  putative lipoprotein  81.82 
 
 
97 aa  47  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1634  hypothetical protein  68 
 
 
115 aa  45.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.101283  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1385  hypothetical protein  51.81 
 
 
112 aa  45.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0965478  normal  0.615751 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2910  signal peptide protein  41.58 
 
 
105 aa  44.7  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0237846  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2945  hypothetical protein  38.67 
 
 
99 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0587422  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5162  signal peptide protein  35.11 
 
 
111 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6900  hypothetical protein  37.33 
 
 
99 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.451962  normal  0.412976 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>