49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3657 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4495  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  198  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.408857  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3870  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  198  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0956849  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3657  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  193  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.583235  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3241  hypothetical protein  78.57 
 
 
92 aa  140  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0533756 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3767  hypothetical protein  78.57 
 
 
92 aa  140  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00933749  hitchhiker  0.00116407 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2220  hypothetical protein  76.53 
 
 
98 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4829  hypothetical protein  83.16 
 
 
122 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851561  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0854  hypothetical protein  60.2 
 
 
94 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317726  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2549  hypothetical protein  58.16 
 
 
94 aa  103  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.309397  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0603  hypothetical protein  60.64 
 
 
168 aa  89.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.131447  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0351  hypothetical protein  60.2 
 
 
94 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1498  hypothetical protein  60.2 
 
 
94 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1694  hypothetical protein  60.2 
 
 
94 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.54167  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0317  hypothetical protein  60.2 
 
 
94 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2406  hypothetical protein  59.18 
 
 
94 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1606  hypothetical protein  53.19 
 
 
83 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.133632  normal  0.1453 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4777  hypothetical protein  47.27 
 
 
105 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.447875  normal  0.18704 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1607  hypothetical protein  49.12 
 
 
75 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00747509 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1976  hypothetical protein  53.45 
 
 
116 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0198719  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1631  hypothetical protein  53.19 
 
 
75 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.638858  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1151  hypothetical protein  53.19 
 
 
75 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0417959  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1528  hypothetical protein  51.06 
 
 
83 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386359  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2058  putative signal peptide protein  43.53 
 
 
126 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.148493 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2211  putative signal peptide protein  46.51 
 
 
129 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5372  hypothetical protein  62.5 
 
 
122 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499544 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6990  hypothetical protein  42.67 
 
 
93 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.600513  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1965  hypothetical protein  55.56 
 
 
119 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2495  hypothetical protein  52 
 
 
117 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1385  hypothetical protein  50.98 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0245118  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2112  hypothetical protein  50.98 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25728  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3202  hypothetical protein  50.98 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152158  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2637  hypothetical protein  50.98 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2549  hypothetical protein  50.98 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1609  hypothetical protein  50.98 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0210429  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2503  hypothetical protein  53.33 
 
 
115 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00769616  hitchhiker  0.00377548 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2095  hypothetical protein  68.75 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.775217  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1213  hypothetical protein  65.62 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.43875 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4310  hypothetical protein  41.77 
 
 
92 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2218  signal peptide protein  33.59 
 
 
133 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.433266  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2082  hypothetical protein  65.62 
 
 
118 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2063  hypothetical protein  72 
 
 
118 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.227781  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6014  hypothetical protein  72 
 
 
118 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.810245  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2315  putative lipoprotein  85 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1634  hypothetical protein  68 
 
 
115 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.101283  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1385  hypothetical protein  51.81 
 
 
112 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0965478  normal  0.615751 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2910  signal peptide protein  41.58 
 
 
105 aa  43.9  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0237846  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2945  hypothetical protein  40 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0587422  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5162  signal peptide protein  35.11 
 
 
111 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6900  hypothetical protein  38.57 
 
 
99 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.451962  normal  0.412976 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>